More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NSE_0853 on replicon NC_007798
Organism: Neorickettsia sennetsu str. Miyayama



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 200 aa  406  1.0000000000000001e-112  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  46.46 
 
 		 227 aa  166  1e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  42.49 
 
 		 217 aa  164  5.9999999999999996e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 200 aa  164  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0239  riboflavin synthase subunit alpha  38.69 
 
 		 202 aa  162  4.0000000000000004e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 		 196 aa  160  1e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  42.5 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  42.71 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  42.71 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 214 aa  159  3e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 214 aa  159  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 215 aa  157  9e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  41.62 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  44.1 
 
 		 219 aa  155  3e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 197 aa  155  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  42.27 
 
 		 211 aa  155  4e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 215 aa  155  4e-37  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 202 aa  154  1e-36  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 		 218 aa  153  2e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0773  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 202 aa  152  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 202 aa  153  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 217 aa  152  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 		 204 aa  153  2e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 220 aa  152  2e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  44.06 
 
 		 202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0130  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 198 aa  151  5.9999999999999996e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0226834  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 203 aa  150  8.999999999999999e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 215 aa  150  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 216 aa  150  1e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 221 aa  150  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  38.54 
 
 		 212 aa  150  1e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  37.82 
 
 		 217 aa  150  1e-35  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  41.15 
 
 		 213 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  38.54 
 
 		 212 aa  148  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  37.2 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 210 aa  148  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  41.18 
 
 		 207 aa  147  7e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  42.78 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  39.69 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  41.03 
 
 		 202 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  39.58 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 221 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  41.09 
 
 		 203 aa  145  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 221 aa  145  4.0000000000000006e-34  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 198 aa  145  5e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  37.63 
 
 		 200 aa  145  5e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  38.54 
 
 		 212 aa  145  5e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  39.32 
 
 		 205 aa  144  7.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 198 aa  144  8.000000000000001e-34  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 		 215 aa  144  9e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  40.67 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  40.3 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  39.58 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 		 198 aa  143  1e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  39.3 
 
 		 200 aa  144  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 		 204 aa  144  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  41.75 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  42.27 
 
 		 220 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  42.78 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 220 aa  142  3e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 218 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 200 aa  142  3e-33  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 		 215 aa  142  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  40.4 
 
 		 197 aa  141  5e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 216 aa  141  5e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 218 aa  141  7e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  43.29 
 
 		 187 aa  141  8e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  35.75 
 
 		 220 aa  141  8e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  38.65 
 
 		 217 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  38.65 
 
 		 217 aa  140  9e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  39.49 
 
 		 219 aa  140  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  39.59 
 
 		 205 aa  140  9.999999999999999e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  38.89 
 
 		 198 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  37.11 
 
 		 199 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 		 211 aa  140  9.999999999999999e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 196 aa  140  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  41.84 
 
 		 218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  41 
 
 		 202 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>