More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4130 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  51.09 
 
 		 1041 aa  882    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  45.71 
 
 		 1119 aa  799    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  48.66 
 
 		 1150 aa  854    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  92.54 
 
 		 1144 aa  1952    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  45.83 
 
 		 1091 aa  755    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  49.66 
 
 		 1128 aa  847    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  47.18 
 
 		 1228 aa  636    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  51.14 
 
 		 1108 aa  932    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  49.47 
 
 		 1090 aa  821    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.24 
 
 		 1111 aa  711    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  50.17 
 
 		 1128 aa  771    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  48.08 
 
 		 1111 aa  810    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  50.94 
 
 		 1128 aa  898    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  45.02 
 
 		 1130 aa  668    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  46.8 
 
 		 1091 aa  764    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  43.04 
 
 		 1167 aa  672    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  41.02 
 
 		 1124 aa  682    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  47.05 
 
 		 1192 aa  741    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  46.81 
 
 		 1106 aa  753    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  43.48 
 
 		 1103 aa  716    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  42.42 
 
 		 1183 aa  680    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  51.27 
 
 		 1120 aa  840    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  46.86 
 
 		 1164 aa  797    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  46.86 
 
 		 1162 aa  728    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  46.8 
 
 		 1091 aa  764    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  46.48 
 
 		 1086 aa  706    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  48.28 
 
 		 1349 aa  650    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  46.96 
 
 		 1101 aa  753    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  46.89 
 
 		 1091 aa  765    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1162 aa  2245    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.04 
 
 		 1176 aa  621  1e-176  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  42.81 
 
 		 1088 aa  618  1e-175  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  41.25 
 
 		 1073 aa  617  1e-175  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  44.07 
 
 		 1136 aa  615  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.88 
 
 		 1094 aa  562  1e-158  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.18 
 
 		 1119 aa  531  1e-149  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  29.72 
 
 		 1343 aa  249  3e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.12 
 
 		 715 aa  199  2.0000000000000003e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  26.42 
 
 		 900 aa  190  1e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.62 
 
 		 729 aa  188  5e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  22.4 
 
 		 698 aa  183  2e-44  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.04 
 
 		 795 aa  183  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  27.31 
 
 		 705 aa  182  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  23.84 
 
 		 724 aa  182  4e-44  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.46 
 
 		 754 aa  181  4.999999999999999e-44  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  31 
 
 		 1059 aa  181  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.65 
 
 		 1023 aa  180  1e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.89 
 
 		 794 aa  180  1e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  25.24 
 
 		 678 aa  179  2e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  28.21 
 
 		 1397 aa  179  3e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  29.3 
 
 		 1180 aa  178  5e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.93 
 
 		 741 aa  178  6e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 678 aa  177  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  26.51 
 
 		 848 aa  177  9.999999999999999e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26 
 
 		 737 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.69 
 
 		 831 aa  175  5e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.08 
 
 		 858 aa  175  5e-42  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  28.86 
 
 		 759 aa  174  7.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.68 
 
 		 765 aa  174  9e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.34 
 
 		 1019 aa  174  1e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  26.42 
 
 		 723 aa  174  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  33.21 
 
 		 1074 aa  172  3e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.22 
 
 		 833 aa  172  3e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.38 
 
 		 751 aa  172  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.97 
 
 		 773 aa  172  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 707 aa  172  5e-41  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.96 
 
 		 725 aa  171  6e-41  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03230  DNA-dependent helicase II  27.13 
 
 		 728 aa  171  8e-41  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  25.42 
 
 		 678 aa  171  9e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  26.76 
 
 		 720 aa  171  9e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  31.76 
 
 		 1044 aa  171  9e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.9 
 
 		 829 aa  171  9e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.49 
 
 		 837 aa  171  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.81 
 
 		 751 aa  170  1e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  27 
 
 		 720 aa  171  1e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 		 768 aa  169  2e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  25.5 
 
 		 789 aa  170  2e-40  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.31 
 
 		 786 aa  170  2e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  32.81 
 
 		 659 aa  169  2.9999999999999998e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.21 
 
 		 830 aa  169  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.97 
 
 		 781 aa  168  4e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  22.11 
 
 		 731 aa  168  5e-40  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.71 
 
 		 858 aa  168  5e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  28.03 
 
 		 728 aa  168  5.9999999999999996e-40  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  27.38 
 
 		 721 aa  168  6.9999999999999995e-40  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  22.19 
 
 		 625 aa  167  6.9999999999999995e-40  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.88 
 
 		 763 aa  167  8e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.09 
 
 		 718 aa  167  8e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.76 
 
 		 713 aa  167  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  21.75 
 
 		 785 aa  167  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.8 
 
 		 734 aa  167  1.0000000000000001e-39  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  26.03 
 
 		 720 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  22.62 
 
 		 666 aa  166  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.57 
 
 		 817 aa  166  2.0000000000000002e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.84 
 
 		 756 aa  166  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.14 
 
 		 851 aa  166  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.49 
 
 		 732 aa  166  4.0000000000000004e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  26.79 
 
 		 728 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  22.92 
 
 		 735 aa  165  6e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 		 672 aa  165  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>