More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_11370 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.61 
 
 		 1111 aa  715    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  41.8 
 
 		 1192 aa  650    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 1094 aa  2112    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  40.07 
 
 		 1103 aa  660    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  42.98 
 
 		 1136 aa  606  9.999999999999999e-173  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  39.8 
 
 		 1167 aa  599  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  40.19 
 
 		 1108 aa  594  1e-168  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  38.55 
 
 		 1183 aa  593  1e-168  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  40.22 
 
 		 1144 aa  577  1.0000000000000001e-163  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  40.03 
 
 		 1162 aa  563  1.0000000000000001e-159  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  39.07 
 
 		 1128 aa  559  1e-158  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  45.87 
 
 		 1162 aa  562  1e-158  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  37.45 
 
 		 1164 aa  551  1e-155  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  38.89 
 
 		 1150 aa  541  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  38.86 
 
 		 1119 aa  538  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.62 
 
 		 1119 aa  537  1e-151  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  38.11 
 
 		 1041 aa  529  1e-149  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  38.76 
 
 		 1128 aa  530  1e-149  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  38.51 
 
 		 1101 aa  530  1e-149  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  39.93 
 
 		 1111 aa  527  1e-148  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  41.26 
 
 		 1120 aa  520  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  45.37 
 
 		 1128 aa  510  1e-143  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.31 
 
 		 1090 aa  512  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  38.57 
 
 		 1106 aa  509  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  37.16 
 
 		 1091 aa  485  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  36.34 
 
 		 1091 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  36.34 
 
 		 1091 aa  481  1e-134  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  38.31 
 
 		 1130 aa  478  1e-133  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  36.34 
 
 		 1091 aa  477  1e-133  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  36.66 
 
 		 1073 aa  477  1e-133  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  37.61 
 
 		 1086 aa  474  1e-132  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  37.7 
 
 		 1088 aa  430  1e-119  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  40.02 
 
 		 1349 aa  423  1e-117  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  38.42 
 
 		 1228 aa  415  1e-114  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.6 
 
 		 1176 aa  413  1e-113  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  36.04 
 
 		 1124 aa  360  9e-98  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  31.3 
 
 		 1343 aa  271  4e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  28.98 
 
 		 1397 aa  186  2.0000000000000003e-45  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.81 
 
 		 833 aa  186  2.0000000000000003e-45  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.6 
 
 		 715 aa  181  9e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.01 
 
 		 729 aa  180  1e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.92 
 
 		 785 aa  168  5e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.43 
 
 		 857 aa  165  4.0000000000000004e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  29.26 
 
 		 1059 aa  163  2e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  26.24 
 
 		 689 aa  162  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.41 
 
 		 1019 aa  162  3e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.62 
 
 		 718 aa  161  7e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  22.46 
 
 		 666 aa  160  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  25.04 
 
 		 689 aa  159  4e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.27 
 
 		 711 aa  157  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.93 
 
 		 1023 aa  157  1e-36  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.06 
 
 		 932 aa  157  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.67 
 
 		 724 aa  157  1e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.42 
 
 		 741 aa  154  7e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.87 
 
 		 730 aa  154  8e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 845 aa  153  1e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  23.7 
 
 		 681 aa  153  1e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  22.37 
 
 		 625 aa  153  2e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.95 
 
 		 742 aa  152  2e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.61 
 
 		 858 aa  152  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.53 
 
 		 780 aa  152  4e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  25.75 
 
 		 858 aa  152  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  27.46 
 
 		 760 aa  151  5e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  27.67 
 
 		 771 aa  151  7e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.91 
 
 		 773 aa  151  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  26.11 
 
 		 742 aa  151  8e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  26.75 
 
 		 804 aa  149  2.0000000000000003e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.76 
 
 		 849 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  24.18 
 
 		 749 aa  149  3e-34  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  23.55 
 
 		 757 aa  149  3e-34  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  24.45 
 
 		 770 aa  149  3e-34  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  24.52 
 
 		 665 aa  149  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.9 
 
 		 694 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.9 
 
 		 730 aa  148  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.91 
 
 		 858 aa  148  5e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.9 
 
 		 730 aa  148  5e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  20.86 
 
 		 1016 aa  148  7.0000000000000006e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  27.09 
 
 		 798 aa  147  9e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.21 
 
 		 830 aa  147  9e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  27.64 
 
 		 816 aa  147  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0950  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 		 813 aa  147  1e-33  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000846771 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  20.51 
 
 		 743 aa  147  1e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.89 
 
 		 729 aa  146  2e-33  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5211  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.29 
 
 		 673 aa  146  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  23.13 
 
 		 630 aa  146  2e-33  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 		 741 aa  146  2e-33  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.15 
 
 		 737 aa  146  2e-33  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  23.83 
 
 		 678 aa  145  3e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  27.93 
 
 		 707 aa  145  3e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.43 
 
 		 775 aa  145  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1084  UvrD/REP helicase  25.85 
 
 		 789 aa  145  4e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.305736 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  23.98 
 
 		 678 aa  145  5e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4199  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.26 
 
 		 673 aa  145  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  25.87 
 
 		 825 aa  144  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.93 
 
 		 674 aa  144  6e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  23.16 
 
 		 672 aa  145  6e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3994  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.26 
 
 		 673 aa  144  7e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.78 
 
 		 838 aa  144  7e-33  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4225  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.26 
 
 		 673 aa  144  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4142  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.26 
 
 		 673 aa  144  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11002  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>