More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_0625 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 219 aa  447  1e-125  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  73.52 
 
 		 218 aa  319  1.9999999999999998e-86  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  68.04 
 
 		 219 aa  304  5.0000000000000004e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  69.41 
 
 		 218 aa  304  6e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  64.38 
 
 		 217 aa  279  2e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  58.9 
 
 		 218 aa  261  6e-69  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  57.01 
 
 		 218 aa  245  3e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  50.26 
 
 		 212 aa  174  7e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  42.92 
 
 		 219 aa  167  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  44.29 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  47.15 
 
 		 208 aa  165  4e-40  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 218 aa  164  9e-40  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 		 215 aa  160  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 218 aa  160  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 215 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  40.97 
 
 		 224 aa  159  3e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 218 aa  159  3e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  38.36 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  41.55 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 216 aa  159  4e-38  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  41.55 
 
 		 213 aa  159  4e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  38.36 
 
 		 217 aa  157  8e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 215 aa  157  1e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  38.18 
 
 		 221 aa  157  1e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  44.16 
 
 		 200 aa  157  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  43.88 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  46.43 
 
 		 199 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  39.46 
 
 		 217 aa  155  6e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  35.68 
 
 		 210 aa  154  9e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  43.08 
 
 		 200 aa  154  9e-37  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 215 aa  154  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  36.99 
 
 		 220 aa  154  1e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 203 aa  154  1e-36  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  41.07 
 
 		 223 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 199 aa  153  2e-36  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 217 aa  152  4e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 		 196 aa  152  5e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 215 aa  151  7e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  41.63 
 
 		 230 aa  150  1e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  43.59 
 
 		 196 aa  149  2e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 214 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  44 
 
 		 197 aa  150  2e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 215 aa  149  3e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  40.97 
 
 		 220 aa  149  3e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  40.54 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  41.89 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 216 aa  148  7e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  49.03 
 
 		 208 aa  147  9e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  36.07 
 
 		 218 aa  147  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  37.39 
 
 		 221 aa  147  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  40.93 
 
 		 201 aa  147  2.0000000000000003e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  39.09 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  39.09 
 
 		 218 aa  147  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  40.81 
 
 		 223 aa  147  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 200 aa  146  2.0000000000000003e-34  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 200 aa  145  3e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  38.18 
 
 		 227 aa  145  5e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  41.12 
 
 		 207 aa  145  5e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  38.64 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  36.53 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  43.84 
 
 		 201 aa  145  6e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  40.1 
 
 		 198 aa  145  6e-34  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  38.01 
 
 		 221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  42.78 
 
 		 196 aa  145  7.0000000000000006e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0563  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 192 aa  144  8.000000000000001e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  39.59 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  35.93 
 
 		 232 aa  144  1e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  39.55 
 
 		 216 aa  144  1e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  38.18 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  42.08 
 
 		 208 aa  144  1e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  32.88 
 
 		 214 aa  144  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  42.64 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 187 aa  143  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  35.75 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  34.25 
 
 		 215 aa  143  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  37.73 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  37.44 
 
 		 213 aa  143  3e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  42.71 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  44.23 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3007  riboflavin synthase subunit alpha  41.29 
 
 		 202 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.550528  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  32.88 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2438  riboflavin synthase subunit alpha  42.36 
 
 		 209 aa  142  4e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2990  riboflavin synthase subunit alpha  41.58 
 
 		 205 aa  142  4e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.039425 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  35.62 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  35.62 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  35.62 
 
 		 221 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  34.25 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  36.99 
 
 		 220 aa  141  6e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  40.97 
 
 		 217 aa  141  6e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 208 aa  141  6e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  35.62 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  35.62 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  35.62 
 
 		 221 aa  141  7e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>