More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1132 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4130  UvrD/REP helicase  47.38 
 
 		 1162 aa  776    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.88214 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  52.49 
 
 		 1349 aa  752    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  43.67 
 
 		 1041 aa  667    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  42.98 
 
 		 1108 aa  708    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3821  UvrD/REP helicase  43.48 
 
 		 1150 aa  689    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0155122  decreased coverage  0.00328324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 1111 aa  2174    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1458  UvrD/REP helicase  52.29 
 
 		 1091 aa  929    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.901245  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  44.42 
 
 		 1120 aa  649    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  43 
 
 		 1128 aa  679    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1404  UvrD/REP helicase  52.43 
 
 		 1091 aa  936    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3748  UvrD/REP helicase  46.43 
 
 		 1144 aa  777    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.355168 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0780  UvrD/REP helicase  43.03 
 
 		 1192 aa  656    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.15427  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3500  UvrD/REP helicase  56.78 
 
 		 1119 aa  1119    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.516923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2144  UvrD/REP helicase  49.56 
 
 		 1106 aa  801    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.101146  hitchhiker  0.00462342 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13224  ATP-dependent DNA helicase  52.25 
 
 		 1101 aa  956    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1775  UvrD/REP helicase  42.25 
 
 		 1164 aa  647    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.579512 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1422  UvrD/REP helicase  52.43 
 
 		 1091 aa  936    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06810  DNA/RNA helicase, superfamily I  51.98 
 
 		 1090 aa  925    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.289217  normal  0.25894 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1802  UvrD/REP helicase  52.44 
 
 		 1086 aa  888    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.103668  normal  0.0746176 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3753  UvrD/REP helicase  44.36 
 
 		 1128 aa  696    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0304881  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4665  UvrD/REP helicase  51.19 
 
 		 1091 aa  931    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.6139  normal  0.718694 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27640  DNA/RNA helicase, superfamily I  42.07 
 
 		 1111 aa  628  1e-178  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0910071  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  39.49 
 
 		 1103 aa  620  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  44.4 
 
 		 1128 aa  615  9.999999999999999e-175  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2473  UvrD/REP helicase  42.91 
 
 		 1162 aa  612  1e-173  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.131096  hitchhiker  0.00644747 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  40.79 
 
 		 1130 aa  593  1e-168  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1509  UvrD/REP helicase  39.55 
 
 		 1073 aa  589  1e-166  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.254062  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2478  UvrD/REP helicase  39.07 
 
 		 1167 aa  580  1e-164  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000366481 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2756  UvrD/REP helicase  38.47 
 
 		 1183 aa  582  1e-164  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  40.73 
 
 		 1088 aa  562  1e-158  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  37.76 
 
 		 1124 aa  555  1e-156  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  40.24 
 
 		 1136 aa  537  1e-151  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15090  DNA/RNA helicase, superfamily I  37.11 
 
 		 1176 aa  504  1e-141  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  39.63 
 
 		 1094 aa  498  1e-139  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8376  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  41.51 
 
 		 1228 aa  494  9.999999999999999e-139  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19190  DNA/RNA helicase, superfamily I  38.71 
 
 		 1119 aa  493  1e-137  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00563476  normal  0.0769767 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0954  superfamily I DNA and RNA helicase  29.27 
 
 		 1343 aa  224  6e-57  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.31 
 
 		 1019 aa  182  4e-44  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.72 
 
 		 707 aa  171  1e-40  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  26.45 
 
 		 786 aa  169  2.9999999999999998e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1590  UvrD/REP helicase  26.37 
 
 		 790 aa  168  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.68 
 
 		 787 aa  167  8e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 846 aa  166  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  26.73 
 
 		 840 aa  166  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  26.56 
 
 		 787 aa  166  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.09 
 
 		 756 aa  165  6e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  26.45 
 
 		 787 aa  164  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.14 
 
 		 741 aa  164  1e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  26.66 
 
 		 787 aa  162  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.33 
 
 		 729 aa  160  1e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  26.04 
 
 		 787 aa  160  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  27.43 
 
 		 768 aa  159  3e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  24.94 
 
 		 666 aa  159  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.54 
 
 		 787 aa  159  4e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  25.93 
 
 		 787 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0742  DNA helicase II  25.93 
 
 		 787 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0421  DNA helicase II  25.93 
 
 		 787 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1461  DNA helicase II  25.93 
 
 		 787 aa  157  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.564541  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0398  UvrD/REP helicase  28.18 
 
 		 798 aa  157  9e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.970559 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  25.93 
 
 		 787 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  25.93 
 
 		 787 aa  157  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  31.04 
 
 		 1059 aa  156  2e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1536  UvrD/REP helicase  26.6 
 
 		 809 aa  156  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1670  DNA helicase II  25.81 
 
 		 787 aa  156  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2440  UvrD/REP helicase  27.87 
 
 		 786 aa  155  4e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.605331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0367  UvrD/REP helicase  27.82 
 
 		 795 aa  155  5e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.944301  normal  0.78423 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  28.18 
 
 		 795 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  28.02 
 
 		 829 aa  154  7e-36  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.02 
 
 		 730 aa  154  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.02 
 
 		 730 aa  154  7e-36  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.56 
 
 		 786 aa  153  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1339  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.8 
 
 		 828 aa  153  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.574982  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1337  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.05 
 
 		 783 aa  153  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29 
 
 		 795 aa  153  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.65 
 
 		 762 aa  152  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.5 
 
 		 729 aa  152  4e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2047  UvrD/REP helicase  28.12 
 
 		 786 aa  152  4e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  26.67 
 
 		 706 aa  152  4e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  24.35 
 
 		 807 aa  152  5e-35  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.83 
 
 		 858 aa  151  6e-35  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0047  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.13 
 
 		 849 aa  151  7e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.760315  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2797  UvrD/REP helicase  25.8 
 
 		 783 aa  151  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265943  normal  0.311866 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.28 
 
 		 838 aa  150  1.0000000000000001e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  25.14 
 
 		 696 aa  150  1.0000000000000001e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  26.25 
 
 		 721 aa  150  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.76 
 
 		 794 aa  150  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2677  UvrD/REP helicase  26.94 
 
 		 826 aa  150  2.0000000000000003e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  26.88 
 
 		 743 aa  150  2.0000000000000003e-34  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  23.87 
 
 		 630 aa  149  2.0000000000000003e-34  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  27.88 
 
 		 739 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  19.25 
 
 		 1016 aa  149  2.0000000000000003e-34  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  30.98 
 
 		 1060 aa  149  3e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.57 
 
 		 786 aa  149  3e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  25.63 
 
 		 723 aa  149  3e-34  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3324  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.94 
 
 		 816 aa  149  3e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0235629 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  27.82 
 
 		 728 aa  149  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1142  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.76 
 
 		 788 aa  149  4.0000000000000006e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.140222 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.48 
 
 		 751 aa  148  4.0000000000000006e-34  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  30.51 
 
 		 1044 aa  148  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.82 
 
 		 748 aa  148  5e-34  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>