More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_0819 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_0819  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 206 aa  414  9.999999999999999e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.244464  normal  0.311255 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  84.24 
 
 		 203 aa  360  7.0000000000000005e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1269  riboflavin synthase subunit alpha  83.66 
 
 		 203 aa  358  3e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00443387  normal  0.143541 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1614  riboflavin synthase subunit alpha  81.28 
 
 		 204 aa  348  2e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2527  riboflavin synthase subunit alpha  74.5 
 
 		 202 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.670524  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0768  riboflavin synthase subunit alpha  74.5 
 
 		 202 aa  310  6.999999999999999e-84  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0761  riboflavin synthase subunit alpha  74.5 
 
 		 202 aa  309  2e-83  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1137  riboflavin synthase subunit alpha  73.37 
 
 		 204 aa  308  4e-83  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0632  riboflavin synthase subunit alpha  58.71 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.149991  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4279  riboflavin synthase, alpha subunit  60.59 
 
 		 203 aa  237  8e-62  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.596839  normal  0.0272577 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  60 
 
 		 196 aa  231  6e-60  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0417  riboflavin synthase subunit alpha  58.5 
 
 		 198 aa  222  4e-57  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.821706 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3362  riboflavin synthase, alpha subunit  57.77 
 
 		 212 aa  221  7e-57  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2131  riboflavin synthase subunit alpha  56.25 
 
 		 201 aa  220  9.999999999999999e-57  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3167  riboflavin synthase, alpha subunit  57.77 
 
 		 212 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  57.35 
 
 		 200 aa  219  3e-56  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3959  riboflavin synthase, alpha subunit  60.39 
 
 		 207 aa  218  6e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0989485 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  56.28 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0758  riboflavin synthase subunit alpha  58.13 
 
 		 198 aa  216  2e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.215131  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  57.64 
 
 		 198 aa  215  4e-55  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3491  riboflavin synthase, alpha subunit  56.31 
 
 		 212 aa  214  7e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.178161  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  55.94 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4646  riboflavin synthase subunit alpha  57.35 
 
 		 202 aa  213  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.864914  normal  0.264101 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  57.21 
 
 		 197 aa  213  1.9999999999999998e-54  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  56 
 
 		 202 aa  211  5.999999999999999e-54  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2637  riboflavin synthase subunit alpha  55.45 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.23993  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2674  riboflavin synthase subunit alpha  55.94 
 
 		 202 aa  208  5e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.00828025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5294  riboflavin synthase, alpha subunit  54.76 
 
 		 213 aa  205  3e-52  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.287836  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3101  riboflavin synthase, alpha subunit  57.56 
 
 		 211 aa  205  5e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00905036  decreased coverage  0.00949736 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2911  riboflavin synthase, alpha subunit  52.88 
 
 		 208 aa  204  9e-52  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00128806  hitchhiker  0.000806135 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  51.78 
 
 		 196 aa  198  3.9999999999999996e-50  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2662  riboflavin synthase subunit alpha  51.98 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0632112  normal  0.768597 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1817  riboflavin synthase subunit alpha  53.2 
 
 		 202 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.35102  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  52.17 
 
 		 204 aa  191  4e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1724  riboflavin synthase subunit alpha  51.69 
 
 		 209 aa  191  7e-48  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.455199  normal  0.104146 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1534  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 201 aa  189  2.9999999999999997e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00190054  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2444  riboflavin synthase subunit alpha  48.78 
 
 		 205 aa  187  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 205 aa  180  1e-44  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  47.5 
 
 		 227 aa  174  6e-43  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  47.5 
 
 		 219 aa  168  5e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  46.46 
 
 		 219 aa  164  6.9999999999999995e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  42.93 
 
 		 221 aa  164  8e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  44.95 
 
 		 220 aa  164  8e-40  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  44.13 
 
 		 221 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 		 216 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 220 aa  161  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 		 220 aa  160  1e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2858  riboflavin synthase subunit alpha  42.38 
 
 		 207 aa  160  1e-38  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.650896  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  44.95 
 
 		 220 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 		 221 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  44.78 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  45 
 
 		 219 aa  159  4e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 209 aa  158  5e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 		 219 aa  158  5e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 220 aa  157  9e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  43.94 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  44 
 
 		 220 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.38 
 
 		 221 aa  156  2e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  43.2 
 
 		 215 aa  155  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  40.5 
 
 		 218 aa  155  3e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 215 aa  154  6e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  43.5 
 
 		 220 aa  154  6e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 199 aa  154  1e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  42.31 
 
 		 217 aa  154  1e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  41.59 
 
 		 210 aa  153  1e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  43.43 
 
 		 197 aa  153  2e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 215 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  43.43 
 
 		 200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  44.67 
 
 		 209 aa  152  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  42.11 
 
 		 208 aa  151  7e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  39.32 
 
 		 232 aa  150  1e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  42.03 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 		 208 aa  148  6e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  42.03 
 
 		 218 aa  147  8e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  42.03 
 
 		 218 aa  147  8e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  42.03 
 
 		 218 aa  147  8e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  38.19 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  42.13 
 
 		 198 aa  146  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  40.85 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  40.85 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  39.3 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 218 aa  145  5e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  38.97 
 
 		 214 aa  145  5e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 218 aa  145  6e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  41.06 
 
 		 218 aa  144  7.0000000000000006e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  33.33 
 
 		 214 aa  144  9e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  35.82 
 
 		 217 aa  144  9e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  40.58 
 
 		 218 aa  143  1e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  40.58 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  40.58 
 
 		 218 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 209 aa  143  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>