More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BLD_0954 on replicon NC_010816
Organism: Bifidobacterium longum DJO10A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013721  HMPREF0424_1153  UvrD/REP helicase  40.72 
 
 		 1397 aa  958    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.546412 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  100 
 
 		 1343 aa  2734    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  28.72 
 
 		 1103 aa  290  9e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.61 
 
 		 1111 aa  290  2e-76  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  31.2 
 
 		 1128 aa  268  4e-70  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  31.3 
 
 		 1162 aa  268  7e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.12 
 
 		 1094 aa  264  1e-68  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  31.35 
 
 		 1108 aa  259  3e-67  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  29.43 
 
 		 1228 aa  258  5e-67  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  27.08 
 
 		 1101 aa  253  1e-65  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  29.67 
 
 		 1073 aa  253  1e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  29.81 
 
 		 1183 aa  252  3e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  30.26 
 
 		 1041 aa  251  6e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  30.85 
 
 		 1106 aa  250  1e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  29.41 
 
 		 1162 aa  248  8e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  30.08 
 
 		 1192 aa  247  9.999999999999999e-64  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  29.69 
 
 		 1167 aa  244  9e-63  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  30.3 
 
 		 1128 aa  244  1e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  29.41 
 
 		 1144 aa  240  1e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  30.96 
 
 		 1150 aa  239  3e-61  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.55 
 
 		 1176 aa  235  4.0000000000000004e-60  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  29.46 
 
 		 1120 aa  234  1e-59  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  29.58 
 
 		 1124 aa  231  9e-59  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  28.52 
 
 		 1119 aa  230  1e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  29.27 
 
 		 1111 aa  228  8e-58  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  27.07 
 
 		 1164 aa  223  9.999999999999999e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  28.78 
 
 		 1349 aa  216  2.9999999999999995e-54  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  28.51 
 
 		 1130 aa  214  1e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  27.85 
 
 		 1128 aa  210  1e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  28.36 
 
 		 1086 aa  209  3e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  28.81 
 
 		 1088 aa  201  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  29.58 
 
 		 1090 aa  198  6e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  27.19 
 
 		 1091 aa  198  6e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.8 
 
 		 1119 aa  181  9e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  29.9 
 
 		 1136 aa  162  5e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  28.67 
 
 		 1091 aa  158  8e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  28.24 
 
 		 1091 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  28.24 
 
 		 1091 aa  155  4e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  24.22 
 
 		 789 aa  127  1e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4114  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25 
 
 		 781 aa  126  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4154  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.87 
 
 		 781 aa  126  3e-27  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.906632 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.75 
 
 		 690 aa  122  7e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.87 
 
 		 828 aa  119  3e-25  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4232  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.33 
 
 		 781 aa  116  2.0000000000000002e-24  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.491131  normal  0.505763 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2537  UvrD/REP helicase  26.41 
 
 		 672 aa  116  3e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.423083  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  26.57 
 
 		 739 aa  115  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  26.77 
 
 		 743 aa  114  9e-24  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  27.4 
 
 		 709 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  27.4 
 
 		 709 aa  113  2.0000000000000002e-23  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.33 
 
 		 849 aa  113  2.0000000000000002e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.56 
 
 		 797 aa  113  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0626  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.28 
 
 		 671 aa  112  6e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  25.4 
 
 		 790 aa  112  7.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.83 
 
 		 795 aa  111  1e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  24.4 
 
 		 677 aa  110  2e-22  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 783 aa  110  2e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  23.77 
 
 		 724 aa  109  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.59 
 
 		 677 aa  109  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.16 
 
 		 731 aa  108  6e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  23.78 
 
 		 706 aa  108  9e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1525  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.78 
 
 		 772 aa  107  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.18 
 
 		 674 aa  107  1e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.6 
 
 		 783 aa  107  1e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03656  DNA helicase and single-stranded DNA-dependent ATPase  25.26 
 
 		 673 aa  107  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0354982  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2140  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.31 
 
 		 667 aa  107  2e-21  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90387  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03605  hypothetical protein  25.26 
 
 		 673 aa  107  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0230376  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4242  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.64 
 
 		 674 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.907548  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5211  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.26 
 
 		 673 aa  107  2e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.8 
 
 		 672 aa  107  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4139  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.64 
 
 		 674 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4143  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.26 
 
 		 673 aa  107  2e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.9 
 
 		 787 aa  106  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  24 
 
 		 755 aa  107  2e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.42 
 
 		 786 aa  106  2e-21  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3994  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.05 
 
 		 673 aa  107  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.14 
 
 		 858 aa  106  2e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4142  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.05 
 
 		 673 aa  107  2e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.11002  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4193  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.64 
 
 		 674 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4225  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.05 
 
 		 673 aa  107  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.64 
 
 		 707 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5235  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.45 
 
 		 781 aa  107  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00141788 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4288  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.26 
 
 		 673 aa  107  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4301  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.64 
 
 		 674 aa  107  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.165801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.2 
 
 		 674 aa  107  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.36 
 
 		 833 aa  106  3e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0199  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.51 
 
 		 674 aa  106  3e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  27.24 
 
 		 1143 aa  106  3e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0468  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.71 
 
 		 670 aa  106  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.66 
 
 		 729 aa  106  4e-21  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2767  UvrD/REP helicase  25.84 
 
 		 848 aa  106  4e-21  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.053662 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.82 
 
 		 797 aa  105  4e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4199  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.84 
 
 		 673 aa  105  5e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.39 
 
 		 794 aa  105  5e-21  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1474  UvrD/REP helicase  25.29 
 
 		 781 aa  105  7e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.517963 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.45 
 
 		 671 aa  105  8e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0813  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.38 
 
 		 830 aa  105  8e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00156939  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4007  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.53 
 
 		 673 aa  105  8e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00646067 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.88 
 
 		 837 aa  104  9e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  29.05 
 
 		 737 aa  104  1e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.85 
 
 		 675 aa  104  1e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>