More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1886 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 218 aa  439  9.999999999999999e-123  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  79.36 
 
 		 218 aa  346  1e-94  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  73.52 
 
 		 219 aa  319  1.9999999999999998e-86  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  71.36 
 
 		 219 aa  310  7.999999999999999e-84  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  72.02 
 
 		 217 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  60.09 
 
 		 218 aa  268  5.9999999999999995e-71  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  59.17 
 
 		 218 aa  263  2e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  49.28 
 
 		 212 aa  175  4e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 220 aa  172  2.9999999999999996e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  44.09 
 
 		 218 aa  170  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  48.72 
 
 		 216 aa  168  5e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  44.14 
 
 		 220 aa  164  9e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 		 216 aa  164  1.0000000000000001e-39  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 224 aa  164  1.0000000000000001e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  41.74 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  41.74 
 
 		 218 aa  164  1.0000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.66 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  44.9 
 
 		 200 aa  162  3e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  43.78 
 
 		 198 aa  162  5.0000000000000005e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  41.96 
 
 		 220 aa  162  5.0000000000000005e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.83 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  47.18 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 196 aa  159  3e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  46.67 
 
 		 197 aa  159  4e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  43.65 
 
 		 194 aa  158  5e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  45.08 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  36.99 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  35.85 
 
 		 210 aa  157  2e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  43.08 
 
 		 216 aa  156  3e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  40.99 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 220 aa  155  6e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  36.7 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 230 aa  153  2e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  35.14 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  37.67 
 
 		 217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  36.53 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  41.33 
 
 		 213 aa  151  7e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  39.37 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 224 aa  149  3e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 215 aa  149  4e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  41.58 
 
 		 210 aa  149  4e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 218 aa  149  5e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 		 223 aa  148  6e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 217 aa  148  6e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 223 aa  148  8e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  37.61 
 
 		 219 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  41.45 
 
 		 201 aa  147  1.0000000000000001e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  38.18 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  40.82 
 
 		 196 aa  145  3e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  43.59 
 
 		 199 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 218 aa  145  3e-34  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 219 aa  145  4.0000000000000006e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  37.84 
 
 		 221 aa  145  6e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 195 aa  144  8.000000000000001e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  37.9 
 
 		 219 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  38.36 
 
 		 216 aa  144  9e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 197 aa  144  9e-34  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 217 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  40 
 
 		 227 aa  144  1e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  40 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  40.49 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  41.59 
 
 		 222 aa  144  1e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 221 aa  144  1e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  42.71 
 
 		 202 aa  144  1e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  45.4 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1327  riboflavin synthase subunit alpha  38.99 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.254294  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 200 aa  144  2e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 203 aa  143  2e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 229 aa  143  2e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  38.86 
 
 		 211 aa  143  2e-33  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>