More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_06371 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008820  P9303_06371  riboflavin synthase subunit alpha  100 
 
 		 220 aa  442  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0855264 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0604  riboflavin synthase subunit alpha  68.02 
 
 		 222 aa  291  4e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.128519  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1758  riboflavin synthase subunit alpha  65.91 
 
 		 218 aa  286  2e-76  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1773  riboflavin synthase subunit alpha  53.42 
 
 		 217 aa  253  2.0000000000000002e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0488322  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04961  riboflavin synthase subunit alpha  53.42 
 
 		 217 aa  251  4.0000000000000004e-66  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.184408 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04391  riboflavin synthase subunit alpha  56.36 
 
 		 221 aa  247  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04971  riboflavin synthase subunit alpha  47.96 
 
 		 217 aa  222  4e-57  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.372947  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0441  riboflavin synthase subunit alpha  47.56 
 
 		 217 aa  221  6e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0861062  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04661  riboflavin synthase subunit alpha  47.51 
 
 		 217 aa  220  9.999999999999999e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05041  riboflavin synthase subunit alpha  45.21 
 
 		 219 aa  218  5e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.0423095  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4388  riboflavin synthase, alpha subunit  48.21 
 
 		 222 aa  184  6e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.321802 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1624  riboflavin synthase subunit alpha  44.89 
 
 		 219 aa  174  8e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.137296  normal  0.0697591 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1220  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1250  riboflavin synthase subunit alpha  43.35 
 
 		 229 aa  174  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00577515 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1416  riboflavin synthase subunit alpha  43.56 
 
 		 219 aa  172  2.9999999999999996e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.682137  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0243  riboflavin synthase subunit alpha  42.06 
 
 		 230 aa  165  5.9999999999999996e-40  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.13114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1657  riboflavin synthase subunit alpha  44.74 
 
 		 219 aa  162  5.0000000000000005e-39  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.389961  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1399  riboflavin synthase subunit alpha  43.36 
 
 		 221 aa  162  5.0000000000000005e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.706898  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0376  riboflavin synthase subunit alpha  46.26 
 
 		 221 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0815037 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1884  riboflavin synthase, alpha subunit  45.18 
 
 		 227 aa  160  2e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.219798  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2762  riboflavin synthase subunit alpha  40.97 
 
 		 225 aa  160  2e-38  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2569  riboflavin synthase subunit alpha  41.74 
 
 		 241 aa  159  2e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977102  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1560  riboflavin synthase, alpha subunit  45.49 
 
 		 220 aa  159  4e-38  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1379  riboflavin synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 220 aa  158  7e-38  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04399  riboflavin synthase subunit alpha  48 
 
 		 200 aa  157  9e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1446  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 216 aa  155  4e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1254  riboflavin synthase subunit alpha  47 
 
 		 209 aa  155  7e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1522  riboflavin synthase, alpha subunit  41.26 
 
 		 217 aa  154  7e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01419  riboflavin synthase subunit alpha  41.59 
 
 		 220 aa  154  8e-37  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000127826  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0624  riboflavin synthase subunit alpha  42.86 
 
 		 215 aa  154  9e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00110444  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1981  riboflavin synthase subunit alpha  44 
 
 		 216 aa  154  1e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3856  riboflavin synthase subunit alpha  41.41 
 
 		 220 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0581  riboflavin synthase subunit alpha  45.54 
 
 		 208 aa  152  5e-36  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.323672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0397  riboflavin synthase subunit alpha  43.61 
 
 		 216 aa  151  8.999999999999999e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.174246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2189  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 201 aa  150  1e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000572802 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2005  riboflavin synthase subunit alpha  38.84 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0140108  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1441  riboflavin synthase subunit alpha  37.17 
 
 		 220 aa  150  2e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3478  riboflavin synthase, alpha subunit  48.26 
 
 		 200 aa  149  3e-35  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0244211  normal  0.131699 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0775  riboflavin synthase subunit alpha  43.81 
 
 		 209 aa  149  4e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.509273  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2299  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 221 aa  149  4e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.433385  hitchhiker  0.00000264198 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1868  riboflavin synthase, alpha subunit  45.85 
 
 		 216 aa  149  4e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0165858  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06730  riboflavin synthase subunit alpha  40.97 
 
 		 219 aa  148  6e-35  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1078  riboflavin synthase subunit alpha  48.77 
 
 		 205 aa  148  7e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0714  riboflavin synthase subunit alpha  44.61 
 
 		 217 aa  148  8e-35  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.854328  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4461  riboflavin synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 220 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.770295  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1188  riboflavin synthase subunit alpha  40.61 
 
 		 221 aa  146  2.0000000000000003e-34  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0484679  normal  0.881373 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11410  riboflavin synthase subunit alpha  40.97 
 
 		 219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.593747  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0474  riboflavin synthase, alpha subunit  46.04 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000469056 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0298  riboflavin synthase, alpha subunit  46.04 
 
 		 218 aa  146  3e-34  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1046  riboflavin synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 219 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1595  riboflavin synthase subunit alpha  47.21 
 
 		 213 aa  146  3e-34  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000438085  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5018  riboflavin synthase subunit alpha  40.97 
 
 		 220 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.393051 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2097  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 199 aa  145  5e-34  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0312217  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1312  riboflavin synthase subunit alpha  38.94 
 
 		 221 aa  145  5e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.903669  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2693  riboflavin synthase subunit alpha  45.96 
 
 		 205 aa  145  5e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0747  riboflavin synthase subunit alpha  40.18 
 
 		 216 aa  145  6e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.341199  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1163  riboflavin synthase subunit alpha  38.77 
 
 		 221 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000497127  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1541  riboflavin synthase subunit alpha  45.45 
 
 		 209 aa  144  9e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1689  riboflavin synthase subunit alpha  43.36 
 
 		 217 aa  144  1e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.1872  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0167  riboflavin synthase subunit alpha  46 
 
 		 223 aa  143  2e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1017  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 217 aa  143  2e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.743536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1304  riboflavin synthase, alpha subunit  44.5 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.851086  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004264  riboflavin synthase alpha chain  38.86 
 
 		 217 aa  142  4e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000121594  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1625  riboflavin synthase subunit alpha  42.67 
 
 		 216 aa  142  4e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00676611  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18150  riboflavin synthase, alpha subunit  46.5 
 
 		 200 aa  142  4e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1145  riboflavin synthase subunit alpha  42.16 
 
 		 217 aa  142  5e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000276723  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1372  riboflavin synthase subunit alpha  46.97 
 
 		 199 aa  142  5e-33  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.336061  normal  0.17313 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1073  riboflavin synthase subunit alpha  40.7 
 
 		 215 aa  142  5e-33  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_07100  riboflavin synthase, alpha subunit  39.04 
 
 		 223 aa  141  6e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.283211 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2777  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 218 aa  141  6e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0829317  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2689  riboflavin synthase subunit alpha  44.17 
 
 		 210 aa  141  6e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0123  riboflavin synthase, alpha subunit  40.5 
 
 		 239 aa  141  6e-33  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1036  riboflavin synthase subunit alpha  39.47 
 
 		 219 aa  142  6e-33  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00015592  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0820  riboflavin synthase subunit alpha  42.33 
 
 		 209 aa  141  6e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0663  riboflavin synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.197144 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0707  riboflavin synthase subunit alpha  43.27 
 
 		 217 aa  141  7e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0752596  normal  0.720466 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0515  riboflavin synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0561  riboflavin synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0550  riboflavin synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 221 aa  141  8e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4095  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 197 aa  140  9.999999999999999e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2024  riboflavin synthase subunit alpha  45.27 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3159  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00317838  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0009  riboflavin synthase subunit alpha  45.23 
 
 		 208 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1212  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.254692 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0568  riboflavin synthase subunit alpha  39.65 
 
 		 221 aa  140  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3916  riboflavin synthase subunit alpha  46.23 
 
 		 202 aa  141  9.999999999999999e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2182  riboflavin synthase subunit alpha  42.22 
 
 		 215 aa  140  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000398274  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3302  riboflavin synthase subunit alpha  43.72 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.121431  decreased coverage  0.000098078 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3158  riboflavin synthase subunit alpha  43.22 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00280959  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11441  riboflavin synthase subunit alpha  46.04 
 
 		 201 aa  139  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.370285 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0691  riboflavin synthase, alpha subunit  40.09 
 
 		 220 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15720  riboflavin synthase, alpha subunit  43.48 
 
 		 208 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0829  riboflavin synthase subunit alpha  42.65 
 
 		 209 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2809  riboflavin synthase subunit alpha  39.38 
 
 		 214 aa  139  3e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.352562  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0625  riboflavin synthase subunit alpha  40.71 
 
 		 219 aa  139  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.0000525495  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1097  riboflavin synthase subunit alpha  40.26 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0107827  normal  0.803042 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1163  riboflavin synthase subunit alpha  40.26 
 
 		 218 aa  139  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.166605  normal  0.121939 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0105  riboflavin synthase subunit alpha  35.56 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01167  riboflavin synthase subunit alpha  38.86 
 
 		 217 aa  139  3.9999999999999997e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3457  riboflavin synthase subunit alpha  40.53 
 
 		 220 aa  139  3.9999999999999997e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00766476 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>