More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_1422 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  69.23 
 
 		 1101 aa  1371    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  43.52 
 
 		 1108 aa  729    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  52.18 
 
 		 1111 aa  936    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  43.41 
 
 		 1041 aa  649    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  50.18 
 
 		 1349 aa  697    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  97.8 
 
 		 1091 aa  2033    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.27 
 
 		 1090 aa  871    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  48.04 
 
 		 1106 aa  786    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  52.18 
 
 		 1119 aa  978    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  46.03 
 
 		 1162 aa  739    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  44.04 
 
 		 1120 aa  649    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1091 aa  2142    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  73.13 
 
 		 1091 aa  1514    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  46.43 
 
 		 1144 aa  752    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  41.42 
 
 		 1164 aa  653    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  43.77 
 
 		 1128 aa  711    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1091 aa  2142    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  41.85 
 
 		 1128 aa  654    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  74.98 
 
 		 1086 aa  1461    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  42.62 
 
 		 1150 aa  697    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  42.43 
 
 		 1192 aa  629  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  42.61 
 
 		 1128 aa  599  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.28 
 
 		 1111 aa  599  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  39.04 
 
 		 1103 aa  598  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  38.78 
 
 		 1183 aa  580  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  41.67 
 
 		 1130 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  39.28 
 
 		 1167 aa  561  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  41.18 
 
 		 1088 aa  562  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  38.86 
 
 		 1073 aa  557  1e-157  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.76 
 
 		 1228 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.66 
 
 		 1176 aa  526  1e-147  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  38.92 
 
 		 1136 aa  490  1e-137  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  42.74 
 
 		 1162 aa  475  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.48 
 
 		 1119 aa  466  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.24 
 
 		 1094 aa  457  1e-127  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  38.81 
 
 		 1124 aa  427  1e-118  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.54 
 
 		 1019 aa  183  2e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.31 
 
 		 729 aa  178  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.55 
 
 		 773 aa  172  3e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  20.25 
 
 		 1016 aa  172  4e-41  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  28.13 
 
 		 728 aa  171  7e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.12 
 
 		 734 aa  171  8e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.04 
 
 		 768 aa  170  1e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.98 
 
 		 756 aa  170  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  28.16 
 
 		 659 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  23.98 
 
 		 696 aa  169  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  22.41 
 
 		 741 aa  168  5e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  25.72 
 
 		 790 aa  168  6.9999999999999995e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  26.32 
 
 		 705 aa  167  8e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 		 786 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  27.1 
 
 		 846 aa  166  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.9 
 
 		 787 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  24.24 
 
 		 1397 aa  164  6e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  26.9 
 
 		 787 aa  165  6e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.24 
 
 		 639 aa  164  7e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  28.67 
 
 		 1343 aa  164  8.000000000000001e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.53 
 
 		 730 aa  164  8.000000000000001e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.71 
 
 		 737 aa  163  1e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 		 787 aa  164  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  26.78 
 
 		 787 aa  163  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  26.53 
 
 		 787 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  26.53 
 
 		 787 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  26.91 
 
 		 787 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  26.53 
 
 		 787 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  26.91 
 
 		 787 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  26.53 
 
 		 787 aa  162  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  26.91 
 
 		 787 aa  162  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  21.53 
 
 		 639 aa  162  4e-38  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.96 
 
 		 788 aa  161  5e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  23.62 
 
 		 743 aa  160  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  25.74 
 
 		 706 aa  160  1e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  26.55 
 
 		 840 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.91 
 
 		 818 aa  160  1e-37  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  25.45 
 
 		 736 aa  160  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.75 
 
 		 659 aa  159  2e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  26.53 
 
 		 787 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.37 
 
 		 785 aa  159  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.59 
 
 		 759 aa  159  3e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  25.87 
 
 		 771 aa  159  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.8 
 
 		 775 aa  159  3e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 726 aa  158  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  24.97 
 
 		 826 aa  158  7e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.39 
 
 		 795 aa  157  7e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  24.81 
 
 		 772 aa  157  1e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  23.89 
 
 		 739 aa  157  1e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  21.99 
 
 		 625 aa  157  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.91 
 
 		 783 aa  157  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.66 
 
 		 718 aa  157  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.97 
 
 		 816 aa  157  1e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  21.72 
 
 		 638 aa  156  2e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.28 
 
 		 892 aa  157  2e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  25.03 
 
 		 783 aa  156  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.63 
 
 		 833 aa  156  2.9999999999999998e-36  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.66 
 
 		 741 aa  155  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.1 
 
 		 713 aa  155  2.9999999999999998e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.39 
 
 		 672 aa  155  2.9999999999999998e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  25.56 
 
 		 669 aa  155  4e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  23.01 
 
 		 630 aa  155  4e-36  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.09 
 
 		 829 aa  155  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 744 aa  155  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>