More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0563 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012034  Athe_0563  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
192 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  51.03 
 
 
210 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  46.63 
 
 
215 aa  176  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  46.07 
 
 
226 aa  174  5e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  47.12 
 
 
214 aa  168  4e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  48.69 
 
 
207 aa  166  2e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  43.98 
 
 
213 aa  165  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 
215 aa  164  6.9999999999999995e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  45.03 
 
 
214 aa  162  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  42.05 
 
 
239 aa  161  5.0000000000000005e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  45.55 
 
 
214 aa  161  6e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 
216 aa  161  7e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  44.74 
 
 
214 aa  160  9e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 
216 aa  158  4e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  44.56 
 
 
214 aa  158  6e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  44.44 
 
 
205 aa  157  1e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  45.26 
 
 
217 aa  157  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  46.91 
 
 
221 aa  156  2e-37  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  45.36 
 
 
199 aa  155  3e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  46.07 
 
 
215 aa  155  3e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  48.17 
 
 
206 aa  155  4e-37  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  43.08 
 
 
216 aa  154  7e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  44.33 
 
 
216 aa  154  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  41.58 
 
 
202 aa  153  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  42.78 
 
 
201 aa  153  2e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 
218 aa  152  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  42.27 
 
 
200 aa  152  2.9999999999999998e-36  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0657  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 
207 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  42.05 
 
 
218 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0761  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 
202 aa  152  2.9999999999999998e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  41.88 
 
 
211 aa  151  5e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  42.63 
 
 
196 aa  151  5e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  43.37 
 
 
200 aa  150  8e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 
213 aa  150  8e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  45.88 
 
 
218 aa  150  1e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  39.58 
 
 
218 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  39.58 
 
 
218 aa  149  3e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  41.36 
 
 
202 aa  148  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 
215 aa  149  4e-35  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 
217 aa  148  5e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  45.26 
 
 
214 aa  148  5e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  44.68 
 
 
197 aa  148  6e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 
214 aa  147  7e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.91 
 
 
204 aa  147  8e-35  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 
214 aa  147  9e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  38.34 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 
220 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  39.9 
 
 
198 aa  147  1.0000000000000001e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  46.58 
 
 
187 aa  146  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  41.36 
 
 
211 aa  146  2.0000000000000003e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 
221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.63 
 
 
216 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 
217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  44.21 
 
 
214 aa  145  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  44.04 
 
 
193 aa  145  3e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  41.88 
 
 
203 aa  145  3e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 
220 aa  145  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  44.21 
 
 
214 aa  145  3e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  41.36 
 
 
208 aa  145  4.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 
217 aa  145  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  43.68 
 
 
214 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  43.68 
 
 
214 aa  144  5e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  43.68 
 
 
214 aa  144  5e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  43.68 
 
 
214 aa  144  5e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  43.68 
 
 
214 aa  144  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  41.75 
 
 
215 aa  144  5e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 
219 aa  144  6e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  41.03 
 
 
216 aa  144  7.0000000000000006e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  43.01 
 
 
223 aa  144  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 
221 aa  144  7.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  43.52 
 
 
223 aa  144  9e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 
208 aa  143  1e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  39.18 
 
 
216 aa  144  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  41.36 
 
 
204 aa  144  1e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  43.59 
 
 
216 aa  143  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  39.27 
 
 
203 aa  143  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 
223 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 
217 aa  142  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 
219 aa  142  3e-33  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  40.3 
 
 
251 aa  142  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  40.1 
 
 
219 aa  142  4e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  40.84 
 
 
214 aa  142  4e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 
217 aa  141  5e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1930  riboflavin synthase subunit alpha  44.39 
 
 
203 aa  141  5e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 
205 aa  141  6e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 
201 aa  140  8e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 
203 aa  140  9.999999999999999e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1327  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
210 aa  139  1.9999999999999998e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.254294  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0620  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 
204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  36.92 
 
 
218 aa  139  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 
218 aa  139  3e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  39.58 
 
 
218 aa  139  3e-32  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  37.63 
 
 
217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  42.21 
 
 
204 aa  138  3.9999999999999997e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  44.23 
 
 
208 aa  138  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 
221 aa  138  6e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 
218 aa  137  7e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
200 aa  137  7.999999999999999e-32  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  37.44 
 
 
222 aa  137  8.999999999999999e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  38.58 
 
 
219 aa  137  1e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>