More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_19190 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 1119 aa  2174    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.6 
 
 		 1111 aa  638    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  39.22 
 
 		 1103 aa  635  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  41.73 
 
 		 1192 aa  604  1.0000000000000001e-171  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  41.17 
 
 		 1162 aa  603  1.0000000000000001e-171  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  42.3 
 
 		 1128 aa  594  1e-168  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  39.16 
 
 		 1108 aa  555  1e-156  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  36 
 
 		 1183 aa  545  1e-153  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  37.35 
 
 		 1167 aa  541  9.999999999999999e-153  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  37.99 
 
 		 1150 aa  532  1e-149  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.03 
 
 		 1094 aa  533  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  39.01 
 
 		 1144 aa  532  1e-149  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.23 
 
 		 1176 aa  528  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  38.51 
 
 		 1128 aa  516  1.0000000000000001e-145  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  42.27 
 
 		 1136 aa  513  1e-144  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  38.02 
 
 		 1041 aa  511  1e-143  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  38.91 
 
 		 1162 aa  510  1e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  39.84 
 
 		 1120 aa  507  9.999999999999999e-143  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  36.5 
 
 		 1164 aa  507  9.999999999999999e-143  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  36.73 
 
 		 1119 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  38.61 
 
 		 1128 aa  502  1e-140  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  38.78 
 
 		 1111 aa  501  1e-140  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.93 
 
 		 1090 aa  489  1e-136  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  38 
 
 		 1091 aa  474  1e-132  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  36.5 
 
 		 1091 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  38.6 
 
 		 1106 aa  466  9.999999999999999e-131  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  37.55 
 
 		 1091 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  37.55 
 
 		 1091 aa  468  9.999999999999999e-131  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  37.08 
 
 		 1101 aa  465  1e-129  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.33 
 
 		 1228 aa  465  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  37.16 
 
 		 1130 aa  460  9.999999999999999e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  36.36 
 
 		 1086 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  40.88 
 
 		 1349 aa  422  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  35.63 
 
 		 1088 aa  412  1e-113  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  33.89 
 
 		 1073 aa  402  9.999999999999999e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  36.31 
 
 		 1124 aa  352  3e-95  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  31.8 
 
 		 1343 aa  188  5e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 786 aa  156  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  26.1 
 
 		 900 aa  156  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 786 aa  155  5e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  26.18 
 
 		 1397 aa  154  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.8 
 
 		 1023 aa  154  1e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.78 
 
 		 756 aa  152  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  26.34 
 
 		 768 aa  151  8e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.26 
 
 		 1019 aa  150  1.0000000000000001e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  23.59 
 
 		 724 aa  150  2.0000000000000003e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.89 
 
 		 751 aa  149  3e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.81 
 
 		 751 aa  148  6e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.83 
 
 		 781 aa  147  9e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.93 
 
 		 831 aa  145  4e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.85 
 
 		 773 aa  145  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf847  ATP-dependent DNA helicase  24.5 
 
 		 726 aa  144  9.999999999999999e-33  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.710587  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  29.91 
 
 		 726 aa  143  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.17 
 
 		 783 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  25.25 
 
 		 840 aa  142  3e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.07 
 
 		 830 aa  142  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  27.17 
 
 		 829 aa  142  4.999999999999999e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.82 
 
 		 787 aa  141  6e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  25.46 
 
 		 846 aa  141  6e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.31 
 
 		 858 aa  141  7e-32  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  25.67 
 
 		 787 aa  141  8.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  25.29 
 
 		 786 aa  140  1e-31  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 		 783 aa  140  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  29.73 
 
 		 741 aa  140  1e-31  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  25.25 
 
 		 787 aa  140  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.65 
 
 		 763 aa  140  1e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  29.57 
 
 		 706 aa  140  2e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  26.65 
 
 		 678 aa  139  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  25.32 
 
 		 787 aa  140  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  25.99 
 
 		 787 aa  139  2e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.75 
 
 		 787 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.58 
 
 		 754 aa  137  9e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.67 
 
 		 833 aa  137  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  25.33 
 
 		 787 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  25.33 
 
 		 787 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.39 
 
 		 858 aa  137  1.9999999999999998e-30  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  25.33 
 
 		 787 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.12 
 
 		 715 aa  137  1.9999999999999998e-30  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  25.56 
 
 		 672 aa  136  1.9999999999999998e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  25.33 
 
 		 787 aa  136  1.9999999999999998e-30  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  28.16 
 
 		 659 aa  135  3e-30  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  25.18 
 
 		 787 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.31 
 
 		 788 aa  136  3e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  25.18 
 
 		 787 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  25.18 
 
 		 787 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.48 
 
 		 725 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  25.18 
 
 		 787 aa  135  6e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  24.11 
 
 		 757 aa  134  1.0000000000000001e-29  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.65 
 
 		 837 aa  133  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.26 
 
 		 786 aa  133  2.0000000000000002e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  23.78 
 
 		 714 aa  132  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.51 
 
 		 753 aa  132  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.6 
 
 		 932 aa  132  4.0000000000000003e-29  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  25.86 
 
 		 665 aa  132  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.51 
 
 		 753 aa  132  4.0000000000000003e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  21.85 
 
 		 735 aa  132  4.0000000000000003e-29  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.21 
 
 		 797 aa  132  4.0000000000000003e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.14 
 
 		 759 aa  132  5.0000000000000004e-29  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  25.88 
 
 		 736 aa  132  5.0000000000000004e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.38 
 
 		 732 aa  131  6e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>