More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_4584 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  47.16 
 
 		 1120 aa  714    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  46.7 
 
 		 1128 aa  743    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  50.59 
 
 		 1144 aa  870    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  43.61 
 
 		 1106 aa  663    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1041 aa  2071    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  45.96 
 
 		 1108 aa  785    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  46.81 
 
 		 1128 aa  777    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  40.87 
 
 		 1103 aa  674    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  43.01 
 
 		 1130 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  44.92 
 
 		 1192 aa  717    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  43.67 
 
 		 1111 aa  688    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  43.52 
 
 		 1091 aa  672    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  44.97 
 
 		 1128 aa  673    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.78 
 
 		 1090 aa  706    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  41.98 
 
 		 1091 aa  645    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  42.44 
 
 		 1119 aa  682    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  51.28 
 
 		 1162 aa  873    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  42.11 
 
 		 1162 aa  650    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  40.16 
 
 		 1183 aa  664    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  44.82 
 
 		 1150 aa  714    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  42.69 
 
 		 1164 aa  708    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  43.52 
 
 		 1091 aa  672    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  43.99 
 
 		 1101 aa  683    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.96 
 
 		 1111 aa  670    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  43.89 
 
 		 1091 aa  677    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  42.44 
 
 		 1088 aa  630  1e-179  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  41.61 
 
 		 1167 aa  632  1e-179  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  42.48 
 
 		 1086 aa  619  1e-176  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  47.03 
 
 		 1228 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 1073 aa  608  9.999999999999999e-173  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  39.75 
 
 		 1136 aa  578  1.0000000000000001e-163  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.73 
 
 		 1176 aa  572  1e-161  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  43.04 
 
 		 1349 aa  534  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.57 
 
 		 1119 aa  527  1e-148  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.93 
 
 		 1094 aa  516  1.0000000000000001e-145  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  42.4 
 
 		 1124 aa  506  9.999999999999999e-143  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  30.37 
 
 		 1343 aa  248  3e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.35 
 
 		 1023 aa  211  4e-53  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  28.7 
 
 		 900 aa  206  2e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.55 
 
 		 786 aa  194  8e-48  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.22 
 
 		 729 aa  191  8e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.71 
 
 		 773 aa  191  8e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.48 
 
 		 858 aa  189  2e-46  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 735 aa  185  4.0000000000000006e-45  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.77 
 
 		 751 aa  184  5.0000000000000004e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.94 
 
 		 763 aa  184  7e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.25 
 
 		 833 aa  184  1e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.6 
 
 		 1016 aa  184  1e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.29 
 
 		 1019 aa  183  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.62 
 
 		 751 aa  182  2.9999999999999997e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.51 
 
 		 713 aa  182  4e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  25.61 
 
 		 625 aa  182  4e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.37 
 
 		 785 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.37 
 
 		 785 aa  181  4.999999999999999e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.44 
 
 		 837 aa  181  5.999999999999999e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.48 
 
 		 754 aa  180  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.57 
 
 		 768 aa  179  2e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.3 
 
 		 768 aa  179  3e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.01 
 
 		 756 aa  179  3e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.29 
 
 		 784 aa  178  5e-43  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.97 
 
 		 830 aa  178  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  27.13 
 
 		 762 aa  178  5e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.63 
 
 		 732 aa  177  7e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  27.98 
 
 		 771 aa  176  9.999999999999999e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.59 
 
 		 772 aa  177  9.999999999999999e-43  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4475  UvrD/REP helicase  28.05 
 
 		 689 aa  177  9.999999999999999e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.191893  normal  0.0867204 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.38 
 
 		 729 aa  176  1.9999999999999998e-42  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  25.31 
 
 		 638 aa  176  1.9999999999999998e-42  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  28.35 
 
 		 1397 aa  176  1.9999999999999998e-42  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  28.84 
 
 		 720 aa  176  1.9999999999999998e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  28.02 
 
 		 721 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.17 
 
 		 639 aa  175  2.9999999999999996e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  25.85 
 
 		 688 aa  175  2.9999999999999996e-42  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  25.69 
 
 		 706 aa  175  2.9999999999999996e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.33 
 
 		 765 aa  176  2.9999999999999996e-42  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.11 
 
 		 858 aa  175  3.9999999999999995e-42  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  28.98 
 
 		 721 aa  175  3.9999999999999995e-42  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.58 
 
 		 785 aa  175  3.9999999999999995e-42  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  28.98 
 
 		 721 aa  175  5e-42  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  27.89 
 
 		 705 aa  175  5e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  27.59 
 
 		 720 aa  174  5.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.19 
 
 		 775 aa  174  5.999999999999999e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  25.93 
 
 		 639 aa  174  6.999999999999999e-42  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  27.82 
 
 		 641 aa  174  7.999999999999999e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  27.59 
 
 		 720 aa  174  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  27.59 
 
 		 720 aa  174  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  27.59 
 
 		 720 aa  174  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  27.59 
 
 		 720 aa  174  7.999999999999999e-42  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.61 
 
 		 781 aa  174  9e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  27.59 
 
 		 720 aa  173  1e-41  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  27.59 
 
 		 720 aa  173  1e-41  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  27.59 
 
 		 720 aa  173  1e-41  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  28.25 
 
 		 743 aa  173  1e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  27.59 
 
 		 720 aa  173  2e-41  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.8 
 
 		 715 aa  172  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 731 aa  172  2e-41  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  27.59 
 
 		 720 aa  173  2e-41  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0497  DNA-dependent helicase II  27.91 
 
 		 726 aa  173  2e-41  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.615928  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  28.04 
 
 		 799 aa  173  2e-41  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  27.59 
 
 		 720 aa  173  2e-41  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>