More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3288 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 194 aa  399  9.999999999999999e-111  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  66.49 
 
 		 195 aa  271  5.000000000000001e-72  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  64.58 
 
 		 198 aa  263  1e-69  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  59.9 
 
 		 197 aa  250  9.000000000000001e-66  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  57.44 
 
 		 200 aa  245  3e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  59.16 
 
 		 196 aa  243  9.999999999999999e-64  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  57.22 
 
 		 194 aa  238  2.9999999999999997e-62  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  54.74 
 
 		 196 aa  228  5e-59  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0733  riboflavin synthase subunit alpha  56.85 
 
 		 200 aa  226  2e-58  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 218 aa  167  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  45.18 
 
 		 199 aa  166  1e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  45.21 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 226 aa  154  1e-36  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 214 aa  152  4e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 214 aa  150  8e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  42.19 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  41.75 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  42.79 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 		 223 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  41.21 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 		 216 aa  148  5e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 210 aa  147  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  43.01 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  41.54 
 
 		 207 aa  147  1.0000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  40.62 
 
 		 204 aa  146  2.0000000000000003e-34  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  41.24 
 
 		 214 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 203 aa  145  3e-34  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 216 aa  145  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  41.24 
 
 		 213 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  40.41 
 
 		 202 aa  145  4.0000000000000006e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 192 aa  145  4.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  41.54 
 
 		 202 aa  144  6e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  39.09 
 
 		 200 aa  144  7.0000000000000006e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 215 aa  144  8.000000000000001e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  38.14 
 
 		 200 aa  144  8.000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  40.5 
 
 		 205 aa  144  9e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  42.27 
 
 		 193 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 221 aa  143  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  38.66 
 
 		 220 aa  143  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  38.46 
 
 		 214 aa  143  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.03 
 
 		 214 aa  142  2e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  40.89 
 
 		 205 aa  142  3e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 215 aa  141  5e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  42.35 
 
 		 205 aa  141  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  41.62 
 
 		 218 aa  141  6e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  40.7 
 
 		 239 aa  141  7e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 209 aa  141  7e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  43.65 
 
 		 212 aa  140  9e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 217 aa  140  9e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  42.29 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  40.62 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 217 aa  140  9.999999999999999e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.59 
 
 		 204 aa  139  1.9999999999999998e-32  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 216 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  42.79 
 
 		 210 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  40.21 
 
 		 199 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 203 aa  139  3e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  44.06 
 
 		 205 aa  139  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  36.41 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  40.41 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 221 aa  138  6e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  41.12 
 
 		 201 aa  137  7e-32  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 217 aa  137  7.999999999999999e-32  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  37.44 
 
 		 221 aa  137  7.999999999999999e-32  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  41.15 
 
 		 204 aa  137  1e-31  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  41.09 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 219 aa  137  1e-31  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  38.14 
 
 		 218 aa  137  1e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  41.29 
 
 		 207 aa  137  1e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 		 226 aa  136  2e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 200 aa  136  2e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 218 aa  136  2e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  35.38 
 
 		 214 aa  135  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0681  riboflavin synthase, alpha subunit  39.41 
 
 		 210 aa  135  3.0000000000000003e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  35.38 
 
 		 214 aa  135  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  42.71 
 
 		 201 aa  135  4e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  38.74 
 
 		 200 aa  135  4e-31  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  41.45 
 
 		 220 aa  135  4e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 204 aa  134  6.0000000000000005e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  38.14 
 
 		 201 aa  134  7.000000000000001e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 218 aa  134  8e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  42.13 
 
 		 216 aa  134  8e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  41.45 
 
 		 211 aa  134  9e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 		 219 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  38.14 
 
 		 211 aa  133  1.9999999999999998e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  36.6 
 
 		 217 aa  132  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  36.27 
 
 		 215 aa  132  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  40.62 
 
 		 213 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  36.41 
 
 		 218 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  35.57 
 
 		 219 aa  132  3e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1675  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 		 222 aa  132  3e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.420891  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1273  riboflavin synthase subunit alpha  38.1 
 
 		 251 aa  132  3e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.373271  normal  0.402844 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  37.95 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  36.92 
 
 		 217 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  38.78 
 
 		 215 aa  131  5e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  34.87 
 
 		 217 aa  131  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  35.05 
 
 		 219 aa  131  5e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  37.31 
 
 		 196 aa  131  6e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>