More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_0835 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 219 aa  438  9.999999999999999e-123  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  71.36 
 
 		 218 aa  310  9e-84  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  69.55 
 
 		 218 aa  306  2.0000000000000002e-82  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  68.04 
 
 		 219 aa  304  5.0000000000000004e-82  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  66.21 
 
 		 217 aa  288  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  63.47 
 
 		 218 aa  280  1e-74  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  61.09 
 
 		 218 aa  259  2e-68  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  47.03 
 
 		 216 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  43.75 
 
 		 220 aa  175  6e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  41.52 
 
 		 220 aa  172  3.9999999999999995e-42  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  50.5 
 
 		 212 aa  171  5e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  43.24 
 
 		 218 aa  172  5e-42  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  43.38 
 
 		 219 aa  168  7e-41  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  44.29 
 
 		 217 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  43.84 
 
 		 213 aa  165  5.9999999999999996e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  39.73 
 
 		 217 aa  164  1.0000000000000001e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  48.5 
 
 		 200 aa  163  2.0000000000000002e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  42.48 
 
 		 224 aa  162  3e-39  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  42.47 
 
 		 220 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 217 aa  161  8.000000000000001e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  39.2 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  42.47 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 217 aa  160  2e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  45.67 
 
 		 215 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  41.63 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  41.63 
 
 		 218 aa  159  2e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3094  riboflavin synthase subunit alpha  40.52 
 
 		 230 aa  159  2e-38  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.112712 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  39.46 
 
 		 217 aa  158  5e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  37.9 
 
 		 218 aa  157  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 220 aa  157  1e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  44.78 
 
 		 194 aa  157  1e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.99 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  36.53 
 
 		 220 aa  157  2e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 		 215 aa  156  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  39.55 
 
 		 221 aa  156  3e-37  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  42.34 
 
 		 216 aa  154  7e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 		 196 aa  154  1e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  36.82 
 
 		 221 aa  154  1e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  42.35 
 
 		 196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 215 aa  152  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  44.22 
 
 		 198 aa  152  4e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 		 215 aa  152  4e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 210 aa  152  5e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  36.53 
 
 		 218 aa  152  5e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 220 aa  151  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  35.62 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 220 aa  151  8.999999999999999e-36  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 200 aa  150  1e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  40.64 
 
 		 219 aa  150  1e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  39.29 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 216 aa  150  2e-35  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  46.45 
 
 		 208 aa  149  2e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 219 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 221 aa  149  3e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2469  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.032999 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2140  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 223 aa  149  4e-35  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00256216 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0731  riboflavin synthase subunit alpha  37.23 
 
 		 232 aa  148  5e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  41.33 
 
 		 224 aa  148  5e-35  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 226 aa  148  5e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  37.73 
 
 		 221 aa  147  8e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1847  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 200 aa  148  8e-35  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  39.73 
 
 		 216 aa  148  8e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 196 aa  147  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 		 215 aa  147  1.0000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  37.9 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  37.9 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  37.9 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  37.9 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 214 aa  146  3e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  37.9 
 
 		 220 aa  146  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 219 aa  145  3e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  45.86 
 
 		 187 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  38.28 
 
 		 216 aa  145  5e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  37.9 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1907  riboflavin synthase subunit alpha  41.21 
 
 		 200 aa  145  6e-34  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  37.9 
 
 		 217 aa  145  6e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  42.86 
 
 		 201 aa  145  6e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  36.36 
 
 		 219 aa  144  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  34.7 
 
 		 220 aa  144  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  40.09 
 
 		 223 aa  144  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  40.51 
 
 		 208 aa  142  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  44.67 
 
 		 197 aa  142  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 199 aa  142  4e-33  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  41.07 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  36.2 
 
 		 214 aa  142  5e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  37.9 
 
 		 220 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  43 
 
 		 205 aa  141  7e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 218 aa  141  9e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  41.26 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  40.93 
 
 		 196 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  40 
 
 		 227 aa  140  9.999999999999999e-33  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  43.9 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  35.75 
 
 		 215 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>