More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_0952 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
218 aa  439  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  79.36 
 
 
218 aa  346  1e-94  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  69.55 
 
 
219 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  71.56 
 
 
217 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  69.41 
 
 
219 aa  304  6e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  58.26 
 
 
218 aa  263  1e-69  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  58.26 
 
 
218 aa  257  9e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  48.21 
 
 
216 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  47.64 
 
 
212 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  41.44 
 
 
220 aa  163  2.0000000000000002e-39  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  43.58 
 
 
217 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  42.79 
 
 
198 aa  161  7e-39  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  36.79 
 
 
210 aa  159  4e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  43.06 
 
 
215 aa  157  9e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  40.83 
 
 
213 aa  156  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  43.3 
 
 
194 aa  155  5.0000000000000005e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  41.84 
 
 
196 aa  154  7e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  46.15 
 
 
196 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  43.37 
 
 
200 aa  153  2e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  41.36 
 
 
218 aa  153  2e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  40.83 
 
 
215 aa  153  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  41.55 
 
 
220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  41.67 
 
 
224 aa  151  8e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  41.89 
 
 
220 aa  151  8.999999999999999e-36  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
216 aa  150  1e-35  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 
200 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 
196 aa  150  2e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 
219 aa  148  7e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 
230 aa  148  7e-35  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 
215 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  36.82 
 
 
218 aa  148  7e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 
215 aa  148  7e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  40.93 
 
 
201 aa  148  7e-35  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  35.45 
 
 
221 aa  148  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 
208 aa  147  9e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  41.07 
 
 
220 aa  147  9e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  38.53 
 
 
216 aa  147  1.0000000000000001e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  38.99 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  38.99 
 
 
218 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 
215 aa  147  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  36.53 
 
 
217 aa  146  3e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  36.07 
 
 
220 aa  145  3e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  43.35 
 
 
200 aa  145  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  38.6 
 
 
213 aa  145  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 
217 aa  145  5e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  36.24 
 
 
217 aa  145  6e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  36.07 
 
 
217 aa  144  1e-33  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  48.1 
 
 
208 aa  144  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  36.99 
 
 
220 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 
208 aa  144  1e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  40.27 
 
 
216 aa  142  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  43.08 
 
 
197 aa  142  5e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  37.9 
 
 
216 aa  142  6e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  37.9 
 
 
219 aa  141  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 
195 aa  141  7e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  42.35 
 
 
217 aa  141  8e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  35.32 
 
 
220 aa  141  8e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  41.92 
 
 
201 aa  141  9e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  37.67 
 
 
216 aa  140  9.999999999999999e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  35.32 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  36.07 
 
 
218 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
197 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  38.29 
 
 
220 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 
200 aa  141  9.999999999999999e-33  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  40.89 
 
 
224 aa  140  9.999999999999999e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  41.21 
 
 
197 aa  139  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  40.29 
 
 
210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 
221 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 
223 aa  140  1.9999999999999998e-32  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  42.56 
 
 
199 aa  139  3e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  40.31 
 
 
221 aa  139  3e-32  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0563  riboflavin synthase subunit alpha  36.92 
 
 
192 aa  139  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 
194 aa  139  3e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 
205 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  38.46 
 
 
217 aa  139  4.999999999999999e-32  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 
200 aa  138  7e-32  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 
219 aa  138  7e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 
218 aa  138  7.999999999999999e-32  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 
221 aa  137  8.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  39.18 
 
 
201 aa  137  1e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
220 aa  137  1e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  38.05 
 
 
223 aa  137  1e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  35.91 
 
 
219 aa  137  1e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  38.22 
 
 
219 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  31.51 
 
 
211 aa  137  2e-31  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 
218 aa  137  2e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  37.31 
 
 
216 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 
217 aa  136  2e-31  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
192 aa  136  3.0000000000000003e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  36.29 
 
 
239 aa  135  3.0000000000000003e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 
218 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  41.21 
 
 
205 aa  135  4e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  36.65 
 
 
220 aa  135  4e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1180  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 
203 aa  135  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.278464 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 
218 aa  135  4e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  40.3 
 
 
208 aa  135  4e-31  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>