More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1458 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  44.29 
 
 
1120 aa  644    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  50.23 
 
 
1090 aa  873    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  43.86 
 
 
1128 aa  714    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  50.41 
 
 
1349 aa  700    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  68.92 
 
 
1101 aa  1368    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  52 
 
 
1119 aa  969    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  43.71 
 
 
1108 aa  731    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  46.14 
 
 
1162 aa  743    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  72.72 
 
 
1091 aa  1509    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  100 
 
 
1091 aa  2145    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  46.61 
 
 
1144 aa  756    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  51.95 
 
 
1111 aa  933    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  97.8 
 
 
1091 aa  2033    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  42.11 
 
 
1128 aa  649    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  42.45 
 
 
1150 aa  693    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  48.04 
 
 
1106 aa  784    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  41.16 
 
 
1164 aa  653    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  97.8 
 
 
1091 aa  2033    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  74.88 
 
 
1086 aa  1459    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  43.78 
 
 
1041 aa  654    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  42.61 
 
 
1192 aa  630  1e-179  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  40.19 
 
 
1111 aa  600  1e-170  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  43.61 
 
 
1128 aa  602  1e-170  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  38.93 
 
 
1103 aa  600  1e-170  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  41.8 
 
 
1130 aa  586  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  38.93 
 
 
1183 aa  583  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  39.45 
 
 
1167 aa  565  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  39.12 
 
 
1073 aa  565  1.0000000000000001e-159  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  41.75 
 
 
1088 aa  560  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  37.09 
 
 
1124 aa  543  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.98 
 
 
1176 aa  539  1e-151  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.99 
 
 
1228 aa  526  1e-148  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  39.13 
 
 
1136 aa  493  9.999999999999999e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  42.68 
 
 
1162 aa  475  1e-132  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.81 
 
 
1119 aa  472  1.0000000000000001e-131  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.16 
 
 
1094 aa  452  1e-125  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.49 
 
 
729 aa  178  6e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.68 
 
 
773 aa  177  7e-43  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 
768 aa  172  2e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  20.07 
 
 
1016 aa  169  2e-40  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  28.36 
 
 
659 aa  169  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  23.54 
 
 
696 aa  170  2e-40  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.68 
 
 
756 aa  167  6.9999999999999995e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  28.01 
 
 
728 aa  167  6.9999999999999995e-40  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  25.94 
 
 
705 aa  167  1.0000000000000001e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  25.81 
 
 
790 aa  167  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.16 
 
 
639 aa  166  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  28.96 
 
 
1343 aa  166  2.0000000000000002e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  27.34 
 
 
846 aa  166  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  22.34 
 
 
741 aa  165  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  26.59 
 
 
786 aa  165  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.97 
 
 
787 aa  164  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0860  UvrD/Rep family helicase  21.45 
 
 
639 aa  164  7e-39  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.96 
 
 
795 aa  164  8.000000000000001e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.36 
 
 
788 aa  164  8.000000000000001e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.73 
 
 
785 aa  164  1e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  26.3 
 
 
1019 aa  164  1e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  26.97 
 
 
787 aa  164  1e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0674  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.87 
 
 
734 aa  164  1e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.74 
 
 
858 aa  162  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  25.91 
 
 
706 aa  163  2e-38  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1916  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.16 
 
 
818 aa  163  2e-38  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.28639  hitchhiker  0.00561083 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  26.84 
 
 
787 aa  162  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  23.84 
 
 
743 aa  162  4e-38  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.38 
 
 
737 aa  161  7e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  26.68 
 
 
787 aa  161  7e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.57 
 
 
730 aa  161  7e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.78 
 
 
759 aa  160  1e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  26.81 
 
 
787 aa  160  1e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  26.43 
 
 
787 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  25.19 
 
 
772 aa  160  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  27 
 
 
840 aa  160  1e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  26.43 
 
 
787 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.48 
 
 
829 aa  160  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  26.43 
 
 
787 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4873  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.25 
 
 
775 aa  160  1e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.222415  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  26.43 
 
 
787 aa  160  1e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  26.81 
 
 
787 aa  160  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  26.34 
 
 
726 aa  159  2e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  26.81 
 
 
787 aa  160  2e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  26.62 
 
 
787 aa  159  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  25.09 
 
 
826 aa  159  3e-37  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  19.42 
 
 
659 aa  159  3e-37  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  24.36 
 
 
1397 aa  159  3e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.04 
 
 
794 aa  159  3e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  21.99 
 
 
625 aa  158  4e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.02 
 
 
718 aa  158  4e-37  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.09 
 
 
816 aa  159  4e-37  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  25.38 
 
 
736 aa  158  7e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  21.72 
 
 
638 aa  157  8e-37  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.12 
 
 
785 aa  157  8e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.12 
 
 
785 aa  157  8e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4710  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.56 
 
 
784 aa  157  1e-36  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10967  ATP-dependent DNA helicase II uvrD1  25.93 
 
 
771 aa  157  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.227085 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  25.56 
 
 
669 aa  157  1e-36  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  25.76 
 
 
781 aa  157  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0932  putative DNA helicase II  22.65 
 
 
816 aa  157  1e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.156274  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.66 
 
 
741 aa  156  2e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.15 
 
 
838 aa  156  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.1 
 
 
672 aa  157  2e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>