More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bind_1227 on replicon NC_010581
Organism: Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 202 aa  410  1e-114  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  71.29 
 
 		 207 aa  297  6e-80  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  61.95 
 
 		 207 aa  246  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2637  riboflavin synthase subunit alpha  61.39 
 
 		 202 aa  246  1e-64  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23993  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  63.94 
 
 		 213 aa  246  1e-64  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  59.9 
 
 		 202 aa  244  6.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3101  riboflavin synthase, alpha subunit  62.38 
 
 		 211 aa  241  7e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905036  decreased coverage  0.00949736 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1817  riboflavin synthase subunit alpha  58.91 
 
 		 202 aa  240  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35102  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  61.06 
 
 		 212 aa  238  5.999999999999999e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  59.62 
 
 		 212 aa  236  2e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  60.1 
 
 		 212 aa  234  5.0000000000000005e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2674  riboflavin synthase subunit alpha  58.42 
 
 		 202 aa  234  6e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00828025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  59 
 
 		 203 aa  233  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  59.5 
 
 		 200 aa  232  2.0000000000000002e-60  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1724  riboflavin synthase subunit alpha  59.31 
 
 		 209 aa  230  8.000000000000001e-60  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.455199  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4646  riboflavin synthase subunit alpha  57.92 
 
 		 202 aa  227  8e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal  0.264101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  59.9 
 
 		 197 aa  227  9e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  56.93 
 
 		 202 aa  222  3e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  57 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  56.5 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  58 
 
 		 204 aa  219  1.9999999999999999e-56  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  56.5 
 
 		 196 aa  218  3.9999999999999997e-56  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  55.5 
 
 		 202 aa  218  5e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  56.22 
 
 		 198 aa  213  9.999999999999999e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  56.22 
 
 		 198 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  55.94 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  53.5 
 
 		 203 aa  211  5.999999999999999e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0819  riboflavin synthase subunit alpha  56 
 
 		 206 aa  211  5.999999999999999e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.311255 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  56.22 
 
 		 198 aa  209  2e-53  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  54 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  53.54 
 
 		 205 aa  205  4e-52  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  52.66 
 
 		 201 aa  203  1e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  51.22 
 
 		 205 aa  199  1.9999999999999998e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  53.11 
 
 		 208 aa  199  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  52.53 
 
 		 196 aa  194  5.000000000000001e-49  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 205 aa  186  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 		 207 aa  186  3e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  47.52 
 
 		 201 aa  179  2e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  47.14 
 
 		 204 aa  179  4e-44  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 219 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  47.47 
 
 		 216 aa  171  5e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  48.76 
 
 		 215 aa  171  5.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  49.01 
 
 		 209 aa  169  3e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 217 aa  167  9e-41  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 214 aa  166  1e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 214 aa  167  1e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  45.23 
 
 		 200 aa  164  8e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  48.5 
 
 		 215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 202 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 		 215 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  44.5 
 
 		 199 aa  161  7e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.24 
 
 		 220 aa  159  3e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 215 aa  158  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 220 aa  158  4e-38  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 221 aa  158  5e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 200 aa  157  7e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 208 aa  157  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  43.6 
 
 		 232 aa  156  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  44.22 
 
 		 216 aa  156  2e-37  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 219 aa  156  2e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 213 aa  155  4e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 216 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  45.23 
 
 		 202 aa  154  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  45.77 
 
 		 218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 215 aa  151  5e-36  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 219 aa  150  8.999999999999999e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  41.92 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  42.42 
 
 		 213 aa  149  2e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  44.28 
 
 		 227 aa  149  3e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 221 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 221 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  43.07 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  43.07 
 
 		 218 aa  149  4e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 221 aa  148  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 201 aa  148  5e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 220 aa  148  5e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 220 aa  147  7e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 218 aa  148  7e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  41.21 
 
 		 218 aa  147  8e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 197 aa  147  1.0000000000000001e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  45.19 
 
 		 205 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 226 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  42.79 
 
 		 199 aa  145  3e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>