More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0243 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 230 aa  470  1e-132  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  67.69 
 
 		 229 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  67.69 
 
 		 229 aa  320  9.999999999999999e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  56.38 
 
 		 241 aa  274  7e-73  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  60.26 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  58.52 
 
 		 219 aa  245  4.9999999999999997e-64  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  55.36 
 
 		 222 aa  242  3e-63  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  55.65 
 
 		 219 aa  234  1.0000000000000001e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  45.02 
 
 		 217 aa  184  8e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  45.89 
 
 		 217 aa  181  7e-45  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  44.21 
 
 		 219 aa  180  2e-44  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  45.26 
 
 		 218 aa  178  4.999999999999999e-44  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  43.4 
 
 		 222 aa  177  1e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  42.24 
 
 		 220 aa  174  9.999999999999999e-43  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 217 aa  168  5e-41  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  42.42 
 
 		 217 aa  167  1e-40  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  41.23 
 
 		 216 aa  166  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  40.85 
 
 		 221 aa  164  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  42.06 
 
 		 220 aa  165  6.9999999999999995e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1221  riboflavin synthase subunit alpha  41.48 
 
 		 226 aa  164  8e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.464139  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 218 aa  163  2.0000000000000002e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0021  riboflavin synthase, alpha subunit  43.04 
 
 		 207 aa  162  6e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  39.42 
 
 		 239 aa  161  9e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  42.31 
 
 		 217 aa  159  3e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2078  riboflavin synthase, alpha subunit  41.81 
 
 		 216 aa  158  7e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00424988  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  35.93 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3468  riboflavin synthase subunit alpha  35.93 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  35.93 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0879  riboflavin synthase subunit alpha  44.83 
 
 		 200 aa  156  2e-37  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000000888006  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  41.05 
 
 		 216 aa  157  2e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  35.93 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  35.93 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1097  riboflavin synthase subunit alpha  35.93 
 
 		 218 aa  156  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0146706  normal  0.608902 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  35.93 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  38.7 
 
 		 220 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  34.93 
 
 		 219 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  35.93 
 
 		 218 aa  156  3e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  42.23 
 
 		 200 aa  155  5.0000000000000005e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  39.91 
 
 		 216 aa  155  6e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1274  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 220 aa  154  7e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000236102  hitchhiker  0.00000000155009 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  37.34 
 
 		 217 aa  154  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2809  riboflavin synthase subunit alpha  37.66 
 
 		 214 aa  154  9e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1016  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 214 aa  154  1e-36  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 219 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  35.5 
 
 		 218 aa  154  1e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  38.98 
 
 		 221 aa  153  2e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1383  riboflavin synthase subunit alpha  35.34 
 
 		 220 aa  153  2e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00417649  hitchhiker  0.000000386622 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 219 aa  153  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0937  riboflavin synthase, alpha subunit  39.48 
 
 		 217 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4221  riboflavin synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  38.43 
 
 		 215 aa  153  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  36.32 
 
 		 221 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38.26 
 
 		 218 aa  152  4e-36  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  39.06 
 
 		 221 aa  152  4e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  39.04 
 
 		 216 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 220 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  36.59 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  37.23 
 
 		 217 aa  150  2e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0386  riboflavin synthase subunit alpha  37.72 
 
 		 214 aa  149  3e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  41.7 
 
 		 216 aa  149  3e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 219 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  35.65 
 
 		 217 aa  149  4e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  39.13 
 
 		 221 aa  148  6e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2238  riboflavin synthase subunit alpha  37.28 
 
 		 215 aa  148  6e-35  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  37.99 
 
 		 220 aa  148  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  39.04 
 
 		 221 aa  148  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3942  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 214 aa  148  8e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  37.99 
 
 		 220 aa  148  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1421  riboflavin synthase subunit alpha  40.6 
 
 		 220 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00972231  normal  0.185271 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0547  riboflavin synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 217 aa  147  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0531  riboflavin synthase subunit alpha  37.55 
 
 		 217 aa  146  2.0000000000000003e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.990747  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  39.3 
 
 		 213 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1620  riboflavin synthase subunit alpha  37.5 
 
 		 224 aa  146  3e-34  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2448  riboflavin synthase subunit alpha  40.85 
 
 		 217 aa  146  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  38.86 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  38.92 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  38.92 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0061  riboflavin synthase subunit alpha  38.82 
 
 		 218 aa  145  4.0000000000000006e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.201459  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  37.39 
 
 		 227 aa  144  9e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02325  riboflavin synthase alpha chain  40.19 
 
 		 198 aa  144  1e-33  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2092  riboflavin synthase subunit alpha  40.91 
 
 		 187 aa  144  2e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0540242  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  41.71 
 
 		 199 aa  143  2e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  33.91 
 
 		 221 aa  143  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  37.24 
 
 		 214 aa  142  3e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0916  riboflavin synthase subunit alpha  36.44 
 
 		 217 aa  142  3e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00048096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  41.04 
 
 		 200 aa  142  6e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1765  riboflavin synthase, alpha subunit  41.59 
 
 		 214 aa  141  7e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  41.51 
 
 		 208 aa  141  8e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4180  riboflavin synthase subunit alpha  36.68 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2120  riboflavin synthase subunit alpha  40.93 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1875  riboflavin synthase subunit alpha  41.75 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.816365 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  35.81 
 
 		 216 aa  141  9.999999999999999e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  39.81 
 
 		 209 aa  140  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4244  riboflavin synthase subunit alpha  36.68 
 
 		 214 aa  140  9.999999999999999e-33  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>