More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3822 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_06800  DNA/RNA helicase, superfamily I  43.36 
 
 
1066 aa  679    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.860602  normal  0.467007 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4244  UvrD/REP helicase  49.58 
 
 
1062 aa  744    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.664691  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8377  Superfamily I DNA and RNA helicase-like protein  60.13 
 
 
1051 aa  1122    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  67.61 
 
 
1044 aa  1358    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4131  UvrD/REP helicase  48.57 
 
 
1096 aa  776    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.81155  normal  0.92786 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3754  UvrD/REP helicase  60.26 
 
 
1059 aa  1124    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.216008  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0852  UvrD/REP helicase  47.28 
 
 
1050 aa  742    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.986974  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2974  UvrD/REP helicase  58.9 
 
 
1074 aa  1082    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7808  UvrD/REP helicase  45.41 
 
 
1134 aa  730    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3822  UvrD/REP helicase  100 
 
 
1060 aa  2067    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0180671  hitchhiker  0.00809927 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1776  UvrD/REP helicase  43.2 
 
 
1095 aa  676    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.337618 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  44.68 
 
 
1060 aa  639    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4583  UvrD/REP helicase  43.65 
 
 
1040 aa  691    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.542582  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3749  UvrD/REP helicase  47.4 
 
 
1144 aa  780    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.612436  normal  0.203306 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0925  UvrD/REP helicase  43.88 
 
 
1135 aa  651    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.963076 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3800  UvrD/REP helicase  43.18 
 
 
1103 aa  588  1e-166  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0835078  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13225  ATP-dependent DNA helicase  39.58 
 
 
1055 aa  575  1.0000000000000001e-162  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1171  UvrD/REP helicase  44.15 
 
 
1098 aa  561  1e-158  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.132239  normal  0.301474 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1403  UvrD/REP helicase  39.51 
 
 
1051 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1421  UvrD/REP helicase  39.51 
 
 
1051 aa  535  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1801  UvrD/REP helicase  38.09 
 
 
1038 aa  528  1e-148  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.078646 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2143  UvrD/REP helicase  40.02 
 
 
1099 aa  524  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.23473  hitchhiker  0.00187143 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1457  UvrD/REP helicase  39.01 
 
 
1051 aa  520  1e-146  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0431152  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3501  UvrD/REP helicase  39.06 
 
 
1129 aa  519  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.235136  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4666  UvrD/REP helicase  37.66 
 
 
1038 aa  518  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0501158  normal  0.218907 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27650  DNA/RNA helicase, superfamily I  36.94 
 
 
1124 aa  503  1e-141  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.292433  normal  0.663943 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2479  UvrD/REP helicase  36.66 
 
 
1115 aa  499  1e-139  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000159355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2474  UvrD/REP helicase  39.21 
 
 
1076 aa  488  1e-136  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719714  hitchhiker  0.00582507 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1131  UvrD/REP helicase  38.69 
 
 
1094 aa  489  1e-136  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0711  UvrD/REP helicase  34.18 
 
 
1059 aa  460  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2757  UvrD/REP helicase  35.97 
 
 
1150 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.21598  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15100  DNA/RNA helicase, superfamily I  35.38 
 
 
1145 aa  406  1e-111  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2902  UvrD/REP helicase  35.18 
 
 
1085 aa  357  5.999999999999999e-97  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.401068  normal  0.0918032 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19200  DNA/RNA helicase, superfamily I  34.32 
 
 
1083 aa  348  2e-94  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.11601  normal  0.0259599 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11360  DNA/RNA helicase, superfamily I  32.88 
 
 
1058 aa  322  1.9999999999999998e-86  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.556014  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0779  UvrD/REP helicase  37.66 
 
 
1197 aa  322  3e-86  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  22.85 
 
 
946 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  22.85 
 
 
946 aa  206  1e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0625  UvrD/REP helicase  25.89 
 
 
1019 aa  188  5e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.243128  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  30.73 
 
 
739 aa  187  7e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3374  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.52 
 
 
671 aa  186  2.0000000000000003e-45  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.654782  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.84 
 
 
731 aa  184  1e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 
807 aa  183  2e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  21.98 
 
 
1016 aa  182  4e-44  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3456  UvrD/REP helicase  30.54 
 
 
671 aa  181  7e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3520  UvrD/REP helicase  30.41 
 
 
671 aa  180  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.17 
 
 
762 aa  177  8e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.352093 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  27.41 
 
 
707 aa  177  8e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1514  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.33 
 
 
755 aa  176  1.9999999999999998e-42  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0577  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.9 
 
 
743 aa  176  2.9999999999999996e-42  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.893036  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.04 
 
 
759 aa  171  8e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0381  UvrD/REP helicase  30.54 
 
 
688 aa  170  1e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0971471 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29 
 
 
694 aa  170  1e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3458  UvrD/REP helicase  26.96 
 
 
762 aa  169  2e-40  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.78 
 
 
742 aa  168  4e-40  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0524  putative DNA helicase  30.14 
 
 
1108 aa  168  5e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.98499  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  28.21 
 
 
741 aa  167  6.9999999999999995e-40  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.2 
 
 
768 aa  167  9e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.44 
 
 
658 aa  167  1.0000000000000001e-39  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.6 
 
 
1023 aa  166  2.0000000000000002e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.19 
 
 
718 aa  165  3e-39  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  30.39 
 
 
1103 aa  165  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0627  superfamily I DNA and RNA helicase  26.79 
 
 
900 aa  164  6e-39  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.40075  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.61 
 
 
715 aa  164  7e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3440  UvrD/REP helicase  29.69 
 
 
682 aa  164  8.000000000000001e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.155249  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.1 
 
 
786 aa  163  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.35 
 
 
781 aa  164  1e-38  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.5 
 
 
745 aa  163  2e-38  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  24.15 
 
 
655 aa  163  2e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0647  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.23 
 
 
838 aa  163  2e-38  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0160292  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  28.17 
 
 
787 aa  163  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2973  UvrD/REP helicase  29.6 
 
 
1128 aa  163  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.707906 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3651  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.22 
 
 
682 aa  161  5e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0368  superfamily I DNA/RNA helicase  25.27 
 
 
696 aa  161  5e-38  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.14 
 
 
785 aa  160  1e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  30.08 
 
 
666 aa  160  1e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.19 
 
 
725 aa  159  2e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0971  UvrD/REP helicase  26.31 
 
 
668 aa  159  2e-37  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0211694  normal  0.301959 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1633  UvrD/REP helicase  26.11 
 
 
681 aa  159  2e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  31.13 
 
 
797 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.8 
 
 
739 aa  159  3e-37  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0481  UvrD/REP helicase  27.13 
 
 
736 aa  159  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.66 
 
 
658 aa  159  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.9 
 
 
753 aa  159  4e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.09 
 
 
802 aa  158  4e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  27.01 
 
 
726 aa  159  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  25.84 
 
 
678 aa  158  5.0000000000000005e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0209  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 
786 aa  158  5.0000000000000005e-37  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000644419  normal  0.953058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1132  UvrD/REP helicase  31.04 
 
 
1111 aa  158  6e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.378694  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.9 
 
 
753 aa  158  6e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47860  ATP-dependent DNA helicase Rep protein  27.4 
 
 
669 aa  158  6e-37  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.99 
 
 
858 aa  158  7e-37  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  26.01 
 
 
770 aa  157  9e-37  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0334  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.8 
 
 
747 aa  157  1e-36  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  24.8 
 
 
753 aa  157  1e-36  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  24.8 
 
 
751 aa  157  1e-36  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.8 
 
 
751 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.8 
 
 
751 aa  157  1e-36  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0286  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.36 
 
 
747 aa  157  1e-36  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  28.01 
 
 
705 aa  157  1e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>