More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_2448 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 217 aa  426  1e-118  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  65.83 
 
 		 199 aa  248  4e-65  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  62.63 
 
 		 202 aa  242  3e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  62.25 
 
 		 223 aa  238  4e-62  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  62.26 
 
 		 208 aa  236  3e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  60.2 
 
 		 202 aa  230  1e-59  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  62.07 
 
 		 205 aa  225  4e-58  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  62.56 
 
 		 203 aa  225  4e-58  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  59.7 
 
 		 215 aa  224  6e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  65.48 
 
 		 212 aa  220  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  56.6 
 
 		 207 aa  218  7e-56  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2389  riboflavin synthase subunit alpha  60.78 
 
 		 203 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.160272  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2436  riboflavin synthase subunit alpha  60.78 
 
 		 203 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.399629 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  59.02 
 
 		 204 aa  216  2e-55  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2430  riboflavin synthase subunit alpha  60.29 
 
 		 203 aa  216  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  58.29 
 
 		 204 aa  211  5.999999999999999e-54  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  56.74 
 
 		 205 aa  211  9e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  59.02 
 
 		 200 aa  210  1e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1723  riboflavin synthase subunit alpha  55.31 
 
 		 227 aa  210  1e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.516188  hitchhiker  0.00196087 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  58.82 
 
 		 221 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  58.62 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  55.56 
 
 		 193 aa  210  2e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  57.29 
 
 		 208 aa  210  2e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  59.8 
 
 		 204 aa  208  4e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  59.61 
 
 		 201 aa  207  9e-53  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2979  riboflavin synthase, alpha subunit  59.71 
 
 		 209 aa  206  2e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.209687  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  56.04 
 
 		 215 aa  202  2e-51  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  56.57 
 
 		 214 aa  200  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  54.11 
 
 		 210 aa  199  1.9999999999999998e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 221 aa  199  3.9999999999999996e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  52.36 
 
 		 238 aa  196  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  46.04 
 
 		 217 aa  195  4.0000000000000005e-49  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  48.28 
 
 		 215 aa  195  5.000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 214 aa  194  7e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 214 aa  193  1e-48  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  45.15 
 
 		 215 aa  193  1e-48  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  50 
 
 		 214 aa  193  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  46.31 
 
 		 218 aa  192  3e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  50.99 
 
 		 214 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  53.47 
 
 		 196 aa  189  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  44.72 
 
 		 214 aa  189  2.9999999999999997e-47  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  48.99 
 
 		 218 aa  188  7e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  51.44 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  44.98 
 
 		 214 aa  187  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  53.03 
 
 		 215 aa  187  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  50.25 
 
 		 213 aa  187  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 214 aa  186  2e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  51.01 
 
 		 216 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 216 aa  185  5e-46  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  51.52 
 
 		 223 aa  183  1.0000000000000001e-45  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  45.32 
 
 		 239 aa  184  1.0000000000000001e-45  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  48.57 
 
 		 205 aa  183  2.0000000000000003e-45  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  45.37 
 
 		 207 aa  183  2.0000000000000003e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4019  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3852  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3866  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4332  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4134  riboflavin synthase subunit alpha  44.02 
 
 		 214 aa  182  4.0000000000000006e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  50.75 
 
 		 215 aa  181  9.000000000000001e-45  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 217 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  51.2 
 
 		 251 aa  179  2.9999999999999997e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  48.26 
 
 		 217 aa  178  4.999999999999999e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  50.25 
 
 		 201 aa  178  4.999999999999999e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  50.5 
 
 		 216 aa  178  4.999999999999999e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 217 aa  178  5.999999999999999e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  41.79 
 
 		 211 aa  178  7e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 221 aa  176  2e-43  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  47.09 
 
 		 204 aa  176  3e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  47.57 
 
 		 221 aa  175  4e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  47.74 
 
 		 220 aa  175  5e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4152  riboflavin synthase, alpha subunit  51.18 
 
 		 233 aa  175  5e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0119358  hitchhiker  0.00855213 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  44.22 
 
 		 226 aa  175  6e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  51.98 
 
 		 199 aa  174  9e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1727  riboflavin synthase, alpha subunit  53.17 
 
 		 202 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0379376  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 215 aa  174  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  49.25 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 219 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  50.72 
 
 		 222 aa  172  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  49.5 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 221 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  47.78 
 
 		 218 aa  172  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  47.24 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 		 214 aa  172  3.9999999999999995e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 218 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  46.73 
 
 		 219 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  46.53 
 
 		 217 aa  172  3.9999999999999995e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  45.73 
 
 		 221 aa  171  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 218 aa  171  5.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  52.26 
 
 		 219 aa  171  7.999999999999999e-42  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  47.29 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  46.83 
 
 		 218 aa  171  7.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  44.12 
 
 		 217 aa  171  9e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  47.32 
 
 		 220 aa  171  9e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  49.16 
 
 		 187 aa  171  9e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>