More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1802 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  46.17 
 
 		 1162 aa  728    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  47.58 
 
 		 1106 aa  769    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  86.25 
 
 		 1091 aa  1789    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  51.77 
 
 		 1090 aa  871    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  43.98 
 
 		 1108 aa  725    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  68.89 
 
 		 1101 aa  1358    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  42.86 
 
 		 1128 aa  668    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  45.89 
 
 		 1144 aa  745    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  74.84 
 
 		 1091 aa  1510    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  52.32 
 
 		 1111 aa  930    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  42.62 
 
 		 1041 aa  649    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  74.93 
 
 		 1091 aa  1511    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  50.82 
 
 		 1349 aa  689    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  74.93 
 
 		 1091 aa  1511    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1086 aa  2136    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  51.51 
 
 		 1119 aa  955    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  41.44 
 
 		 1150 aa  635  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  43.26 
 
 		 1120 aa  631  1e-179  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  41.37 
 
 		 1128 aa  626  1e-178  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  42.81 
 
 		 1192 aa  626  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  39.76 
 
 		 1164 aa  615  9.999999999999999e-175  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  40.07 
 
 		 1103 aa  598  1e-169  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  41.37 
 
 		 1162 aa  595  1e-168  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  42.11 
 
 		 1130 aa  589  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.44 
 
 		 1111 aa  588  1e-166  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  42.87 
 
 		 1088 aa  568  1e-160  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  42.78 
 
 		 1128 aa  568  1e-160  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  39.19 
 
 		 1073 aa  568  1e-160  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  38.95 
 
 		 1167 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  38.49 
 
 		 1183 aa  554  1e-156  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.61 
 
 		 1176 aa  539  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.69 
 
 		 1228 aa  515  1e-144  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  39.04 
 
 		 1136 aa  497  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.97 
 
 		 1094 aa  475  1e-132  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.11 
 
 		 1119 aa  463  1e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 1124 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  28.42 
 
 		 1343 aa  226  1e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  22.93 
 
 		 1016 aa  179  2e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.66 
 
 		 756 aa  177  9.999999999999999e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 700 aa  172  4e-41  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.81 
 
 		 858 aa  171  5e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  25.84 
 
 		 768 aa  171  5e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.27 
 
 		 773 aa  170  1e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.69 
 
 		 734 aa  170  1e-40  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  27.08 
 
 		 707 aa  169  2e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.7 
 
 		 762 aa  168  4e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.2 
 
 		 785 aa  166  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.67 
 
 		 765 aa  165  5.0000000000000005e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.24 
 
 		 829 aa  165  5.0000000000000005e-39  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  31.24 
 
 		 1074 aa  164  6e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.89 
 
 		 858 aa  164  7e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.66 
 
 		 784 aa  164  7e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.74 
 
 		 794 aa  164  9e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  24.85 
 
 		 705 aa  164  1e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.84 
 
 		 729 aa  164  1e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  21.31 
 
 		 735 aa  162  2e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.3 
 
 		 787 aa  163  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  26.19 
 
 		 846 aa  162  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.63 
 
 		 795 aa  161  5e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.18 
 
 		 785 aa  162  5e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.18 
 
 		 785 aa  162  5e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 787 aa  161  6e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.49 
 
 		 786 aa  161  7e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 787 aa  160  9e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 		 1019 aa  160  1e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.25 
 
 		 780 aa  159  2e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  23.95 
 
 		 696 aa  159  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  25.65 
 
 		 840 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  23.57 
 
 		 743 aa  158  4e-37  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.07 
 
 		 754 aa  159  4e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  25.54 
 
 		 787 aa  158  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  22.4 
 
 		 630 aa  159  4e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  26.19 
 
 		 737 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  25.52 
 
 		 762 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  26.63 
 
 		 736 aa  158  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 786 aa  157  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.69 
 
 		 639 aa  157  2e-36  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.16 
 
 		 802 aa  156  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.32 
 
 		 718 aa  155  2.9999999999999998e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.94 
 
 		 694 aa  155  2.9999999999999998e-36  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  21.48 
 
 		 731 aa  155  2.9999999999999998e-36  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  22.17 
 
 		 638 aa  155  4e-36  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 		 706 aa  155  4e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.65 
 
 		 724 aa  155  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.73 
 
 		 741 aa  155  5e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  27 
 
 		 726 aa  154  5.9999999999999996e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0461  UvrD/REP helicase  24.97 
 
 		 726 aa  154  7e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.23 
 
 		 775 aa  154  7e-36  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  21.65 
 
 		 639 aa  154  8e-36  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.23 
 
 		 659 aa  154  8.999999999999999e-36  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.46 
 
 		 763 aa  154  8.999999999999999e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  26.46 
 
 		 641 aa  153  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 783 aa  153  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  27.22 
 
 		 762 aa  153  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.32 
 
 		 864 aa  153  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  26.19 
 
 		 787 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  26.19 
 
 		 787 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  25.62 
 
 		 787 aa  153  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  26.19 
 
 		 787 aa  153  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.21 
 
 		 673 aa  153  2e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>