More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plut_0731 on replicon NC_007512
Organism: Chlorobium luteolum DSM 273



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 217 aa  432  1e-120  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  72.02 
 
 		 218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  71.56 
 
 		 218 aa  305  4.0000000000000004e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  66.21 
 
 		 219 aa  288  3e-77  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  64.38 
 
 		 219 aa  279  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  58.26 
 
 		 218 aa  252  3e-66  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  57.08 
 
 		 218 aa  244  6e-64  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  50.79 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  44.24 
 
 		 220 aa  169  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  44.85 
 
 		 196 aa  167  1e-40  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  37.26 
 
 		 210 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  45.41 
 
 		 200 aa  164  9e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  44.75 
 
 		 217 aa  162  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 		 200 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  44.7 
 
 		 216 aa  162  5.0000000000000005e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  43.52 
 
 		 194 aa  160  1e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.66 
 
 		 213 aa  158  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 196 aa  156  2e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  40.55 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  42.93 
 
 		 198 aa  156  2e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  40.55 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 208 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  38.53 
 
 		 220 aa  155  4e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  41.18 
 
 		 201 aa  155  4e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  37.67 
 
 		 221 aa  154  8e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  42.36 
 
 		 204 aa  154  9e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.53 
 
 		 216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 		 220 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  40.09 
 
 		 219 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  43.78 
 
 		 200 aa  151  5.9999999999999996e-36  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  43.52 
 
 		 216 aa  151  7e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 218 aa  150  1e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 195 aa  150  1e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  38.99 
 
 		 216 aa  149  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 217 aa  149  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 		 215 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  41.82 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  40.36 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  37.61 
 
 		 219 aa  149  3e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  42.72 
 
 		 217 aa  149  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  40.99 
 
 		 220 aa  149  4e-35  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  43.65 
 
 		 197 aa  149  4e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  43.28 
 
 		 200 aa  149  4e-35  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  44.16 
 
 		 201 aa  149  5e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  40.45 
 
 		 227 aa  148  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  46.11 
 
 		 199 aa  148  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.55 
 
 		 214 aa  148  6e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  38.07 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  40.27 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  36.7 
 
 		 220 aa  147  8e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  36.7 
 
 		 220 aa  147  8e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  37.61 
 
 		 219 aa  147  9e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  39.19 
 
 		 220 aa  147  9e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 217 aa  147  1.0000000000000001e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  45.64 
 
 		 199 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 223 aa  147  1.0000000000000001e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  39.63 
 
 		 213 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  43.41 
 
 		 209 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  41.97 
 
 		 198 aa  147  2.0000000000000003e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 197 aa  145  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 196 aa  145  5e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  38.71 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2144  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3101  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0766  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 217 aa  144  9e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3013  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2599  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2014  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3066  riboflavin synthase subunit alpha  42.44 
 
 		 204 aa  144  9e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.160725  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  41.98 
 
 		 209 aa  144  1e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  35.94 
 
 		 215 aa  144  1e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 219 aa  143  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  41.62 
 
 		 200 aa  143  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  41.71 
 
 		 208 aa  143  2e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 218 aa  143  2e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 221 aa  142  3e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0894  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2417  riboflavin synthase subunit alpha  43.37 
 
 		 198 aa  142  3e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.22207 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3100  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 204 aa  142  3e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.592205  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  37.16 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 225 aa  142  3e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  39.17 
 
 		 218 aa  142  4e-33  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 		 201 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>