More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TC0685 on replicon NC_002620
Organism: Chlamydia muridarum Nigg



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002620  TC0685  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 
198 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.187161  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  42.25 
 
 
216 aa  150  1e-35  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1940  riboflavin synthase subunit alpha  39.8 
 
 
205 aa  148  4e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0812  riboflavin synthase subunit alpha  42.08 
 
 
202 aa  148  6e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  43.28 
 
 
214 aa  147  7e-35  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 
218 aa  142  3e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1160  riboflavin synthase, alpha subunit  40.22 
 
 
204 aa  142  3e-33  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  42.25 
 
 
215 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  38.76 
 
 
217 aa  140  9.999999999999999e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1857  riboflavin synthase subunit alpha  40.87 
 
 
218 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.462262  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 
221 aa  139  3e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1751  riboflavin synthase subunit alpha  40.87 
 
 
218 aa  139  3e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000311618  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2577  riboflavin synthase subunit alpha  40.87 
 
 
218 aa  139  3e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  40.31 
 
 
239 aa  138  3.9999999999999997e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1681  riboflavin synthase subunit alpha  39.6 
 
 
216 aa  138  6e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.665855  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  47.44 
 
 
187 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2390  riboflavin synthase subunit alpha  39.6 
 
 
211 aa  136  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.203472  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3865  riboflavin synthase, alpha subunit  42.25 
 
 
198 aa  136  2e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.0478326 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  43.85 
 
 
207 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1952  riboflavin synthase subunit alpha  39.6 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000576135  normal  0.348603 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  42.25 
 
 
215 aa  135  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2040  riboflavin synthase subunit alpha  39.6 
 
 
206 aa  135  3.0000000000000003e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000661862  normal  0.015006 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2996  riboflavin synthase, alpha subunit  42.78 
 
 
202 aa  135  3.0000000000000003e-31  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.427798  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  40.72 
 
 
201 aa  135  4e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2024  riboflavin synthase subunit alpha  39.6 
 
 
206 aa  135  4e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0115302  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  40.53 
 
 
221 aa  135  5e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2030  riboflavin synthase subunit alpha  38.81 
 
 
204 aa  135  5e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.698686  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  42.25 
 
 
215 aa  134  6.0000000000000005e-31  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  39.57 
 
 
213 aa  134  7.000000000000001e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1227  riboflavin synthase, alpha subunit  39.38 
 
 
202 aa  134  8e-31  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  42.25 
 
 
214 aa  134  8e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2925  riboflavin synthase subunit alpha  39.89 
 
 
215 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2833  riboflavin synthase subunit alpha  39.89 
 
 
215 aa  134  8e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.226498  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1557  riboflavin synthase subunit alpha  40.21 
 
 
197 aa  134  8e-31  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0426247 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00070  riboflavin synthase, alpha subunit  39.04 
 
 
204 aa  134  9e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  40.64 
 
 
214 aa  134  9.999999999999999e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2833  Riboflavin synthase  40.64 
 
 
202 aa  133  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.351084  normal  0.0191477 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2118  riboflavin synthase subunit alpha  38.73 
 
 
210 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00247576  normal  0.0673441 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1383  riboflavin synthase subunit alpha  35.68 
 
 
203 aa  133  9.999999999999999e-31  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.850296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  38.69 
 
 
218 aa  134  9.999999999999999e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  41.49 
 
 
218 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2741  riboflavin synthase subunit alpha  38.83 
 
 
215 aa  133  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003523  lumazine protein  39.3 
 
 
203 aa  133  1.9999999999999998e-30  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.942929  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  41.49 
 
 
218 aa  132  1.9999999999999998e-30  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3417  riboflavin synthase subunit alpha  38.83 
 
 
196 aa  132  3e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.544383  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 
199 aa  132  3.9999999999999996e-30  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2674  riboflavin synthase subunit alpha  38.61 
 
 
211 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1703  riboflavin synthase subunit alpha  38.24 
 
 
204 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.043412  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01560  riboflavin synthase, alpha subunit  40.72 
 
 
204 aa  131  5e-30  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.913253 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01633  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 
213 aa  131  6e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1978  riboflavin synthase, alpha subunit  39.11 
 
 
213 aa  131  6e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000209039  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  38.69 
 
 
217 aa  131  6e-30  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1967  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 
213 aa  131  6e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.756733  hitchhiker  0.00000222488 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2375  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 
213 aa  131  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00364593  normal  0.0367503 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1860  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 
213 aa  131  6e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000205404  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1535  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 
213 aa  131  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0455024  hitchhiker  0.00124186 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1876  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 
213 aa  131  6e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000224926  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1742  riboflavin synthase subunit alpha  39.11 
 
 
213 aa  131  6e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000343227  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01623  hypothetical protein  39.11 
 
 
213 aa  131  6e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  39.89 
 
 
221 aa  131  6.999999999999999e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3463  hypothetical protein  37.97 
 
 
199 aa  131  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02237  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 
203 aa  131  7.999999999999999e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1824  riboflavin synthase subunit alpha  40.64 
 
 
196 aa  130  9e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.326708  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  37.38 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2020  riboflavin synthase subunit alpha  37.56 
 
 
209 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.025182  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2036  riboflavin synthase subunit alpha  37.93 
 
 
203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0357361  hitchhiker  0.00120392 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2267  riboflavin synthase subunit alpha  38.61 
 
 
205 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00496217  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  39.04 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2181  riboflavin synthase subunit alpha  35.12 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000128558  normal  0.0219696 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  40.11 
 
 
216 aa  129  2.0000000000000002e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  36.82 
 
 
218 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3023  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 
214 aa  129  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.20126  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2730  riboflavin synthase subunit alpha  37.77 
 
 
215 aa  129  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.964623 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  40.11 
 
 
217 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2145  riboflavin synthase subunit alpha  35.61 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0110513  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2333  riboflavin synthase subunit alpha  35.12 
 
 
207 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0365218  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  37.77 
 
 
200 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  39.89 
 
 
227 aa  129  3e-29  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  40.96 
 
 
219 aa  129  3e-29  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2296  riboflavin synthase subunit alpha  37.13 
 
 
206 aa  129  3e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  37.23 
 
 
202 aa  129  3e-29  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1227  riboflavin synthase subunit alpha  41.18 
 
 
214 aa  129  3e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00725897 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2252  riboflavin synthase subunit alpha  38.54 
 
 
200 aa  129  4.0000000000000003e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.743387 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0563  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 
192 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  36.82 
 
 
218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2225  riboflavin synthase subunit alpha  35.12 
 
 
207 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00109556  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  42.57 
 
 
217 aa  128  5.0000000000000004e-29  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1868  riboflavin synthase subunit alpha  40.43 
 
 
220 aa  128  5.0000000000000004e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2495  riboflavin synthase subunit alpha  36.63 
 
 
204 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634088  hitchhiker  0.00287874 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2190  riboflavin synthase subunit alpha  38.58 
 
 
216 aa  127  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00893234  hitchhiker  0.00000497991 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0657  riboflavin synthase subunit alpha  37.23 
 
 
207 aa  127  9.000000000000001e-29  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.914639  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  38.5 
 
 
216 aa  127  9.000000000000001e-29  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  39 
 
 
216 aa  127  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  41.29 
 
 
217 aa  127  1.0000000000000001e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1522  riboflavin synthase subunit alpha  37.62 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.301438  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1748  riboflavin synthase subunit alpha  37.62 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000886899  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2107  riboflavin synthase, alpha subunit  39.69 
 
 
207 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  36.32 
 
 
218 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1784  riboflavin synthase subunit alpha  38.42 
 
 
212 aa  127  1.0000000000000001e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999549 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1917  riboflavin synthase subunit alpha  37.62 
 
 
213 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0729931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>