More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SERP1327 on replicon NC_002976
Organism: Staphylococcus epidermidis RP62A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP1327  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 210 aa  422  1e-117  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.254294  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1857  riboflavin synthase subunit alpha  77.62 
 
 		 210 aa  338  5e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1822  riboflavin synthase subunit alpha  77.62 
 
 		 210 aa  338  5e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.295003  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  48.13 
 
 		 215 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  45.07 
 
 		 214 aa  188  5e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  45.25 
 
 		 217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 214 aa  179  2e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  42.25 
 
 		 214 aa  175  5e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 		 214 aa  174  6e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 226 aa  173  1.9999999999999998e-42  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  42.4 
 
 		 218 aa  167  9e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.59 
 
 		 216 aa  167  1e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  40.36 
 
 		 223 aa  166  2e-40  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  39.72 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  39.35 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  44.79 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 218 aa  158  6e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  39.35 
 
 		 217 aa  158  7e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 216 aa  157  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 217 aa  156  2e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  40.5 
 
 		 220 aa  155  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 221 aa  155  5.0000000000000005e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  41.4 
 
 		 215 aa  155  6e-37  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 		 214 aa  153  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  41.31 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 203 aa  153  2e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  39.7 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  39.81 
 
 		 211 aa  153  2e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  41.31 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  41.78 
 
 		 214 aa  153  2e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 193 aa  152  4e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  39.59 
 
 		 196 aa  152  4e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  40.7 
 
 		 201 aa  151  5.9999999999999996e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  40.89 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  41.5 
 
 		 205 aa  150  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 203 aa  149  3e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  42.21 
 
 		 201 aa  149  4e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  41.15 
 
 		 204 aa  147  9e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  36.11 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 		 222 aa  147  1.0000000000000001e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  36.11 
 
 		 218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  39 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  40.82 
 
 		 215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  43 
 
 		 201 aa  146  2.0000000000000003e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  38.86 
 
 		 198 aa  145  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  36.11 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  38.16 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  36.55 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  39.11 
 
 		 205 aa  145  6e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  37.21 
 
 		 217 aa  144  7.0000000000000006e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  39.05 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 187 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 192 aa  143  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  38.97 
 
 		 216 aa  143  2e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.86 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  42 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  36.92 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  41.84 
 
 		 207 aa  142  3e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 203 aa  142  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0301  riboflavin synthase subunit alpha  36.45 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.769715 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  37.31 
 
 		 211 aa  142  3e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  43.07 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  37.81 
 
 		 239 aa  142  5e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  37.11 
 
 		 202 aa  141  9e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  37.79 
 
 		 217 aa  141  9e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 203 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 203 aa  141  9e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  36.79 
 
 		 213 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  37.62 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  39.3 
 
 		 204 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  37.5 
 
 		 208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 219 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  35.35 
 
 		 216 aa  140  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  38.01 
 
 		 223 aa  139  1.9999999999999998e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  39.61 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 209 aa  139  3e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  41.44 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  40.99 
 
 		 217 aa  139  3e-32  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0563  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 192 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  40.5 
 
 		 205 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  36.45 
 
 		 215 aa  139  3.9999999999999997e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  34.02 
 
 		 217 aa  138  6e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  39 
 
 		 210 aa  138  6e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  36.57 
 
 		 218 aa  138  6e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  37.14 
 
 		 251 aa  138  7e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>