More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0758 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 198 aa  394  1e-109  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  99.49 
 
 		 198 aa  393  1e-109  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  90.91 
 
 		 198 aa  358  2e-98  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  72.22 
 
 		 200 aa  286  1e-76  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  72.08 
 
 		 196 aa  283  1.0000000000000001e-75  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  71.78 
 
 		 201 aa  280  9e-75  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  69.19 
 
 		 197 aa  271  4.0000000000000004e-72  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  63.92 
 
 		 196 aa  247  7e-65  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  60.29 
 
 		 208 aa  238  5.999999999999999e-62  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  56.93 
 
 		 205 aa  222  3e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  58.33 
 
 		 205 aa  221  4.9999999999999996e-57  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  58 
 
 		 202 aa  220  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  57.5 
 
 		 202 aa  219  1.9999999999999999e-56  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  58.21 
 
 		 202 aa  218  3.9999999999999997e-56  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  56.5 
 
 		 203 aa  218  5e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  57.5 
 
 		 203 aa  217  7.999999999999999e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0819  riboflavin synthase subunit alpha  58.13 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.311255 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  57.64 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  58 
 
 		 204 aa  214  9e-55  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  56.22 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  57 
 
 		 204 aa  213  9.999999999999999e-55  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  55.39 
 
 		 207 aa  213  1.9999999999999998e-54  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  55.5 
 
 		 203 aa  209  3e-53  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  54.5 
 
 		 207 aa  206  2e-52  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  55.07 
 
 		 212 aa  205  5e-52  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  56.1 
 
 		 207 aa  203  1e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  54.59 
 
 		 212 aa  201  6e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  54.59 
 
 		 212 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  51.5 
 
 		 205 aa  198  3.9999999999999996e-50  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4646  riboflavin synthase subunit alpha  54.73 
 
 		 202 aa  195  4.0000000000000005e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal  0.264101 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  52.74 
 
 		 202 aa  194  9e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  53.88 
 
 		 213 aa  193  1e-48  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1817  riboflavin synthase subunit alpha  51.74 
 
 		 202 aa  189  2e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35102  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  53.2 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3101  riboflavin synthase, alpha subunit  54.5 
 
 		 211 aa  187  1e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905036  decreased coverage  0.00949736 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2637  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 202 aa  186  1e-46  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23993  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2674  riboflavin synthase subunit alpha  51.74 
 
 		 202 aa  185  4e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00828025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 201 aa  185  5e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  52.55 
 
 		 227 aa  183  1.0000000000000001e-45  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  52.24 
 
 		 202 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1724  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 209 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.455199  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  49.75 
 
 		 199 aa  182  3e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  51.02 
 
 		 220 aa  182  3e-45  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 201 aa  176  1e-43  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 		 220 aa  175  3e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  49.03 
 
 		 209 aa  174  9e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 220 aa  173  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  51.02 
 
 		 221 aa  172  1.9999999999999998e-42  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 		 221 aa  171  7.999999999999999e-42  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 		 219 aa  170  1e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 221 aa  170  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  50.77 
 
 		 209 aa  170  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  48.98 
 
 		 197 aa  167  9e-41  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  46.94 
 
 		 220 aa  167  1e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  46.94 
 
 		 220 aa  166  2e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  48.04 
 
 		 209 aa  166  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  45.64 
 
 		 217 aa  165  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  47.45 
 
 		 219 aa  166  2.9999999999999998e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 216 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 204 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  49.02 
 
 		 209 aa  165  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  45.41 
 
 		 230 aa  164  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 209 aa  164  8e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 		 220 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2946  riboflavin synthase subunit alpha  48.53 
 
 		 205 aa  163  1.0000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.175022  normal  0.644585 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  45.92 
 
 		 221 aa  164  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 		 215 aa  163  1.0000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  50.51 
 
 		 219 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0921  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.28001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 		 217 aa  162  2.0000000000000002e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0480  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0620  riboflavin synthase subunit alpha  46.34 
 
 		 204 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0959  riboflavin synthase subunit alpha  46.57 
 
 		 209 aa  162  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  43.37 
 
 		 220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 218 aa  162  3e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4063  riboflavin synthase subunit alpha  45.67 
 
 		 211 aa  161  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3109  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 237 aa  160  8.000000000000001e-39  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.719582  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 217 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  47.55 
 
 		 217 aa  160  8.000000000000001e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  44.67 
 
 		 223 aa  160  1e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>