More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_10000 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  100 
 
 
215 aa  429  1e-119  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  50.45 
 
 
222 aa  207  1e-52  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  46.82 
 
 
217 aa  194  1e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  48.43 
 
 
223 aa  193  2e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  49.3 
 
 
214 aa  193  2e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  49.53 
 
 
215 aa  192  3e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  46.51 
 
 
214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  45.87 
 
 
218 aa  188  5e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  46.05 
 
 
214 aa  187  8e-47  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  45.25 
 
 
218 aa  186  3e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  45.58 
 
 
214 aa  186  3e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  47.71 
 
 
214 aa  185  4e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  45.98 
 
 
217 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 
216 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 
215 aa  181  9.000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 
217 aa  178  4e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  45.12 
 
 
214 aa  178  5.999999999999999e-44  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 
217 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  46.05 
 
 
214 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  46.05 
 
 
214 aa  177  8e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  46.05 
 
 
214 aa  177  8e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  46.05 
 
 
214 aa  177  8e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  46.05 
 
 
214 aa  177  8e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  48.47 
 
 
199 aa  177  1e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  47.62 
 
 
215 aa  177  1e-43  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  45.12 
 
 
214 aa  176  2e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  45.12 
 
 
214 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  47.2 
 
 
205 aa  175  5e-43  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 
226 aa  174  7e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  45.33 
 
 
205 aa  173  9.999999999999999e-43  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  44.44 
 
 
239 aa  173  9.999999999999999e-43  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  47.3 
 
 
221 aa  174  9.999999999999999e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  46.76 
 
 
217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 
216 aa  172  5e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  50 
 
 
204 aa  171  5.999999999999999e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  45.5 
 
 
204 aa  171  6.999999999999999e-42  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  48.15 
 
 
202 aa  171  1e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  48.68 
 
 
203 aa  170  1e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  48.68 
 
 
208 aa  170  1e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 
216 aa  170  1e-41  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 
217 aa  169  3e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  47 
 
 
208 aa  168  7e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  42.99 
 
 
211 aa  166  2e-40  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  44.91 
 
 
216 aa  166  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_972  riboflavin synthase, alpha subunit  44.39 
 
 
205 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0666054  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  46.63 
 
 
215 aa  165  4e-40  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 
221 aa  165  5.9999999999999996e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  45.58 
 
 
207 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  46.35 
 
 
200 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  46.56 
 
 
196 aa  164  1.0000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  46.56 
 
 
202 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  45.96 
 
 
201 aa  162  3e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 
210 aa  162  5.0000000000000005e-39  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 
205 aa  160  2e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  44.16 
 
 
207 aa  160  2e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 
203 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 
203 aa  159  2e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  45.31 
 
 
216 aa  159  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  46.84 
 
 
220 aa  159  3e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.27 
 
 
220 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  46.39 
 
 
203 aa  159  4e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  46.43 
 
 
205 aa  158  5e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  42.5 
 
 
201 aa  158  7e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  46.19 
 
 
210 aa  157  8e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  45.6 
 
 
201 aa  157  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  42.59 
 
 
227 aa  157  1e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  44.1 
 
 
214 aa  156  2e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  46.15 
 
 
209 aa  156  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  46.63 
 
 
223 aa  155  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1327  riboflavin synthase subunit alpha  41.4 
 
 
210 aa  155  6e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.254294  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  40.55 
 
 
219 aa  154  7e-37  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2883  riboflavin synthase subunit alpha  39.58 
 
 
215 aa  154  8e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.34702  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  45.55 
 
 
211 aa  154  8e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  39.82 
 
 
218 aa  154  9e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 
221 aa  154  9e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 
193 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  45 
 
 
212 aa  154  1e-36  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  43.72 
 
 
227 aa  154  1e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 
219 aa  154  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  43.88 
 
 
221 aa  153  1e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 
216 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  42.49 
 
 
198 aa  152  2.9999999999999998e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  38.43 
 
 
217 aa  152  2.9999999999999998e-36  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  45.56 
 
 
187 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  38.12 
 
 
220 aa  152  5e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 
221 aa  150  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  43.48 
 
 
203 aa  150  1e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  40.28 
 
 
215 aa  149  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  43.62 
 
 
211 aa  150  2e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 
221 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 
221 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 
221 aa  149  3e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  43.75 
 
 
204 aa  149  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
219 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  40.45 
 
 
219 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  40.72 
 
 
199 aa  149  3e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  38.43 
 
 
217 aa  149  4e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 
220 aa  148  5e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  45.26 
 
 
203 aa  148  5e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  39.45 
 
 
216 aa  148  5e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>