More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2756 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  43.26 
 
 
1162 aa  721    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.76 
 
 
1111 aa  680    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.45 
 
 
1176 aa  809    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  41.72 
 
 
1162 aa  643    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  42.69 
 
 
1128 aa  660    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  42.13 
 
 
1144 aa  677    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  100 
 
 
1183 aa  2345    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  74.94 
 
 
1167 aa  1660    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  42.24 
 
 
1128 aa  696    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  42.15 
 
 
1150 aa  648    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  41.34 
 
 
1120 aa  615  9.999999999999999e-175  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  41.26 
 
 
1136 aa  614  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  38.19 
 
 
1164 aa  611  1e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  38.16 
 
 
1119 aa  598  1e-169  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.31 
 
 
1090 aa  595  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 
1111 aa  573  1.0000000000000001e-162  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  39.46 
 
 
1101 aa  571  1e-161  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  38.84 
 
 
1091 aa  568  1e-160  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  38.84 
 
 
1091 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.78 
 
 
1094 aa  565  1.0000000000000001e-159  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  38.84 
 
 
1091 aa  565  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  48.45 
 
 
1128 aa  557  1e-157  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  37.43 
 
 
1130 aa  557  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  38.14 
 
 
1106 aa  556  1e-157  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  37.28 
 
 
1124 aa  551  1e-155  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  38.38 
 
 
1091 aa  541  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  43.13 
 
 
1192 aa  536  1e-150  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.51 
 
 
1228 aa  535  1e-150  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  42.65 
 
 
1108 aa  532  1e-149  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.49 
 
 
1119 aa  527  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  41.67 
 
 
1103 aa  522  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  38.26 
 
 
1088 aa  518  1.0000000000000001e-145  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  38.22 
 
 
1086 aa  514  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  41.54 
 
 
1041 aa  506  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  40.93 
 
 
1073 aa  446  1e-123  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  37.43 
 
 
1349 aa  416  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  29.84 
 
 
1343 aa  259  2e-67  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.47 
 
 
729 aa  189  3e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  28.09 
 
 
1397 aa  183  1e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.17 
 
 
785 aa  182  4e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.2 
 
 
730 aa  181  7e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  28.93 
 
 
1177 aa  180  2e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.07 
 
 
857 aa  179  3e-43  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.26 
 
 
729 aa  177  9.999999999999999e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.64 
 
 
732 aa  177  9.999999999999999e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  29.18 
 
 
1180 aa  177  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.98 
 
 
730 aa  176  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.98 
 
 
730 aa  176  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.56 
 
 
743 aa  174  1e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.87 
 
 
1019 aa  171  6e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.34 
 
 
725 aa  170  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.19 
 
 
741 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.55 
 
 
715 aa  166  2.0000000000000002e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.3 
 
 
754 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.1 
 
 
837 aa  165  5.0000000000000005e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.6 
 
 
838 aa  164  7e-39  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.45 
 
 
757 aa  164  8.000000000000001e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.36 
 
 
795 aa  162  3e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.78 
 
 
751 aa  162  3e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.6 
 
 
747 aa  162  4e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.85 
 
 
751 aa  161  5e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  24.85 
 
 
753 aa  161  5e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.35 
 
 
753 aa  162  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.35 
 
 
753 aa  162  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.6 
 
 
751 aa  161  6e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  24.6 
 
 
751 aa  161  7e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.04 
 
 
747 aa  161  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  26.48 
 
 
739 aa  160  1e-37  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.78 
 
 
751 aa  160  1e-37  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.47 
 
 
741 aa  160  1e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.48 
 
 
747 aa  159  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.71 
 
 
830 aa  159  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.21 
 
 
851 aa  159  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.72 
 
 
751 aa  159  3e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.27 
 
 
718 aa  159  3e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  21.92 
 
 
735 aa  159  3e-37  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 
744 aa  159  4e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  26.01 
 
 
743 aa  159  4e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 
794 aa  159  4e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.37 
 
 
748 aa  158  6e-37  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.2 
 
 
896 aa  157  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 
742 aa  157  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.5 
 
 
755 aa  156  2e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.49 
 
 
858 aa  156  2e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  26.68 
 
 
671 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.81 
 
 
831 aa  156  2e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  26.68 
 
 
671 aa  156  2e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  26.35 
 
 
707 aa  155  2.9999999999999998e-36  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  25.69 
 
 
768 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.9 
 
 
768 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25.37 
 
 
678 aa  155  5e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.97 
 
 
673 aa  154  8e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.58 
 
 
671 aa  154  1e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.37 
 
 
773 aa  154  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.99 
 
 
797 aa  152  3e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.81 
 
 
742 aa  151  8e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  26.48 
 
 
653 aa  151  8e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  25.87 
 
 
620 aa  151  8e-35  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  25.21 
 
 
726 aa  149  2.0000000000000003e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.01 
 
 
829 aa  149  2.0000000000000003e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>