More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3821 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  39.28 
 
 		 1103 aa  656    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  42.23 
 
 		 1101 aa  667    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.42 
 
 		 1111 aa  699    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  43.14 
 
 		 1111 aa  698    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  48.04 
 
 		 1162 aa  843    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.76 
 
 		 1090 aa  700    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  62.33 
 
 		 1108 aa  1273    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1150 aa  2260    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  41.81 
 
 		 1130 aa  666    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  44.96 
 
 		 1120 aa  709    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  56.17 
 
 		 1128 aa  1055    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  43.23 
 
 		 1162 aa  681    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  48.46 
 
 		 1144 aa  854    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  42.36 
 
 		 1091 aa  694    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  42.13 
 
 		 1091 aa  663    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  43.07 
 
 		 1192 aa  686    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  42.14 
 
 		 1091 aa  692    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  57.25 
 
 		 1228 aa  825    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  56.11 
 
 		 1128 aa  1048    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  39.58 
 
 		 1124 aa  649    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  41.98 
 
 		 1183 aa  694    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  42.8 
 
 		 1167 aa  681    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  43.89 
 
 		 1164 aa  712    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  44.5 
 
 		 1106 aa  714    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  42.36 
 
 		 1091 aa  694    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  41.38 
 
 		 1119 aa  670    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  39.56 
 
 		 1073 aa  629  1e-179  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  41.43 
 
 		 1086 aa  612  1e-173  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  40.62 
 
 		 1088 aa  602  1e-170  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  44.28 
 
 		 1041 aa  568  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  43.33 
 
 		 1349 aa  567  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.95 
 
 		 1176 aa  563  1e-158  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  40.53 
 
 		 1136 aa  557  1e-157  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.32 
 
 		 1094 aa  544  1e-153  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  47.4 
 
 		 1128 aa  538  1e-151  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.47 
 
 		 1119 aa  536  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  30.72 
 
 		 1343 aa  240  1e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  24.76 
 
 		 1397 aa  182  2.9999999999999997e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.39 
 
 		 754 aa  174  6.999999999999999e-42  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.19 
 
 		 729 aa  172  3e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.47 
 
 		 786 aa  171  5e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.58 
 
 		 833 aa  171  6e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.8 
 
 		 715 aa  170  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.92 
 
 		 773 aa  168  5e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.49 
 
 		 785 aa  167  6.9999999999999995e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.39 
 
 		 729 aa  167  8e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.38 
 
 		 781 aa  163  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.92 
 
 		 858 aa  164  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  26.57 
 
 		 762 aa  164  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.38 
 
 		 781 aa  163  2e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  25.83 
 
 		 736 aa  163  2e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  25.19 
 
 		 696 aa  162  3e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.2 
 
 		 751 aa  161  6e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  24.78 
 
 		 634 aa  161  7e-38  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.06 
 
 		 1019 aa  161  8e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.25 
 
 		 711 aa  161  8e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.46 
 
 		 751 aa  161  8e-38  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.47 
 
 		 662 aa  160  1e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  26.22 
 
 		 768 aa  160  1e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.25 
 
 		 829 aa  160  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.39 
 
 		 677 aa  160  2e-37  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  23.24 
 
 		 638 aa  159  3e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.53 
 
 		 741 aa  158  4e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.4 
 
 		 742 aa  158  6e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.52 
 
 		 781 aa  158  6e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.5 
 
 		 830 aa  158  6e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.55 
 
 		 797 aa  158  6e-37  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  23.19 
 
 		 625 aa  157  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  25.63 
 
 		 743 aa  157  9e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.95 
 
 		 759 aa  156  2e-36  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  27.73 
 
 		 707 aa  156  2e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.22 
 
 		 857 aa  157  2e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.33 
 
 		 831 aa  156  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  26.34 
 
 		 798 aa  156  2e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.67 
 
 		 737 aa  156  2e-36  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3865  UvrD/REP helicase  26.95 
 
 		 689 aa  156  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.322714 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3138  UvrD/REP helicase  26.95 
 
 		 689 aa  155  2.9999999999999998e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.527942  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.24 
 
 		 730 aa  156  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.97 
 
 		 765 aa  156  2.9999999999999998e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.24 
 
 		 730 aa  156  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.33 
 
 		 795 aa  155  2.9999999999999998e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  25.25 
 
 		 728 aa  155  4e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25.9 
 
 		 678 aa  155  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.02 
 
 		 732 aa  155  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 		 706 aa  155  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  26.96 
 
 		 1180 aa  155  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.15 
 
 		 838 aa  154  5.9999999999999996e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  25.1 
 
 		 728 aa  155  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  23.18 
 
 		 666 aa  154  7e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  29.29 
 
 		 715 aa  154  8e-36  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.38 
 
 		 1016 aa  154  8e-36  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.33 
 
 		 858 aa  154  8.999999999999999e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  23.93 
 
 		 789 aa  154  1e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  24.11 
 
 		 714 aa  154  1e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  29.78 
 
 		 1060 aa  154  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  24.54 
 
 		 744 aa  153  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  26.65 
 
 		 705 aa  153  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.8 
 
 		 849 aa  153  2e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  22.48 
 
 		 735 aa  153  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3000  UvrD/REP helicase  25.78 
 
 		 731 aa  153  2e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.120838 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>