More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_0780 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.96 
 
 		 1090 aa  640    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  57.21 
 
 		 1111 aa  1137    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  42.48 
 
 		 1167 aa  707    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  46.36 
 
 		 1162 aa  724    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1192 aa  2305    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  42.31 
 
 		 1091 aa  644    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  43.59 
 
 		 1108 aa  711    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  46.46 
 
 		 1144 aa  746    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.54 
 
 		 1094 aa  652    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  42.91 
 
 		 1101 aa  646    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  49.42 
 
 		 1103 aa  947    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  51.25 
 
 		 1128 aa  821    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.56 
 
 		 1176 aa  636    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  43.61 
 
 		 1106 aa  644    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  44.49 
 
 		 1041 aa  721    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  48.94 
 
 		 1136 aa  794    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  44.4 
 
 		 1150 aa  683    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  44.12 
 
 		 1091 aa  683    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  42.94 
 
 		 1111 aa  669    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  42.63 
 
 		 1091 aa  647    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  43.46 
 
 		 1128 aa  685    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  55.02 
 
 		 1162 aa  1014    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  41.22 
 
 		 1119 aa  637    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  42.61 
 
 		 1183 aa  703    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  42.92 
 
 		 1128 aa  669    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  43.61 
 
 		 1164 aa  685    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  42.63 
 
 		 1091 aa  647    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  43.74 
 
 		 1119 aa  683    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  42.54 
 
 		 1130 aa  626  1e-178  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  42.51 
 
 		 1120 aa  629  1e-178  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  42.55 
 
 		 1086 aa  617  1e-175  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  39.53 
 
 		 1073 aa  587  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  43.2 
 
 		 1088 aa  583  1.0000000000000001e-165  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  43.62 
 
 		 1228 aa  551  1e-155  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  44.38 
 
 		 1349 aa  527  1e-148  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  39.27 
 
 		 1124 aa  454  1.0000000000000001e-126  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  30.53 
 
 		 1343 aa  270  2e-70  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  27.02 
 
 		 1397 aa  205  4e-51  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.71 
 
 		 715 aa  171  9e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.15 
 
 		 707 aa  164  8.000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  26.54 
 
 		 705 aa  163  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  25.54 
 
 		 900 aa  162  3e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0699  UvrD/Rep family helicase  22.98 
 
 		 689 aa  162  3e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28230  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.83 
 
 		 857 aa  162  4e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.28 
 
 		 753 aa  162  4e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.04 
 
 		 787 aa  161  8e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.14 
 
 		 753 aa  160  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.39 
 
 		 858 aa  159  2e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 846 aa  160  2e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.42 
 
 		 833 aa  159  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.13 
 
 		 732 aa  159  4e-37  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.51 
 
 		 741 aa  158  5.0000000000000005e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 		 787 aa  157  1e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.11 
 
 		 751 aa  156  2e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.33 
 
 		 747 aa  157  2e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.11 
 
 		 747 aa  156  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  25.11 
 
 		 753 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  25.11 
 
 		 751 aa  156  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.11 
 
 		 751 aa  155  2.9999999999999998e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.87 
 
 		 858 aa  155  2.9999999999999998e-36  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  26.29 
 
 		 787 aa  155  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  22.52 
 
 		 724 aa  154  8.999999999999999e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.14 
 
 		 751 aa  154  1e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.14 
 
 		 747 aa  154  1e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  26.14 
 
 		 840 aa  154  1e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.86 
 
 		 725 aa  153  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 738 aa  152  3e-35  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  26.03 
 
 		 787 aa  152  4e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.15 
 
 		 773 aa  151  8e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1536  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.35 
 
 		 768 aa  150  9e-35  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.305848  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  25.8 
 
 		 743 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2947  UvrD/REP helicase  23.8 
 
 		 678 aa  149  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.51 
 
 		 729 aa  149  2.0000000000000003e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1337  UvrD/REP helicase  24.06 
 
 		 678 aa  150  2.0000000000000003e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.34 
 
 		 849 aa  150  2.0000000000000003e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1537  UvrD/REP helicase  31.26 
 
 		 688 aa  149  2.0000000000000003e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.45 
 
 		 737 aa  150  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  25.28 
 
 		 790 aa  149  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  30.24 
 
 		 795 aa  149  3e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1021  UvrD/REP helicase  25.56 
 
 		 783 aa  149  4.0000000000000006e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.751613  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.55 
 
 		 795 aa  149  4.0000000000000006e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.27 
 
 		 785 aa  149  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.27 
 
 		 785 aa  149  4.0000000000000006e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  29.41 
 
 		 663 aa  148  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  25.69 
 
 		 787 aa  148  6e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  25.69 
 
 		 787 aa  148  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  25.69 
 
 		 787 aa  148  6e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27 
 
 		 838 aa  148  6e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0723  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.94 
 
 		 896 aa  148  6e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.363449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  25.69 
 
 		 787 aa  148  6e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  25.19 
 
 		 741 aa  147  9e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  22.63 
 
 		 666 aa  147  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  25.57 
 
 		 787 aa  147  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  30.25 
 
 		 798 aa  147  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  30.09 
 
 		 795 aa  147  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  25.57 
 
 		 787 aa  146  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4188  UvrD/REP helicase  29.74 
 
 		 1180 aa  147  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000134392 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  25.44 
 
 		 787 aa  146  2e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  27.25 
 
 		 728 aa  147  2e-33  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  24.52 
 
 		 757 aa  146  2e-33  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>