More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1172 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  51.64 
 
 		 1192 aa  876    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.56 
 
 		 1119 aa  651    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  46.52 
 
 		 1167 aa  790    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.36 
 
 		 1094 aa  654    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  47.67 
 
 		 1108 aa  802    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  49.79 
 
 		 1144 aa  840    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  47.23 
 
 		 1128 aa  777    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  52.62 
 
 		 1162 aa  915    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  47.17 
 
 		 1150 aa  778    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  49.96 
 
 		 1136 aa  797    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  50.13 
 
 		 1162 aa  829    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  44.24 
 
 		 1119 aa  728    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  45.63 
 
 		 1106 aa  698    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  45.31 
 
 		 1111 aa  681    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  43.66 
 
 		 1091 aa  681    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.58 
 
 		 1176 aa  690    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  48.94 
 
 		 1120 aa  767    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  48.89 
 
 		 1128 aa  816    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  44.89 
 
 		 1101 aa  670    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  46.2 
 
 		 1183 aa  801    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1128 aa  2158    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  45.37 
 
 		 1164 aa  757    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  49.87 
 
 		 1111 aa  889    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  43.66 
 
 		 1091 aa  681    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  46.83 
 
 		 1090 aa  705    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  44.6 
 
 		 1103 aa  820    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  45.8 
 
 		 1041 aa  725    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  43.72 
 
 		 1091 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  43.07 
 
 		 1091 aa  657    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  44.07 
 
 		 1130 aa  632  1e-179  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  43.63 
 
 		 1086 aa  632  1e-179  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  48.16 
 
 		 1228 aa  624  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  39.56 
 
 		 1124 aa  598  1e-169  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  44.04 
 
 		 1088 aa  591  1e-167  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  46.9 
 
 		 1349 aa  570  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  38.7 
 
 		 1073 aa  547  1e-154  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  31.29 
 
 		 1343 aa  303  1e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.25 
 
 		 785 aa  184  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  30.5 
 
 		 1044 aa  183  2e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.65 
 
 		 763 aa  182  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  26.47 
 
 		 665 aa  181  9e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.43 
 
 		 729 aa  180  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  28.76 
 
 		 1397 aa  180  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.82 
 
 		 773 aa  177  9e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.19 
 
 		 1019 aa  177  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  29.94 
 
 		 659 aa  177  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.07 
 
 		 732 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2724  UvrD/REP helicase  26.78 
 
 		 678 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.76 
 
 		 715 aa  174  5.999999999999999e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.45 
 
 		 1023 aa  174  1e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  23.57 
 
 		 625 aa  171  5e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  25.82 
 
 		 735 aa  171  9e-41  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.6 
 
 		 729 aa  171  1e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25.56 
 
 		 678 aa  170  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.62 
 
 		 858 aa  169  2e-40  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  29.29 
 
 		 1177 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.19 
 
 		 730 aa  169  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.19 
 
 		 730 aa  169  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  28.74 
 
 		 1143 aa  169  4e-40  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.4 
 
 		 725 aa  168  5e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.27 
 
 		 737 aa  168  5.9999999999999996e-40  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  27.96 
 
 		 798 aa  167  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  24.65 
 
 		 741 aa  166  2.0000000000000002e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  28.14 
 
 		 795 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.23 
 
 		 741 aa  166  3e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.13 
 
 		 833 aa  166  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.59 
 
 		 753 aa  166  3e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.81 
 
 		 753 aa  166  3e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  27.25 
 
 		 705 aa  165  4.0000000000000004e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  24.65 
 
 		 735 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.8 
 
 		 829 aa  165  4.0000000000000004e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.25 
 
 		 838 aa  165  4.0000000000000004e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  25.86 
 
 		 845 aa  165  4.0000000000000004e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 		 646 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  25.6 
 
 		 900 aa  164  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.01 
 
 		 765 aa  164  8.000000000000001e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  23.75 
 
 		 672 aa  164  8.000000000000001e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  25.7 
 
 		 736 aa  164  9e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.55 
 
 		 747 aa  164  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  26.71 
 
 		 739 aa  164  1e-38  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.35 
 
 		 751 aa  162  2e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  23.47 
 
 		 753 aa  163  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  23.47 
 
 		 751 aa  162  2e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  28.98 
 
 		 682 aa  163  2e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.33 
 
 		 747 aa  162  2e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3376  UvrD/REP helicase  28.26 
 
 		 659 aa  163  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.47 
 
 		 751 aa  163  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.08 
 
 		 670 aa  163  2e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 		 728 aa  163  2e-38  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.74 
 
 		 734 aa  162  2e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  25.68 
 
 		 721 aa  163  2e-38  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  27.96 
 
 		 795 aa  162  3e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.2 
 
 		 786 aa  162  4e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  27.59 
 
 		 726 aa  161  7e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  26.57 
 
 		 706 aa  160  9e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.51 
 
 		 751 aa  160  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.51 
 
 		 747 aa  160  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  25.98 
 
 		 744 aa  160  1e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  27.93 
 
 		 760 aa  160  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.84 
 
 		 724 aa  159  2e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>