More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4665 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  51.56 
 
 
1349 aa  712    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  43.56 
 
 
1108 aa  724    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  68.13 
 
 
1101 aa  1369    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  50.4 
 
 
1119 aa  966    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  42.59 
 
 
1120 aa  642    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  72.66 
 
 
1091 aa  1503    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  52.21 
 
 
1090 aa  898    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  47.97 
 
 
1106 aa  776    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  50.92 
 
 
1111 aa  937    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  100 
 
 
1091 aa  2148    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  73.07 
 
 
1091 aa  1506    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  44.04 
 
 
1192 aa  659    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  40.97 
 
 
1128 aa  649    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  45.55 
 
 
1144 aa  758    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  42.58 
 
 
1128 aa  698    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  42.09 
 
 
1150 aa  660    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  73.07 
 
 
1091 aa  1506    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  86.45 
 
 
1086 aa  1725    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  45.9 
 
 
1162 aa  743    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  42.07 
 
 
1041 aa  640    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  41.54 
 
 
1162 aa  611  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  42.29 
 
 
1130 aa  609  1e-173  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  39.55 
 
 
1164 aa  609  9.999999999999999e-173  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.26 
 
 
1111 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  38.58 
 
 
1103 aa  588  1e-166  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  42.77 
 
 
1088 aa  577  1.0000000000000001e-163  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  39.39 
 
 
1073 aa  577  1.0000000000000001e-163  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  41.23 
 
 
1128 aa  575  1.0000000000000001e-162  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  38.38 
 
 
1183 aa  558  1e-157  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.45 
 
 
1176 aa  553  1e-156  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  42.25 
 
 
1228 aa  531  1e-149  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  37.05 
 
 
1167 aa  528  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  38.44 
 
 
1136 aa  505  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.71 
 
 
1094 aa  460  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.85 
 
 
1119 aa  460  9.999999999999999e-129  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  39.12 
 
 
1124 aa  449  1.0000000000000001e-124  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  27.09 
 
 
1343 aa  199  2.0000000000000003e-49  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  24.18 
 
 
1016 aa  185  5.0000000000000004e-45  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.29 
 
 
1019 aa  181  9e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.7 
 
 
773 aa  180  1e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3457  UvrD/REP helicase  28.76 
 
 
700 aa  179  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.37 
 
 
756 aa  176  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 
768 aa  176  1.9999999999999998e-42  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.74 
 
 
639 aa  175  5e-42  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  24.13 
 
 
741 aa  174  6.999999999999999e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  31.36 
 
 
1074 aa  174  7.999999999999999e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.81 
 
 
829 aa  171  5e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 
706 aa  172  5e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 
734 aa  171  6e-41  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  26.64 
 
 
726 aa  169  4e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  23.11 
 
 
630 aa  167  8e-40  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3483  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.26 
 
 
673 aa  167  8e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.5 
 
 
785 aa  167  1.0000000000000001e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  22.72 
 
 
639 aa  167  1.0000000000000001e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.03 
 
 
795 aa  167  1.0000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  26.19 
 
 
669 aa  167  1.0000000000000001e-39  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.11 
 
 
858 aa  167  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  22.35 
 
 
625 aa  166  2.0000000000000002e-39  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.35 
 
 
794 aa  166  2.0000000000000002e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0678  UvrD/REP helicase  27.72 
 
 
783 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0563949  normal  0.0143494 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.49 
 
 
763 aa  165  4.0000000000000004e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  24.01 
 
 
735 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  24.93 
 
 
739 aa  165  4.0000000000000004e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  25.94 
 
 
705 aa  165  5.0000000000000005e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.38 
 
 
737 aa  164  6e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.06 
 
 
1051 aa  164  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  26.38 
 
 
707 aa  164  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.01 
 
 
754 aa  164  1e-38  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1258  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.74 
 
 
864 aa  164  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.887597  normal  0.553101 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  26.75 
 
 
900 aa  162  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  21.21 
 
 
638 aa  162  4e-38  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.49 
 
 
858 aa  162  4e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.55 
 
 
713 aa  162  5e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.3 
 
 
729 aa  161  5e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.3 
 
 
784 aa  161  6e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  23.92 
 
 
743 aa  160  9e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.11 
 
 
785 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.11 
 
 
785 aa  160  1e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.79 
 
 
786 aa  159  2e-37  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  28.92 
 
 
659 aa  160  2e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.85 
 
 
787 aa  159  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.23 
 
 
765 aa  159  2e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.29 
 
 
781 aa  159  2e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.23 
 
 
802 aa  160  2e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  26.23 
 
 
736 aa  159  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  24.33 
 
 
755 aa  158  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5987  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.29 
 
 
851 aa  158  6e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0573497  normal  0.0186357 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6233  DNA-dependent helicase II  26.6 
 
 
728 aa  158  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.80471  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  23.39 
 
 
706 aa  158  7e-37  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10120  DNA/RNA helicase, superfamily I  27.69 
 
 
841 aa  157  8e-37  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000454031 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  26.68 
 
 
786 aa  157  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  27.81 
 
 
759 aa  157  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  24.81 
 
 
678 aa  157  1e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00520  DNA-dependent helicase II  26.91 
 
 
726 aa  157  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.851543  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.03 
 
 
741 aa  157  1e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  26.86 
 
 
846 aa  157  1e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 
787 aa  157  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 
787 aa  157  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0766  UvrD/REP helicase  30.45 
 
 
786 aa  156  2e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.423643  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2092  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.45 
 
 
783 aa  156  2e-36  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0227682  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>