More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_7807 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  40.46 
 
 		 1144 aa  657    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  49.69 
 
 		 1130 aa  913    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  52.53 
 
 		 1088 aa  713    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1124 aa  2239    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  39.88 
 
 		 1150 aa  633  1e-180  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  41.15 
 
 		 1128 aa  635  1e-180  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  37.55 
 
 		 1119 aa  588  1e-166  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  45.26 
 
 		 1073 aa  583  1.0000000000000001e-165  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  39.35 
 
 		 1162 aa  581  1e-164  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  36.93 
 
 		 1183 aa  546  1e-154  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  37.18 
 
 		 1164 aa  548  1e-154  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  41.9 
 
 		 1108 aa  541  9.999999999999999e-153  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.48 
 
 		 1111 aa  535  1e-150  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.89 
 
 		 1228 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  36.82 
 
 		 1091 aa  521  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  41.75 
 
 		 1162 aa  507  9.999999999999999e-143  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  42.4 
 
 		 1041 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  40.76 
 
 		 1128 aa  499  1e-139  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  40.77 
 
 		 1349 aa  477  1e-133  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  40.73 
 
 		 1120 aa  449  1.0000000000000001e-124  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  39.07 
 
 		 1111 aa  445  1e-123  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.33 
 
 		 1090 aa  444  1e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  39.12 
 
 		 1091 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  40 
 
 		 1086 aa  424  1e-117  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  38.73 
 
 		 1101 aa  422  1e-116  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  38.98 
 
 		 1192 aa  418  9.999999999999999e-116  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  37.15 
 
 		 1103 aa  408  1.0000000000000001e-112  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  41.05 
 
 		 1128 aa  408  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 		 1091 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  38.46 
 
 		 1091 aa  407  1.0000000000000001e-112  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  38.37 
 
 		 1106 aa  397  1e-109  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  38.14 
 
 		 1136 aa  397  1e-109  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.99 
 
 		 1176 aa  389  1e-106  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  37.61 
 
 		 1167 aa  385  1e-105  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.9 
 
 		 1094 aa  350  6e-95  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.31 
 
 		 1119 aa  336  1e-90  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  29.66 
 
 		 1343 aa  228  5.0000000000000005e-58  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  26.63 
 
 		 1397 aa  189  3e-46  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.15 
 
 		 730 aa  181  9e-44  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.91 
 
 		 711 aa  179  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28 
 
 		 713 aa  179  3e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.83 
 
 		 785 aa  178  4e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  28.41 
 
 		 848 aa  177  9e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  26.53 
 
 		 678 aa  177  9.999999999999999e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.89 
 
 		 741 aa  177  9.999999999999999e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.43 
 
 		 729 aa  176  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  31.23 
 
 		 1044 aa  173  2e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.54 
 
 		 725 aa  172  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  33.4 
 
 		 715 aa  172  4e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.19 
 
 		 751 aa  171  6e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.46 
 
 		 833 aa  171  8e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  28.92 
 
 		 746 aa  171  8e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.31 
 
 		 718 aa  171  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.19 
 
 		 751 aa  170  2e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1204  UvrD/REP helicase  27.74 
 
 		 744 aa  169  2.9999999999999998e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.948208  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  26.47 
 
 		 721 aa  169  2.9999999999999998e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  25.71 
 
 		 723 aa  169  2.9999999999999998e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  26.88 
 
 		 721 aa  168  5e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0060  UvrD/REP helicase  28.96 
 
 		 1177 aa  168  5e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.508286 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  26.2 
 
 		 720 aa  168  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  29.2 
 
 		 795 aa  168  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.34 
 
 		 725 aa  168  6.9999999999999995e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  28.45 
 
 		 1180 aa  167  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.41 
 
 		 662 aa  167  1.0000000000000001e-39  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.87 
 
 		 731 aa  167  1.0000000000000001e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  27.27 
 
 		 727 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  28.51 
 
 		 736 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  29.2 
 
 		 795 aa  166  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  27.51 
 
 		 726 aa  166  3e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.9 
 
 		 1023 aa  165  4.0000000000000004e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.13 
 
 		 742 aa  165  4.0000000000000004e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_71870  DNA-dependent helicase II  26.68 
 
 		 728 aa  165  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.186903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  25.45 
 
 		 720 aa  164  6e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  25.45 
 
 		 720 aa  164  6e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  25.45 
 
 		 720 aa  164  6e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.6 
 
 		 737 aa  164  7e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.85 
 
 		 753 aa  164  8.000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  29.2 
 
 		 798 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  26.22 
 
 		 722 aa  164  8.000000000000001e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.23 
 
 		 751 aa  164  9e-39  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.48 
 
 		 741 aa  164  1e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.53 
 
 		 729 aa  163  1e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  26.07 
 
 		 722 aa  164  1e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  25.26 
 
 		 751 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  26.07 
 
 		 722 aa  164  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 817 aa  163  1e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  26.07 
 
 		 722 aa  164  1e-38  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  25.91 
 
 		 722 aa  164  1e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  26.07 
 
 		 727 aa  164  1e-38  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  27.53 
 
 		 735 aa  163  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  25.3 
 
 		 720 aa  163  2e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.65 
 
 		 773 aa  162  2e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.26 
 
 		 747 aa  163  2e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  25.26 
 
 		 753 aa  163  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.32 
 
 		 765 aa  162  2e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  25.3 
 
 		 720 aa  163  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  26.11 
 
 		 727 aa  162  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  26.02 
 
 		 744 aa  163  2e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.26 
 
 		 751 aa  163  2e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  25.3 
 
 		 720 aa  163  2e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>