More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG0733 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG0733  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
200 aa  413  9.999999999999999e-116  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  59.39 
 
 
198 aa  238  5.999999999999999e-62  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  55.61 
 
 
196 aa  230  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  54.55 
 
 
194 aa  228  4e-59  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  56.85 
 
 
194 aa  226  2e-58  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  57.36 
 
 
197 aa  218  5e-56  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  55.84 
 
 
200 aa  217  7.999999999999999e-56  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  51.27 
 
 
195 aa  201  5e-51  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  46.7 
 
 
196 aa  193  1e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  40.89 
 
 
223 aa  149  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  43.28 
 
 
201 aa  149  2e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  38.19 
 
 
210 aa  148  6e-35  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  40.7 
 
 
212 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  41.5 
 
 
199 aa  146  2.0000000000000003e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  42.29 
 
 
215 aa  145  3e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  42.42 
 
 
214 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5219  riboflavin synthase, alpha subunit  44.67 
 
 
212 aa  142  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0952881  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  38.81 
 
 
202 aa  141  6e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 
220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  41.62 
 
 
208 aa  139  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 
218 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  39.3 
 
 
217 aa  139  1.9999999999999998e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  41.21 
 
 
221 aa  138  3.9999999999999997e-32  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 
220 aa  138  4.999999999999999e-32  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  40.59 
 
 
205 aa  137  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  36.82 
 
 
217 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  36.82 
 
 
217 aa  138  7e-32  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2640  riboflavin synthase subunit alpha  41.92 
 
 
203 aa  137  1e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.461604  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  40.2 
 
 
201 aa  136  2e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  41.87 
 
 
201 aa  135  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  37.37 
 
 
215 aa  135  5e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1866  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 
205 aa  135  6.0000000000000005e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  37.88 
 
 
213 aa  134  7.000000000000001e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0553  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 
192 aa  134  7.000000000000001e-31  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 
215 aa  134  9e-31  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  39.32 
 
 
223 aa  134  9e-31  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0853  riboflavin synthase subunit alpha  40 
 
 
200 aa  134  9e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  40.8 
 
 
205 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1859  riboflavin synthase, alpha subunit  41.09 
 
 
204 aa  133  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.261551  normal  0.387572 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  38.12 
 
 
218 aa  133  1.9999999999999998e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  39.02 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1365  riboflavin synthase subunit alpha  42.94 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.839252  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 
221 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  37.69 
 
 
200 aa  132  5e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  37.81 
 
 
214 aa  132  5e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  39 
 
 
216 aa  131  6e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  38.69 
 
 
213 aa  131  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  38.24 
 
 
217 aa  131  6e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  39.3 
 
 
199 aa  131  6e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  36.23 
 
 
204 aa  131  6.999999999999999e-30  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  38.89 
 
 
217 aa  131  6.999999999999999e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 
196 aa  131  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 
214 aa  131  7.999999999999999e-30  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1684  Lumazine-binding protein  38.78 
 
 
196 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137212  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2562  riboflavin synthase, alpha subunit  39.23 
 
 
207 aa  131  7.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.503864  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  38.92 
 
 
219 aa  130  9e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  35.86 
 
 
239 aa  130  1.0000000000000001e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  37.19 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0923  riboflavin synthase subunit alpha  36.68 
 
 
218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0969  riboflavin synthase subunit alpha  40.2 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.833075  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  39.7 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  34.48 
 
 
223 aa  130  1.0000000000000001e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2602  riboflavin synthase, alpha subunit  38.16 
 
 
205 aa  130  2.0000000000000002e-29  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  34.85 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  37.88 
 
 
200 aa  129  2.0000000000000002e-29  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0200  riboflavin synthase subunit alpha  36.89 
 
 
203 aa  130  2.0000000000000002e-29  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.659601 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  39.22 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  39.9 
 
 
224 aa  129  3e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1670  riboflavin synthase subunit alpha  37.68 
 
 
226 aa  129  3e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.57182e-16 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1403  riboflavin synthase, alpha subunit  38.54 
 
 
208 aa  128  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 
221 aa  128  4.0000000000000003e-29  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  39.5 
 
 
216 aa  129  4.0000000000000003e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  39.39 
 
 
202 aa  129  4.0000000000000003e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 
215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  39.39 
 
 
224 aa  128  5.0000000000000004e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  35.64 
 
 
217 aa  128  6e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  38.05 
 
 
210 aa  128  7.000000000000001e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  37.62 
 
 
218 aa  127  8.000000000000001e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  38.38 
 
 
207 aa  127  8.000000000000001e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  39.52 
 
 
208 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  38.38 
 
 
216 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2779  riboflavin synthase, alpha subunit  36.82 
 
 
211 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  36 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  34.98 
 
 
215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  36.14 
 
 
217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  37.2 
 
 
230 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  37.69 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  36.68 
 
 
216 aa  125  3e-28  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  37.31 
 
 
219 aa  125  3e-28  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  36.59 
 
 
200 aa  126  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  34.98 
 
 
215 aa  126  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  38.42 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  37.93 
 
 
217 aa  125  4.0000000000000003e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  34.85 
 
 
226 aa  125  4.0000000000000003e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  38.19 
 
 
215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3187  riboflavin synthase subunit alpha  36.8 
 
 
238 aa  125  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00151033  normal  0.190561 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  39.5 
 
 
215 aa  125  6e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  35.5 
 
 
201 aa  124  6e-28  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1860  riboflavin synthase subunit alpha  35.64 
 
 
217 aa  124  7e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0164931  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>