More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8376 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  56.97 
 
 		 1128 aa  900    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  57.31 
 
 		 1108 aa  873    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  100 
 
 		 1228 aa  2420    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  65.58 
 
 		 1128 aa  1105    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  54.14 
 
 		 1150 aa  808    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  47.18 
 
 		 1162 aa  624  1e-177  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  45.88 
 
 		 1144 aa  625  1e-177  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  47.03 
 
 		 1041 aa  603  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  46.97 
 
 		 1162 aa  572  1e-161  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  48.82 
 
 		 1128 aa  545  1e-153  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.99 
 
 		 1111 aa  542  9.999999999999999e-153  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  42.8 
 
 		 1164 aa  540  9.999999999999999e-153  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  44.08 
 
 		 1120 aa  538  1e-151  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  42.1 
 
 		 1124 aa  533  1e-150  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  44.08 
 
 		 1349 aa  535  1e-150  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  42.33 
 
 		 1091 aa  531  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  43.38 
 
 		 1130 aa  531  1e-149  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  43.51 
 
 		 1183 aa  528  1e-148  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.73 
 
 		 1090 aa  523  1e-147  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  43.26 
 
 		 1192 aa  522  1e-146  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  40.39 
 
 		 1103 aa  522  1e-146  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  41.62 
 
 		 1091 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  41.62 
 
 		 1091 aa  511  1e-143  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  40.81 
 
 		 1073 aa  506  9.999999999999999e-143  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  41.84 
 
 		 1091 aa  509  9.999999999999999e-143  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  41.52 
 
 		 1167 aa  504  1e-141  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  42.69 
 
 		 1106 aa  499  1e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  41.51 
 
 		 1111 aa  494  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  43.34 
 
 		 1088 aa  496  9.999999999999999e-139  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  39.17 
 
 		 1119 aa  488  1e-136  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  40.21 
 
 		 1101 aa  484  1e-135  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  41.59 
 
 		 1086 aa  486  1e-135  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  42.78 
 
 		 1136 aa  456  1e-127  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.74 
 
 		 1119 aa  446  1e-123  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.23 
 
 		 1176 aa  428  1e-118  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.97 
 
 		 1094 aa  394  1e-108  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  29.43 
 
 		 1343 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.65 
 
 		 715 aa  194  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.26 
 
 		 756 aa  189  3e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.16 
 
 		 785 aa  179  3e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.2 
 
 		 768 aa  177  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  24.23 
 
 		 714 aa  176  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.92 
 
 		 729 aa  169  2.9999999999999998e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  25.59 
 
 		 1397 aa  169  2.9999999999999998e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  29.17 
 
 		 707 aa  168  5e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  23.7 
 
 		 630 aa  168  5.9999999999999996e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  26.59 
 
 		 900 aa  168  8e-40  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  26.32 
 
 		 721 aa  167  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  26.46 
 
 		 721 aa  167  1.0000000000000001e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.7 
 
 		 730 aa  166  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.7 
 
 		 730 aa  166  2.0000000000000002e-39  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.9 
 
 		 725 aa  166  2.0000000000000002e-39  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  28.25 
 
 		 1180 aa  166  3e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  25.56 
 
 		 757 aa  166  4.0000000000000004e-39  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  27.12 
 
 		 723 aa  164  7e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.98 
 
 		 849 aa  164  8.000000000000001e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.28 
 
 		 857 aa  164  9e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.04 
 
 		 858 aa  164  1e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.06 
 
 		 758 aa  164  1e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  24.24 
 
 		 770 aa  164  1e-38  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.95 
 
 		 725 aa  162  3e-38  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 741 aa  162  3e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.12 
 
 		 759 aa  162  4e-38  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.65 
 
 		 729 aa  162  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  27.45 
 
 		 1177 aa  162  5e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.8 
 
 		 694 aa  161  7e-38  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.08 
 
 		 754 aa  160  9e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  22.8 
 
 		 689 aa  161  9e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  26.16 
 
 		 743 aa  160  2e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.16 
 
 		 833 aa  160  2e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  23.24 
 
 		 666 aa  159  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.56 
 
 		 786 aa  159  4e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  28.17 
 
 		 678 aa  158  6e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2924  UvrD/REP helicase  23.91 
 
 		 778 aa  157  1e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0128  DNA-dependent helicase II  25.18 
 
 		 741 aa  157  1e-36  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000143952  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  26.85 
 
 		 720 aa  156  2e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.11 
 
 		 751 aa  156  2e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3742  UvrD/REP helicase  29.51 
 
 		 1142 aa  156  2e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.404574  normal  0.909717 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  22.12 
 
 		 638 aa  155  2.9999999999999998e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 		 744 aa  156  2.9999999999999998e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.1 
 
 		 785 aa  156  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.1 
 
 		 785 aa  156  2.9999999999999998e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.41 
 
 		 732 aa  155  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  25.22 
 
 		 757 aa  155  5e-36  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.85 
 
 		 751 aa  155  5.9999999999999996e-36  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.4 
 
 		 1023 aa  154  7e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.42 
 
 		 828 aa  154  7e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  26.13 
 
 		 717 aa  154  8e-36  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  25.28 
 
 		 668 aa  154  8.999999999999999e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.44 
 
 		 674 aa  154  8.999999999999999e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.38 
 
 		 713 aa  154  8.999999999999999e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  28.01 
 
 		 728 aa  154  8.999999999999999e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  23.43 
 
 		 735 aa  154  8.999999999999999e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.92 
 
 		 784 aa  154  8.999999999999999e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  26.02 
 
 		 800 aa  154  1e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1824  UvrD/REP helicase  24.97 
 
 		 679 aa  153  2e-35  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000550793  unclonable  0.00000000134855 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  26.74 
 
 		 771 aa  153  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 728 aa  153  2e-35  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.56 
 
 		 670 aa  153  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  25.96 
 
 		 726 aa  153  2e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>