More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_1775 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  42.56 
 
 
1111 aa  660    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  46.61 
 
 
1162 aa  762    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.76 
 
 
1111 aa  645    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  41.57 
 
 
1091 aa  651    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  43.85 
 
 
1120 aa  666    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  43.68 
 
 
1108 aa  720    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  43.59 
 
 
1192 aa  662    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  45.83 
 
 
1144 aa  769    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  41.68 
 
 
1119 aa  688    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  42.62 
 
 
1106 aa  670    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  43.6 
 
 
1162 aa  679    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  45.31 
 
 
1090 aa  729    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  44.02 
 
 
1128 aa  658    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  42.38 
 
 
1041 aa  693    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  44.26 
 
 
1150 aa  700    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  44.87 
 
 
1128 aa  731    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  41.72 
 
 
1091 aa  655    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  43.38 
 
 
1128 aa  730    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  100 
 
 
1164 aa  2276    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  41.72 
 
 
1091 aa  655    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  38.49 
 
 
1103 aa  628  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  38.08 
 
 
1183 aa  622  1e-176  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  41.07 
 
 
1101 aa  610  1e-173  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  39.81 
 
 
1091 aa  603  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  39.44 
 
 
1167 aa  600  1e-170  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  39.74 
 
 
1086 aa  578  1.0000000000000001e-163  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  37.17 
 
 
1124 aa  574  1.0000000000000001e-162  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  39.05 
 
 
1130 aa  567  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.77 
 
 
1228 aa  552  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  42.29 
 
 
1349 aa  541  9.999999999999999e-153  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  39.58 
 
 
1136 aa  535  1e-150  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.59 
 
 
1094 aa  531  1e-149  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  37.46 
 
 
1073 aa  524  1e-147  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.96 
 
 
1119 aa  507  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  37.93 
 
 
1088 aa  508  9.999999999999999e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  26.1 
 
 
1397 aa  270  8.999999999999999e-71  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  27.54 
 
 
1343 aa  234  7.000000000000001e-60  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.03 
 
 
715 aa  173  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.61 
 
 
763 aa  171  7e-41  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.82 
 
 
837 aa  170  2e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.66 
 
 
718 aa  167  9e-40  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.26 
 
 
857 aa  167  9e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  26.58 
 
 
746 aa  166  2.0000000000000002e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.87 
 
 
830 aa  166  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.6 
 
 
833 aa  166  3e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.61 
 
 
858 aa  164  8.000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.31 
 
 
729 aa  163  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.2 
 
 
1023 aa  163  2e-38  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.77 
 
 
858 aa  162  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  26.82 
 
 
768 aa  162  5e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.61 
 
 
784 aa  158  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.44 
 
 
729 aa  157  1e-36  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.49 
 
 
785 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0566  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.87 
 
 
766 aa  157  1e-36  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.49 
 
 
785 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.53 
 
 
817 aa  156  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.99 
 
 
730 aa  155  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.99 
 
 
730 aa  155  4e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  22.72 
 
 
666 aa  155  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.4 
 
 
831 aa  155  5e-36  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.48 
 
 
1176 aa  155  5e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.22 
 
 
829 aa  155  5.9999999999999996e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  25.95 
 
 
739 aa  154  7e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.16 
 
 
851 aa  154  1e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.44 
 
 
754 aa  153  2e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.84 
 
 
753 aa  152  3e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.56 
 
 
756 aa  152  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.84 
 
 
753 aa  152  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.64 
 
 
734 aa  151  6e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  25.17 
 
 
743 aa  150  1.0000000000000001e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.32 
 
 
765 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.32 
 
 
732 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  25.93 
 
 
771 aa  150  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.75 
 
 
747 aa  149  3e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  24.53 
 
 
753 aa  149  3e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  24.53 
 
 
751 aa  149  3e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.53 
 
 
751 aa  149  3e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.86 
 
 
802 aa  149  4.0000000000000006e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.53 
 
 
751 aa  149  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.63 
 
 
748 aa  147  8.000000000000001e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  24.84 
 
 
735 aa  147  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.64 
 
 
762 aa  147  9e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.84 
 
 
662 aa  147  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.41 
 
 
751 aa  147  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.34 
 
 
797 aa  147  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.46 
 
 
759 aa  147  2e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  25.99 
 
 
743 aa  146  2e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.41 
 
 
747 aa  147  2e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26 
 
 
694 aa  146  2e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.69 
 
 
741 aa  145  4e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.62 
 
 
747 aa  144  8e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.31 
 
 
817 aa  143  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.32 
 
 
892 aa  144  9.999999999999999e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.6 
 
 
786 aa  143  1.9999999999999998e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.23 
 
 
737 aa  143  1.9999999999999998e-32  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  25.03 
 
 
765 aa  142  3e-32  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.55 
 
 
773 aa  142  3.9999999999999997e-32  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  23.68 
 
 
757 aa  141  6e-32  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.95 
 
 
775 aa  141  8.999999999999999e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  24.59 
 
 
741 aa  140  2e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>