More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_06810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  51.97 
 
 		 1111 aa  958    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  45.07 
 
 		 1150 aa  736    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  52.66 
 
 		 1091 aa  946    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  49.69 
 
 		 1162 aa  851    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  44.35 
 
 		 1162 aa  672    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  46.97 
 
 		 1108 aa  794    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  45.47 
 
 		 1128 aa  752    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  51.02 
 
 		 1119 aa  983    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  45.21 
 
 		 1128 aa  758    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  65.03 
 
 		 1349 aa  1040    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  42.93 
 
 		 1192 aa  652    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  100 
 
 		 1090 aa  2130    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  47.59 
 
 		 1120 aa  758    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  50.32 
 
 		 1091 aa  915    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  45.06 
 
 		 1041 aa  730    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  48.68 
 
 		 1144 aa  861    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  39.26 
 
 		 1183 aa  636    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  45.13 
 
 		 1164 aa  770    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  50.8 
 
 		 1101 aa  893    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  50.45 
 
 		 1106 aa  853    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  50.32 
 
 		 1091 aa  915    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  52.12 
 
 		 1086 aa  873    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.65 
 
 		 1111 aa  691    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  45.84 
 
 		 1128 aa  665    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  50.27 
 
 		 1091 aa  914    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  39.65 
 
 		 1103 aa  626  1e-178  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  39.76 
 
 		 1124 aa  622  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  40.45 
 
 		 1167 aa  623  1e-177  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  42.42 
 
 		 1130 aa  595  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  39.69 
 
 		 1073 aa  586  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  42.65 
 
 		 1088 aa  575  1.0000000000000001e-162  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  44.92 
 
 		 1228 aa  566  1e-160  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  40.72 
 
 		 1136 aa  548  1e-154  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.33 
 
 		 1176 aa  540  9.999999999999999e-153  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.15 
 
 		 1094 aa  520  1e-146  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.48 
 
 		 1119 aa  516  1.0000000000000001e-145  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  29.21 
 
 		 1343 aa  219  2.9999999999999998e-55  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  21.82 
 
 		 1016 aa  195  3e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.53 
 
 		 1019 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  24.48 
 
 		 1397 aa  177  8e-43  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.3 
 
 		 729 aa  174  5.999999999999999e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  26.41 
 
 		 900 aa  172  4e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  27.66 
 
 		 705 aa  171  1e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  24.78 
 
 		 678 aa  168  5e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2224  UvrD/REP helicase  30.1 
 
 		 659 aa  168  5.9999999999999996e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.78 
 
 		 773 aa  167  9e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.33 
 
 		 786 aa  166  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25.13 
 
 		 678 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1719  UvrD/REP helicase  29.77 
 
 		 646 aa  166  3e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.571128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  26.15 
 
 		 768 aa  165  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.71 
 
 		 785 aa  164  7e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  24.41 
 
 		 678 aa  164  7e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  26.91 
 
 		 685 aa  164  9e-39  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.92 
 
 		 729 aa  163  2e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 760 aa  163  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  26.28 
 
 		 669 aa  162  3e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.85 
 
 		 737 aa  160  8e-38  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  22.58 
 
 		 666 aa  160  9e-38  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.13 
 
 		 857 aa  160  1e-37  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  26.28 
 
 		 762 aa  159  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.17 
 
 		 707 aa  158  5.0000000000000005e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  22.38 
 
 		 630 aa  158  6e-37  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2069  UvrD/REP helicase  25.59 
 
 		 665 aa  158  6e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000529489  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1397  UvrD/REP helicase  23.73 
 
 		 625 aa  157  8e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.477297  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.07 
 
 		 730 aa  157  8e-37  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.9 
 
 		 662 aa  157  1e-36  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.16 
 
 		 672 aa  157  1e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.06 
 
 		 718 aa  156  2e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4295  UvrD/REP helicase  25.06 
 
 		 799 aa  156  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10008  putative helicase  24.38 
 
 		 773 aa  155  2.9999999999999998e-36  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  25.61 
 
 		 736 aa  155  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.9 
 
 		 794 aa  156  2.9999999999999998e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.65 
 
 		 730 aa  155  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.65 
 
 		 730 aa  155  2.9999999999999998e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.49 
 
 		 713 aa  154  7e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  26.06 
 
 		 790 aa  154  7e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.21 
 
 		 763 aa  154  7e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0898  ATP-dependent helicase PcrA  23.77 
 
 		 634 aa  154  8.999999999999999e-36  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1235  UvrD/REP helicase  24.71 
 
 		 680 aa  154  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0233  ATP-dependent DNA helicase Rep  21.73 
 
 		 639 aa  154  1e-35  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.99 
 
 		 795 aa  154  1e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  23.06 
 
 		 682 aa  154  1e-35  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2449  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.56 
 
 		 726 aa  152  2e-35  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.170877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2002  UvrD/REP helicase  26.85 
 
 		 668 aa  152  4e-35  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0486961  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  24.42 
 
 		 743 aa  152  4e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  27.84 
 
 		 735 aa  152  4e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.37 
 
 		 756 aa  152  4e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3651  UvrD/REP helicase  26.89 
 
 		 641 aa  152  4e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00677749  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.42 
 
 		 694 aa  152  4e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1037  DNA-dependent helicase II  26.34 
 
 		 726 aa  151  5e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.2 
 
 		 663 aa  151  5e-35  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  28.05 
 
 		 795 aa  151  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.65 
 
 		 762 aa  151  6e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  24.57 
 
 		 723 aa  151  8e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1212  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.55 
 
 		 892 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.771972  normal  0.554 
 
 
-
 
NC_002978  WD0963  helicase II - UvrD/PcrA  21.29 
 
 		 638 aa  150  1.0000000000000001e-34  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.46 
 
 		 765 aa  150  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.42 
 
 		 1023 aa  150  1.0000000000000001e-34  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1017  UvrD/REP helicase  26.43 
 
 		 733 aa  149  2.0000000000000003e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  25.77 
 
 		 783 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>