More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_0524 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  41.77 
 
 		 1167 aa  674    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  44.17 
 
 		 1106 aa  712    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  51.76 
 
 		 1144 aa  934    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  43.82 
 
 		 1091 aa  720    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  40.84 
 
 		 1103 aa  691    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  50.79 
 
 		 1162 aa  918    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  57.08 
 
 		 1228 aa  872    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  45.78 
 
 		 1041 aa  769    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  42.32 
 
 		 1119 aa  696    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  39.62 
 
 		 1124 aa  667    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  100 
 
 		 1108 aa  2192    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  43.67 
 
 		 1192 aa  694    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  46.61 
 
 		 1128 aa  719    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  46.73 
 
 		 1120 aa  744    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  42.68 
 
 		 1130 aa  676    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  43.67 
 
 		 1091 aa  721    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  44.26 
 
 		 1111 aa  710    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  43.49 
 
 		 1091 aa  719    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  43.2 
 
 		 1111 aa  712    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  47.03 
 
 		 1090 aa  763    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  62.56 
 
 		 1150 aa  1260    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  40.46 
 
 		 1183 aa  684    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  44.19 
 
 		 1164 aa  723    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  40.89 
 
 		 1073 aa  665    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  57.11 
 
 		 1128 aa  1097    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  43.49 
 
 		 1091 aa  719    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  44.25 
 
 		 1086 aa  676    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  44.2 
 
 		 1101 aa  706    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  58.13 
 
 		 1128 aa  1110    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  42.3 
 
 		 1136 aa  613  9.999999999999999e-175  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  40.4 
 
 		 1088 aa  608  9.999999999999999e-173  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.19 
 
 		 1176 aa  604  1.0000000000000001e-171  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  45.44 
 
 		 1349 aa  599  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.79 
 
 		 1094 aa  580  1e-164  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.58 
 
 		 1119 aa  551  1e-155  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  44.85 
 
 		 1162 aa  543  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  31.35 
 
 		 1343 aa  256  2.0000000000000002e-66  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.1 
 
 		 773 aa  196  2e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  23.33 
 
 		 1397 aa  195  5e-48  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.89 
 
 		 715 aa  193  2e-47  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.81 
 
 		 754 aa  191  8e-47  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.5 
 
 		 763 aa  191  8e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  26.1 
 
 		 757 aa  188  5e-46  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.1 
 
 		 729 aa  188  6e-46  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.43 
 
 		 858 aa  186  2.0000000000000003e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.65 
 
 		 730 aa  186  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.65 
 
 		 730 aa  186  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.8 
 
 		 837 aa  185  5.0000000000000004e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.36 
 
 		 729 aa  184  1e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  24.17 
 
 		 1019 aa  183  1e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.42 
 
 		 741 aa  183  1e-44  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.63 
 
 		 707 aa  182  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.83 
 
 		 833 aa  181  4.999999999999999e-44  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.38 
 
 		 785 aa  181  5.999999999999999e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  27.83 
 
 		 771 aa  181  9e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.03 
 
 		 759 aa  180  1e-43  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  23.29 
 
 		 1016 aa  180  1e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  26.73 
 
 		 705 aa  179  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.12 
 
 		 838 aa  178  4e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  24.9 
 
 		 696 aa  179  4e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04890  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.13 
 
 		 817 aa  178  6e-43  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.08 
 
 		 786 aa  178  6e-43  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.39 
 
 		 756 aa  177  7e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.51 
 
 		 725 aa  177  9e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.97 
 
 		 781 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0537  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.57 
 
 		 711 aa  177  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.97 
 
 		 781 aa  177  9.999999999999999e-43  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.61 
 
 		 831 aa  176  1.9999999999999998e-42  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 		 724 aa  175  3.9999999999999995e-42  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  26.7 
 
 		 768 aa  175  3.9999999999999995e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.2 
 
 		 830 aa  174  6.999999999999999e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  26.14 
 
 		 720 aa  174  7.999999999999999e-42  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  26.14 
 
 		 720 aa  174  7.999999999999999e-42  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  26.14 
 
 		 720 aa  174  9e-42  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  26.14 
 
 		 720 aa  174  9e-42  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.16 
 
 		 751 aa  174  9e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  26.14 
 
 		 720 aa  174  9e-42  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  26.14 
 
 		 720 aa  174  9e-42  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  26.14 
 
 		 720 aa  174  9e-42  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.1 
 
 		 802 aa  174  9e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  26.14 
 
 		 720 aa  174  9e-42  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  26.07 
 
 		 900 aa  173  1e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.31 
 
 		 718 aa  174  1e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.35 
 
 		 781 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  24.49 
 
 		 634 aa  172  3e-41  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  26.01 
 
 		 720 aa  172  3e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  25.7 
 
 		 678 aa  172  3e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  26.36 
 
 		 723 aa  172  3e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.56 
 
 		 795 aa  171  5e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  26.01 
 
 		 720 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  26.01 
 
 		 720 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  26.01 
 
 		 720 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  26.01 
 
 		 720 aa  171  5e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  25.46 
 
 		 770 aa  171  5e-41  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.57 
 
 		 851 aa  171  5e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  26.01 
 
 		 720 aa  171  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.09 
 
 		 858 aa  171  6e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  26.9 
 
 		 746 aa  171  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  24.08 
 
 		 666 aa  171  6e-41  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.16 
 
 		 751 aa  171  7e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>