More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Afer_1684 on replicon NC_013124
Organism: Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013124  Afer_1684  Lumazine-binding protein  100 
 
 		 196 aa  381  1e-105  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.137212  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0394  riboflavin synthase, alpha subunit  41.88 
 
 		 194 aa  145  4.0000000000000006e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  43.07 
 
 		 205 aa  135  5e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0835  riboflavin synthase subunit alpha  41.97 
 
 		 219 aa  133  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  45.96 
 
 		 208 aa  132  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1886  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 		 218 aa  131  6e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.182336  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0733  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 200 aa  131  7.999999999999999e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1696  riboflavin synthase, alpha subunit  36.41 
 
 		 196 aa  131  7.999999999999999e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.375182  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  39.38 
 
 		 198 aa  130  1.0000000000000001e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2063  riboflavin synthase, alpha subunit  40.74 
 
 		 212 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.282558  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1619  riboflavin synthase subunit alpha  40.82 
 
 		 218 aa  130  1.0000000000000001e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0904946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  41.54 
 
 		 214 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0731  riboflavin synthase subunit alpha  42.35 
 
 		 217 aa  129  3e-29  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.569257 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  39.09 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0952  riboflavin synthase subunit alpha  38.78 
 
 		 218 aa  129  3e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0177  riboflavin synthase subunit alpha  34.12 
 
 		 210 aa  127  8.000000000000001e-29  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.767417  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 215 aa  126  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  44.5 
 
 		 215 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  38.3 
 
 		 217 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3707  riboflavin synthase, alpha subunit  40.82 
 
 		 196 aa  125  4.0000000000000003e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  44.33 
 
 		 215 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0681  riboflavin synthase, alpha subunit  42.71 
 
 		 210 aa  125  5e-28  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  43.98 
 
 		 215 aa  125  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1926  riboflavin synthase subunit alpha  37.11 
 
 		 195 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.285487 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  37.24 
 
 		 220 aa  123  1e-27  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  40.39 
 
 		 215 aa  122  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 216 aa  123  2e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  41.12 
 
 		 219 aa  122  2e-27  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0847  riboflavin synthase subunit alpha  38.34 
 
 		 206 aa  122  2e-27  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000849301  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  46.11 
 
 		 199 aa  123  2e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1750  riboflavin synthase, alpha subunit  39.71 
 
 		 213 aa  122  3e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.206972  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  43.28 
 
 		 202 aa  122  3e-27  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  38.73 
 
 		 223 aa  122  3e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1009  riboflavin synthase, alpha subunit  41.95 
 
 		 208 aa  122  5e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2020  riboflavin synthase subunit alpha  38.46 
 
 		 209 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.025182  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 221 aa  120  9.999999999999999e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08540  riboflavin synthase, alpha subunit  36.5 
 
 		 222 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3288  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 194 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.211802 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  35.94 
 
 		 216 aa  119  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0650  riboflavin synthase subunit alpha  34.36 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00789457  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3107  riboflavin synthase, alpha subunit  43.5 
 
 		 223 aa  119  3e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.409641 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  45.57 
 
 		 221 aa  119  3e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2296  riboflavin synthase subunit alpha  38.17 
 
 		 206 aa  118  6e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  35.9 
 
 		 207 aa  118  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3112  riboflavin synthase, alpha subunit  43.48 
 
 		 208 aa  117  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  41.57 
 
 		 200 aa  117  7.999999999999999e-26  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1952  riboflavin synthase subunit alpha  38.71 
 
 		 206 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000576135  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2040  riboflavin synthase subunit alpha  38.71 
 
 		 206 aa  117  7.999999999999999e-26  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000661862  normal  0.015006 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2024  riboflavin synthase subunit alpha  38.71 
 
 		 206 aa  117  9e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0115302  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2030  riboflavin synthase, alpha subunit  40.51 
 
 		 211 aa  117  9.999999999999999e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  37.76 
 
 		 198 aa  117  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2597  riboflavin synthase subunit alpha  39.36 
 
 		 193 aa  117  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.195355  normal  0.238083 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  42.56 
 
 		 220 aa  116  1.9999999999999998e-25  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  42.58 
 
 		 216 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  35 
 
 		 217 aa  116  1.9999999999999998e-25  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10000  riboflavin synthase, alpha subunit  38.22 
 
 		 215 aa  115  3e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  44.51 
 
 		 204 aa  115  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.913253 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3261  riboflavin synthase, alpha subunit  41 
 
 		 201 aa  115  3e-25  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2354  riboflavin synthase, alpha subunit  39.59 
 
 		 215 aa  115  3.9999999999999997e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0725923  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  35 
 
 		 217 aa  115  3.9999999999999997e-25  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  36.08 
 
 		 221 aa  114  6e-25  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 220 aa  114  6.9999999999999995e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2145  riboflavin synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 207 aa  114  7.999999999999999e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110513  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  35.42 
 
 		 215 aa  114  7.999999999999999e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  39.49 
 
 		 200 aa  114  7.999999999999999e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0831  riboflavin synthase subunit alpha  37.82 
 
 		 218 aa  114  8.999999999999998e-25  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  36.27 
 
 		 216 aa  114  1.0000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  39.76 
 
 		 187 aa  113  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2435  riboflavin synthase subunit alpha  40.65 
 
 		 224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00995075  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2926  riboflavin synthase, alpha subunit  35.75 
 
 		 197 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1618  riboflavin synthase, alpha subunit  34.85 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.94191 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1617  riboflavin synthase subunit alpha  35.05 
 
 		 197 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  42.35 
 
 		 201 aa  113  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  41.75 
 
 		 202 aa  113  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  33.16 
 
 		 220 aa  113  2.0000000000000002e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  37.88 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0563  riboflavin synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 192 aa  112  3e-24  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 214 aa  112  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0899  riboflavin synthase subunit alpha  43.52 
 
 		 219 aa  112  3e-24  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.484781  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1857  riboflavin synthase subunit alpha  37.76 
 
 		 220 aa  112  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.978588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2766  riboflavin synthase, alpha subunit  39.27 
 
 		 201 aa  112  4.0000000000000004e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.210112  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1189  riboflavin synthase subunit alpha  36.17 
 
 		 205 aa  111  5e-24  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 214 aa  112  5e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  33.85 
 
 		 214 aa  111  5e-24  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  37.19 
 
 		 220 aa  111  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0685  riboflavin synthase subunit alpha  37 
 
 		 198 aa  111  6e-24  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2181  riboflavin synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 207 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000128558  normal  0.0219696 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2333  riboflavin synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 207 aa  111  6e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0365218  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0860  riboflavin synthase, alpha subunit  43.03 
 
 		 210 aa  111  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.809023  normal  0.0432562 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 		 221 aa  111  8.000000000000001e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2225  riboflavin synthase subunit alpha  37.02 
 
 		 207 aa  111  9e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109556  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  38.86 
 
 		 220 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  37.2 
 
 		 239 aa  110  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1187  riboflavin synthase subunit alpha  36.73 
 
 		 204 aa  109  2.0000000000000002e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1000  riboflavin synthase subunit alpha  35.64 
 
 		 205 aa  109  2.0000000000000002e-23  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.665002  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0293  riboflavin synthase, alpha subunit  35.9 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 		 213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3721  riboflavin synthase subunit alpha  43.12 
 
 		 203 aa  109  3e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0647678 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  36.73 
 
 		 217 aa  109  3e-23  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  35.57 
 
 		 215 aa  109  3e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>