110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daud_1675 on replicon NC_010424
Organism: Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010424  Daud_1675  UvrD/REP helicase family protein  100 
 
 		 212 aa  437  9.999999999999999e-123  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0387557  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1603  UvrD/REP helicase  43 
 
 		 641 aa  156  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0047  UvrD/REP helicase family protein  46.57 
 
 		 634 aa  141  6e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3526  hypothetical protein  41.31 
 
 		 617 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.396406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3192  UvrD/REP helicase  40.59 
 
 		 615 aa  132  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0195  UvrD/REP helicase family protein  39.39 
 
 		 614 aa  114  8.999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2953  UvrD/REP helicase  36.41 
 
 		 615 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3174  UvrD/REP helicase  54.08 
 
 		 557 aa  102  4e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06202  hypothetical protein  51.4 
 
 		 163 aa  97.4  1e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3681  helicase, putative  51.52 
 
 		 552 aa  95.9  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4279  UvrD/REP helicase  61.04 
 
 		 556 aa  95.9  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2560  UvrD/REP helicase  62.34 
 
 		 553 aa  95.5  5e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.232934 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4419  UvrD/REP helicase  61.04 
 
 		 556 aa  95.5  5e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4275  UvrD/REP helicase  61.04 
 
 		 554 aa  90.9  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0143761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  36.78 
 
 		 754 aa  54.3  0.000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  51.92 
 
 		 1349 aa  53.5  0.000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  34.67 
 
 		 699 aa  53.1  0.000003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  34.21 
 
 		 946 aa  52  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  34.21 
 
 		 946 aa  52  0.000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.1 
 
 		 694 aa  48.9  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.86 
 
 		 730 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.86 
 
 		 730 aa  48.5  0.00007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  40.68 
 
 		 768 aa  47.8  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  37.93 
 
 		 749 aa  46.6  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.9 
 
 		 1094 aa  47  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  44.44 
 
 		 634 aa  46.6  0.0003  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  42.37 
 
 		 657 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  41.38 
 
 		 1120 aa  45.8  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1758  UvrD/REP helicase  43.86 
 
 		 1244 aa  45.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  38.89 
 
 		 779 aa  45.1  0.0008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  42.31 
 
 		 1106 aa  45.1  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  42.03 
 
 		 757 aa  44.7  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1822  UvrD/REP helicase  35.29 
 
 		 978 aa  44.7  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.475  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  45.45 
 
 		 773 aa  44.3  0.001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  43.1 
 
 		 746 aa  45.1  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0290  UvrD family helicase  34.25 
 
 		 1010 aa  44.7  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.79 
 
 		 640 aa  44.7  0.001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  37.93 
 
 		 764 aa  44.3  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2478  UvrD/REP helicase  41.07 
 
 		 917 aa  44.3  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  32.95 
 
 		 1103 aa  44.7  0.001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.1 
 
 		 864 aa  44.7  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  27.86 
 
 		 685 aa  43.9  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  42.11 
 
 		 754 aa  43.5  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0232  UvrD/REP helicase  43.86 
 
 		 702 aa  43.5  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  38.98 
 
 		 1164 aa  43.9  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_008759  Pnap_4961  UvrD/REP helicase  36.49 
 
 		 914 aa  43.5  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.287732 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  38.89 
 
 		 648 aa  43.5  0.002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  44.83 
 
 		 851 aa  43.5  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  42 
 
 		 706 aa  43.9  0.002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  38.89 
 
 		 648 aa  43.5  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  31.34 
 
 		 666 aa  43.5  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.38 
 
 		 837 aa  43.5  0.002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.81 
 
 		 1090 aa  43.5  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0453  UvrD/REP helicase  35.53 
 
 		 681 aa  44.3  0.002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.611277  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  41.38 
 
 		 1192 aa  43.5  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0283  UvrD/REP helicase  43.14 
 
 		 725 aa  43.1  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.638383  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  38.33 
 
 		 1144 aa  43.5  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.1 
 
 		 757 aa  43.5  0.003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  35.14 
 
 		 684 aa  43.5  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.38 
 
 		 747 aa  42.7  0.003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  40.35 
 
 		 1128 aa  43.1  0.003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.33 
 
 		 858 aa  43.1  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1572  UvrD/REP helicase  35.29 
 
 		 972 aa  43.1  0.003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.202848  normal  0.0502334 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3121  UvrD/REP helicase  43.4 
 
 		 1033 aa  43.1  0.003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.33 
 
 		 833 aa  43.1  0.003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  43.4 
 
 		 1119 aa  43.1  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  42.31 
 
 		 1108 aa  42.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1474  DNA helicase IV  36.49 
 
 		 684 aa  42.7  0.004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.575734  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0721  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 656 aa  42.7  0.004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2233  ATP-dependent DNA helicase  35.29 
 
 		 658 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  35.29 
 
 		 658 aa  42.7  0.004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  47.06 
 
 		 726 aa  42.7  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00966  DNA helicase IV  35.14 
 
 		 684 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0970992  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2681  UvrD/REP helicase  35.14 
 
 		 684 aa  42.4  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.66 
 
 		 729 aa  42.4  0.005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1347  rep helicase, single-stranded DNA-dependent ATPase protein  39.22 
 
 		 154 aa  42.4  0.005  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  36.59 
 
 		 689 aa  42.4  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_51012  protein required for proper timing of committment to meiotic recombination and the transition from Meiosis I to Meiosis II  38.18 
 
 		 908 aa  42.4  0.005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.875639  normal  0.91244 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5901  UvrD/REP helicase  41.51 
 
 		 689 aa  42.4  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0361362  normal  0.5857 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1071  DNA helicase IV  35.14 
 
 		 684 aa  42.4  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000145038  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1077  DNA helicase IV  35.14 
 
 		 684 aa  42.4  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000255278  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2634  DNA helicase IV  35.14 
 
 		 684 aa  42.4  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.46085  hitchhiker  0.000000654371 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2157  DNA helicase IV  35.14 
 
 		 684 aa  42.4  0.005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00794949  normal  0.209046 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2353  DNA helicase IV  35.14 
 
 		 684 aa  42.4  0.005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.757014  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1126  DNA helicase IV  35.14 
 
 		 684 aa  42.4  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.440253  normal  0.367013 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00973  hypothetical protein  35.14 
 
 		 684 aa  42.4  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.132374  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.33 
 
 		 896 aa  42.4  0.005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7513  ATP-dependent DNA helicase Rep  43.14 
 
 		 686 aa  42  0.006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.556127  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  41.07 
 
 		 785 aa  42  0.006  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  36.23 
 
 		 1469 aa  42  0.007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC06510  ATP-dependent DNA helicase pcra, putative  33.82 
 
 		 982 aa  42  0.007  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.6 
 
 		 751 aa  42  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  38.6 
 
 		 751 aa  42  0.007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.1 
 
 		 795 aa  42  0.007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  43.33 
 
 		 857 aa  42  0.007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4751  UvrD/REP helicase family protein  29.73 
 
 		 907 aa  41.6  0.008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.736825  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  34.94 
 
 		 1715 aa  42  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  34.04 
 
 		 658 aa  41.6  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  33.72 
 
 		 755 aa  41.6  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  40.38 
 
 		 1150 aa  41.6  0.009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>