More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2144 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  46.93 
 
 		 1101 aa  772    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  46.76 
 
 		 1162 aa  741    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  49.56 
 
 		 1111 aa  831    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  43.96 
 
 		 1108 aa  733    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  51.51 
 
 		 1349 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  43.14 
 
 		 1128 aa  664    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  45.16 
 
 		 1128 aa  639    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.27 
 
 		 1090 aa  840    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  46.75 
 
 		 1119 aa  816    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  42.89 
 
 		 1128 aa  653    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  48.09 
 
 		 1091 aa  806    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  47.91 
 
 		 1091 aa  809    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  47.19 
 
 		 1144 aa  773    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  43.68 
 
 		 1041 aa  662    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  44.61 
 
 		 1150 aa  730    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  42.61 
 
 		 1164 aa  685    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1106 aa  2137    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  43.08 
 
 		 1120 aa  644    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  44.06 
 
 		 1192 aa  647    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  48.15 
 
 		 1091 aa  806    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  47.91 
 
 		 1091 aa  809    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  46.54 
 
 		 1086 aa  752    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.96 
 
 		 1111 aa  635  1e-180  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  42.14 
 
 		 1162 aa  627  1e-178  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  39.31 
 
 		 1103 aa  612  1e-173  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  38.37 
 
 		 1183 aa  582  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  39.6 
 
 		 1073 aa  574  1.0000000000000001e-162  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  41.55 
 
 		 1130 aa  569  1e-160  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  38.66 
 
 		 1167 aa  560  1e-158  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  38.32 
 
 		 1124 aa  556  1e-157  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  40.65 
 
 		 1136 aa  551  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.31 
 
 		 1176 aa  528  1e-148  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.64 
 
 		 1228 aa  529  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  40.5 
 
 		 1088 aa  512  1e-143  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.2 
 
 		 1094 aa  496  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.65 
 
 		 1119 aa  486  1e-135  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  31.33 
 
 		 1343 aa  271  5.9999999999999995e-71  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 		 1019 aa  197  7e-49  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 768 aa  182  2e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  20.63 
 
 		 1016 aa  166  3e-39  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.93 
 
 		 754 aa  165  6e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.03 
 
 		 851 aa  164  7e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  25.66 
 
 		 845 aa  164  8.000000000000001e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.06 
 
 		 795 aa  163  2e-38  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0038  UvrD/REP helicase  24.24 
 
 		 757 aa  162  3e-38  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  23.98 
 
 		 714 aa  161  7e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.68 
 
 		 831 aa  161  7e-38  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  28.57 
 
 		 771 aa  161  8e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  25.58 
 
 		 721 aa  160  1e-37  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.64 
 
 		 838 aa  160  1e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  25.13 
 
 		 689 aa  160  2e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  25.1 
 
 		 721 aa  159  2e-37  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 		 830 aa  160  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2777  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.96 
 
 		 817 aa  159  3e-37  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.46822  normal  0.929226 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.92 
 
 		 817 aa  158  5.0000000000000005e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.49 
 
 		 662 aa  158  6e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  26.97 
 
 		 848 aa  157  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.29 
 
 		 785 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.29 
 
 		 785 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.79 
 
 		 765 aa  155  4e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.12 
 
 		 829 aa  155  4e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  23.84 
 
 		 666 aa  155  4e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.54 
 
 		 892 aa  155  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.03 
 
 		 794 aa  154  5.9999999999999996e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.24 
 
 		 784 aa  154  7e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 		 663 aa  153  1e-35  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  26 
 
 		 726 aa  154  1e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.41 
 
 		 858 aa  154  1e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.97 
 
 		 737 aa  153  1e-35  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  23.03 
 
 		 757 aa  153  1e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  23.71 
 
 		 743 aa  153  2e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  25.89 
 
 		 900 aa  152  3e-35  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.32 
 
 		 858 aa  152  3e-35  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.99 
 
 		 775 aa  152  3e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1861  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.2 
 
 		 780 aa  151  6e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.213031 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  27.11 
 
 		 798 aa  151  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.51 
 
 		 806 aa  151  8e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  23.26 
 
 		 634 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  26.59 
 
 		 736 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.07 
 
 		 786 aa  150  1.0000000000000001e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.54 
 
 		 759 aa  150  2.0000000000000003e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2483  DNA helicase II  25.22 
 
 		 807 aa  149  2.0000000000000003e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  20 
 
 		 698 aa  150  2.0000000000000003e-34  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.17 
 
 		 756 aa  150  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  23.3 
 
 		 735 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  23.73 
 
 		 754 aa  149  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.18 
 
 		 857 aa  149  3e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.46 
 
 		 833 aa  148  4.0000000000000006e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  25.25 
 
 		 809 aa  149  4.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1988  ATP-dependent DNA helicase Rep  26 
 
 		 876 aa  149  4.0000000000000006e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0461  UvrD/REP helicase  28.28 
 
 		 715 aa  148  5e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  30.36 
 
 		 795 aa  148  5e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.45 
 
 		 763 aa  148  5e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  28.92 
 
 		 659 aa  147  8.000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  30.16 
 
 		 795 aa  147  9e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.74 
 
 		 762 aa  147  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.22 
 
 		 729 aa  147  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1120  UvrD/REP helicase  26.08 
 
 		 728 aa  146  2e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0169782  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.63 
 
 		 763 aa  146  2e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  25.8 
 
 		 706 aa  146  2e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>