More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_3753 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  46.55 
 
 		 1041 aa  738    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  43.22 
 
 		 1091 aa  707    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  58.9 
 
 		 1108 aa  1140    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1128 aa  2206    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  47.86 
 
 		 1120 aa  764    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  44.91 
 
 		 1111 aa  711    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  44.3 
 
 		 1091 aa  721    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  42.68 
 
 		 1192 aa  667    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  42.34 
 
 		 1130 aa  670    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  50.04 
 
 		 1144 aa  889    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  56.62 
 
 		 1150 aa  1072    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  42.81 
 
 		 1119 aa  698    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  42.87 
 
 		 1106 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  44.21 
 
 		 1091 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  42.87 
 
 		 1101 aa  670    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  58.16 
 
 		 1128 aa  1125    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.09 
 
 		 1090 aa  736    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  46.98 
 
 		 1128 aa  709    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.36 
 
 		 1111 aa  689    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  42.94 
 
 		 1183 aa  693    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  58.11 
 
 		 1228 aa  925    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  44.45 
 
 		 1164 aa  740    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  50.94 
 
 		 1162 aa  877    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  43.27 
 
 		 1073 aa  714    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  41.29 
 
 		 1103 aa  665    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  41.76 
 
 		 1167 aa  654    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  44.21 
 
 		 1091 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  43.16 
 
 		 1086 aa  647    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  41.33 
 
 		 1088 aa  610  1e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.21 
 
 		 1176 aa  580  1e-164  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  42.32 
 
 		 1136 aa  582  1e-164  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  44.88 
 
 		 1349 aa  568  1e-160  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  45.09 
 
 		 1162 aa  553  1e-156  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.35 
 
 		 1094 aa  528  1e-148  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  40.87 
 
 		 1124 aa  520  1e-146  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.59 
 
 		 1119 aa  522  1e-146  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  28.13 
 
 		 1343 aa  238  5.0000000000000005e-61  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.27 
 
 		 715 aa  198  5.000000000000001e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  25.06 
 
 		 1397 aa  192  2.9999999999999997e-47  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.34 
 
 		 729 aa  188  6e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.9 
 
 		 729 aa  180  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 768 aa  177  8e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.61 
 
 		 730 aa  176  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.61 
 
 		 730 aa  176  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.69 
 
 		 732 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.57 
 
 		 773 aa  172  4e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 1019 aa  171  7e-41  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.99 
 
 		 756 aa  171  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.37 
 
 		 662 aa  171  9e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  25.03 
 
 		 678 aa  171  1e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  27.85 
 
 		 707 aa  170  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.02 
 
 		 725 aa  171  1e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.35 
 
 		 730 aa  170  1e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.26 
 
 		 759 aa  170  2e-40  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  26.66 
 
 		 705 aa  167  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.72 
 
 		 741 aa  167  1.0000000000000001e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  21.53 
 
 		 735 aa  167  1.0000000000000001e-39  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  23.85 
 
 		 678 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.28 
 
 		 748 aa  166  2.0000000000000002e-39  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.13 
 
 		 785 aa  165  4.0000000000000004e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.01 
 
 		 753 aa  164  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.8 
 
 		 758 aa  162  2e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.64 
 
 		 753 aa  163  2e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  25.64 
 
 		 743 aa  162  3e-38  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  23.61 
 
 		 678 aa  162  3e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  24.26 
 
 		 900 aa  162  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.63 
 
 		 747 aa  161  8e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.38 
 
 		 747 aa  161  8e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  22.63 
 
 		 753 aa  160  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  22.63 
 
 		 751 aa  160  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.63 
 
 		 751 aa  160  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.63 
 
 		 751 aa  160  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  22.07 
 
 		 638 aa  160  2e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.9 
 
 		 1016 aa  160  2e-37  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.88 
 
 		 718 aa  160  2e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.45 
 
 		 741 aa  159  3e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  30.02 
 
 		 1044 aa  159  3e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.5 
 
 		 751 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.5 
 
 		 747 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.73 
 
 		 766 aa  158  6e-37  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.57 
 
 		 817 aa  158  7e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.65 
 
 		 797 aa  157  9e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1669  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.8 
 
 		 805 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03831  UvrD/REP helicase  25.8 
 
 		 805 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.209332  normal  0.111635 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  22.58 
 
 		 770 aa  156  2e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.09 
 
 		 833 aa  156  2e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  24.22 
 
 		 668 aa  155  2.9999999999999998e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 		 1177 aa  155  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  23.96 
 
 		 706 aa  155  5.9999999999999996e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  29.67 
 
 		 1134 aa  154  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.03 
 
 		 737 aa  154  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  29.19 
 
 		 1060 aa  154  1e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.02 
 
 		 751 aa  152  2e-35  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  25.33 
 
 		 779 aa  152  3e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2168  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.85 
 
 		 794 aa  152  3e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27 
 
 		 858 aa  152  3e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  25.94 
 
 		 800 aa  152  3e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  29.57 
 
 		 1059 aa  152  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  31.06 
 
 		 1060 aa  152  4e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.97 
 
 		 694 aa  151  5e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>