More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3491 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 		 212 aa  418  1e-116  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  98.11 
 
 		 212 aa  412  1e-114  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  93.81 
 
 		 212 aa  395  1e-109  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  78.26 
 
 		 207 aa  318  3e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  77.18 
 
 		 213 aa  317  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3101  riboflavin synthase, alpha subunit  74 
 
 		 211 aa  295  3e-79  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905036  decreased coverage  0.00949736 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  62.93 
 
 		 207 aa  240  9e-63  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  60.1 
 
 		 202 aa  234  6e-61  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  56.25 
 
 		 202 aa  225  3e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  55.77 
 
 		 202 aa  224  1e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  58.25 
 
 		 203 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  59.71 
 
 		 203 aa  222  3e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  56.8 
 
 		 203 aa  221  4e-57  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  55.77 
 
 		 202 aa  221  7e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0819  riboflavin synthase subunit alpha  56.31 
 
 		 206 aa  214  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.311255 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  56.31 
 
 		 204 aa  213  9.999999999999999e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  55.98 
 
 		 204 aa  207  1e-52  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  54.15 
 
 		 201 aa  204  5e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  53.11 
 
 		 202 aa  203  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  55.29 
 
 		 196 aa  203  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4646  riboflavin synthase subunit alpha  54.98 
 
 		 202 aa  202  3e-51  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal  0.264101 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  54.15 
 
 		 200 aa  201  5e-51  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  54.59 
 
 		 198 aa  199  3e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  54.59 
 
 		 198 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2637  riboflavin synthase subunit alpha  54.07 
 
 		 202 aa  196  3e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23993  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1817  riboflavin synthase subunit alpha  51.67 
 
 		 202 aa  194  7e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35102  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  53.11 
 
 		 202 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  53.59 
 
 		 197 aa  192  2e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  50.47 
 
 		 208 aa  192  3e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1724  riboflavin synthase subunit alpha  52.17 
 
 		 209 aa  191  9e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.455199  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2674  riboflavin synthase subunit alpha  51.67 
 
 		 202 aa  191  1e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00828025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  50.7 
 
 		 201 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  52.66 
 
 		 198 aa  188  5.999999999999999e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  51.44 
 
 		 205 aa  187  8e-47  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  48.08 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  49.27 
 
 		 196 aa  186  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  47.89 
 
 		 204 aa  174  7e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 		 205 aa  172  1.9999999999999998e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  47.85 
 
 		 215 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 		 207 aa  171  7.999999999999999e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  49.04 
 
 		 219 aa  167  1e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  45.1 
 
 		 221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  48.83 
 
 		 215 aa  164  8e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  45.59 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  47.85 
 
 		 209 aa  163  1.0000000000000001e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  48.36 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  48.36 
 
 		 215 aa  163  2.0000000000000002e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  47.06 
 
 		 219 aa  162  3e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 199 aa  162  4.0000000000000004e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 219 aa  161  6e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  46.08 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  44.66 
 
 		 202 aa  160  2e-38  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  44.93 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  44.93 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  47.09 
 
 		 220 aa  159  2e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  46.31 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  45.1 
 
 		 221 aa  158  6e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 221 aa  157  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 217 aa  155  3e-37  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  45.02 
 
 		 199 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  45.1 
 
 		 220 aa  155  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  45.1 
 
 		 197 aa  155  6e-37  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  44.17 
 
 		 201 aa  154  7e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 219 aa  154  8e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  43.41 
 
 		 200 aa  154  8e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 220 aa  153  1e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  45.85 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 216 aa  153  2e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  42.16 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  37.25 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  46.6 
 
 		 227 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 217 aa  151  5.9999999999999996e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  45.37 
 
 		 218 aa  151  5.9999999999999996e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  38.25 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  41.04 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  39.15 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 199 aa  149  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  41.35 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  37.93 
 
 		 217 aa  148  5e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  42.79 
 
 		 202 aa  147  9e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 208 aa  147  1.0000000000000001e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 226 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  42.58 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  45.07 
 
 		 210 aa  146  2.0000000000000003e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 		 218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 222 aa  146  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  41.15 
 
 		 200 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  43.87 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>