More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_2478 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.9 
 
 		 1176 aa  793    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  42.8 
 
 		 1162 aa  658    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  41.39 
 
 		 1108 aa  669    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1167 aa  2307    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  43.21 
 
 		 1162 aa  698    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  43.07 
 
 		 1144 aa  676    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.58 
 
 		 1111 aa  677    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  42.76 
 
 		 1150 aa  651    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  75.11 
 
 		 1183 aa  1686    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  42.71 
 
 		 1128 aa  688    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  41.74 
 
 		 1128 aa  632  1e-179  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  38.34 
 
 		 1103 aa  627  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  42.02 
 
 		 1136 aa  614  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  41.57 
 
 		 1120 aa  603  1.0000000000000001e-171  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  39.14 
 
 		 1164 aa  605  1.0000000000000001e-171  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.83 
 
 		 1090 aa  593  1e-168  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  38.86 
 
 		 1119 aa  591  1e-167  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  39.03 
 
 		 1111 aa  580  1e-164  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.13 
 
 		 1094 aa  580  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  39.21 
 
 		 1101 aa  563  1.0000000000000001e-159  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  39.46 
 
 		 1091 aa  562  1e-158  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  39.29 
 
 		 1091 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  39.29 
 
 		 1091 aa  557  1e-157  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  38.71 
 
 		 1106 aa  554  1e-156  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  38.12 
 
 		 1130 aa  549  1e-154  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  46.47 
 
 		 1128 aa  542  9.999999999999999e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  38.09 
 
 		 1073 aa  538  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.08 
 
 		 1119 aa  533  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  38.65 
 
 		 1086 aa  521  1e-146  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  37.13 
 
 		 1091 aa  521  1e-146  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.12 
 
 		 1228 aa  514  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  38.05 
 
 		 1088 aa  502  1e-140  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  38.22 
 
 		 1349 aa  414  1e-114  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  37.85 
 
 		 1124 aa  389  1e-106  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  29.69 
 
 		 1343 aa  249  2e-64  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  30.4 
 
 		 1180 aa  194  7e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  28.94 
 
 		 1177 aa  187  8e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.09 
 
 		 1019 aa  182  2.9999999999999997e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  48.6 
 
 		 1192 aa  179  4e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.99 
 
 		 729 aa  176  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  28.55 
 
 		 1397 aa  172  3e-41  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.54 
 
 		 743 aa  172  5e-41  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  22.85 
 
 		 666 aa  170  1e-40  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.67 
 
 		 732 aa  170  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.52 
 
 		 729 aa  169  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  26.49 
 
 		 744 aa  167  8e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.1 
 
 		 730 aa  165  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.1 
 
 		 730 aa  165  4.0000000000000004e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.8 
 
 		 838 aa  160  9e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  27.75 
 
 		 1143 aa  159  2e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.73 
 
 		 741 aa  159  2e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.37 
 
 		 1023 aa  157  9e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  50.79 
 
 		 1041 aa  157  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.24 
 
 		 802 aa  155  4e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25.4 
 
 		 678 aa  155  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.77 
 
 		 829 aa  155  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.56 
 
 		 751 aa  155  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.56 
 
 		 747 aa  155  5.9999999999999996e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  23.56 
 
 		 753 aa  154  7e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  23.56 
 
 		 751 aa  154  7e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.56 
 
 		 751 aa  154  7e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.37 
 
 		 715 aa  154  8e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.07 
 
 		 730 aa  154  1e-35  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  20.75 
 
 		 735 aa  152  2e-35  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  25.93 
 
 		 768 aa  153  2e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.44 
 
 		 751 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.1 
 
 		 788 aa  152  3e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.44 
 
 		 747 aa  152  3e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  22.78 
 
 		 773 aa  152  4e-35  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  24.91 
 
 		 742 aa  152  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  20.53 
 
 		 1016 aa  151  6e-35  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.71 
 
 		 754 aa  151  6e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.18 
 
 		 753 aa  151  7e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.3 
 
 		 753 aa  151  9e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.66 
 
 		 742 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.72 
 
 		 725 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.81 
 
 		 794 aa  149  3e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.47 
 
 		 747 aa  149  4.0000000000000006e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.77 
 
 		 724 aa  149  4.0000000000000006e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.77 
 
 		 837 aa  149  4.0000000000000006e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.45 
 
 		 731 aa  149  4.0000000000000006e-34  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  28.99 
 
 		 1044 aa  147  1e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.44 
 
 		 795 aa  147  1e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.86 
 
 		 741 aa  147  1e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.8 
 
 		 858 aa  147  1e-33  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  24.63 
 
 		 765 aa  147  2e-33  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.14 
 
 		 785 aa  146  2e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  27.08 
 
 		 816 aa  146  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.94 
 
 		 751 aa  146  2e-33  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.57 
 
 		 830 aa  146  2e-33  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.06 
 
 		 857 aa  146  2e-33  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  25.44 
 
 		 743 aa  145  3e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.91 
 
 		 751 aa  146  3e-33  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  23.64 
 
 		 770 aa  145  5e-33  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  25.87 
 
 		 739 aa  145  6e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  22.73 
 
 		 689 aa  145  6e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.81 
 
 		 671 aa  145  6e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 620 aa  145  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.74 
 
 		 768 aa  144  8e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  23.06 
 
 		 778 aa  143  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>