More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene DvMF_3094 on replicon NC_011769
Organism: Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 230 aa  471  1e-132  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  65.65 
 
 		 224 aa  310  2e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  66.96 
 
 		 220 aa  305  6e-82  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  60.43 
 
 		 218 aa  280  2e-74  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  59.57 
 
 		 224 aa  271  5.000000000000001e-72  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  56.96 
 
 		 220 aa  259  2e-68  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  44.78 
 
 		 216 aa  181  9.000000000000001e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  45.26 
 
 		 220 aa  180  1e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 214 aa  180  2e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 214 aa  179  4e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  43.04 
 
 		 220 aa  178  7e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 217 aa  174  9.999999999999999e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 213 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  46.53 
 
 		 200 aa  170  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 196 aa  170  2e-41  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  37.39 
 
 		 217 aa  169  4e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  41.13 
 
 		 216 aa  169  5e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  37.39 
 
 		 217 aa  167  8e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  46.77 
 
 		 200 aa  166  2e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 215 aa  165  5e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 198 aa  164  9e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  38.96 
 
 		 221 aa  164  9e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 198 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  41.3 
 
 		 213 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  37.83 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  42.74 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  40.87 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  38.96 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  39.57 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  46.04 
 
 		 196 aa  160  2e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  41.56 
 
 		 217 aa  159  4e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 223 aa  159  4e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  41.3 
 
 		 216 aa  159  5e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  40.52 
 
 		 219 aa  157  9e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 198 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  43.12 
 
 		 223 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 		 227 aa  157  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  39.66 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  44.17 
 
 		 208 aa  156  2e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  41.38 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  39.66 
 
 		 218 aa  155  7e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4646  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 202 aa  154  9e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal  0.264101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  44.39 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  36.52 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  42.06 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 201 aa  154  1e-36  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  36.09 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  42.64 
 
 		 207 aa  154  1e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  38.79 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  40.52 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 210 aa  152  2.9999999999999998e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  44.78 
 
 		 197 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 202 aa  152  4e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  39.22 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  40.34 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  42.31 
 
 		 207 aa  152  4e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  38.36 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 219 aa  152  5e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2674  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 202 aa  152  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00828025  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  37.83 
 
 		 223 aa  152  5e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  41.51 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  35.06 
 
 		 217 aa  151  7e-36  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  44.78 
 
 		 204 aa  151  7e-36  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 218 aa  151  7e-36  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 206 aa  151  8e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 		 201 aa  151  8.999999999999999e-36  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 205 aa  151  8.999999999999999e-36  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 217 aa  151  8.999999999999999e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2637  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23993  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  34.78 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  41.71 
 
 		 207 aa  150  2e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  38.96 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  38.96 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 221 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  46.11 
 
 		 212 aa  150  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  38.96 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 221 aa  150  2e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  41.56 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  41.56 
 
 		 218 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 		 205 aa  149  4e-35  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  37.93 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  38.96 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  35.93 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  35.22 
 
 		 214 aa  148  7e-35  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  39.22 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>