118 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06202 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009784  VIBHAR_06202  hypothetical protein  100 
 
 		 163 aa  340  5e-93  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3192  UvrD/REP helicase  52.94 
 
 		 615 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1603  UvrD/REP helicase  47.5 
 
 		 641 aa  118  3.9999999999999996e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4279  UvrD/REP helicase  42.86 
 
 		 556 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4419  UvrD/REP helicase  42.86 
 
 		 556 aa  115  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0047  UvrD/REP helicase family protein  45.08 
 
 		 634 aa  105  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2953  UvrD/REP helicase  44.44 
 
 		 615 aa  104  5e-22  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4275  UvrD/REP helicase  41.1 
 
 		 554 aa  104  6e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0143761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3174  UvrD/REP helicase  40.27 
 
 		 557 aa  103  1e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2560  UvrD/REP helicase  39.46 
 
 		 553 aa  101  5e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.232934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3681  helicase, putative  35.57 
 
 		 552 aa  100  1e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1675  UvrD/REP helicase family protein  51.4 
 
 		 212 aa  97.4  8e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0387557  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3526  hypothetical protein  41.53 
 
 		 617 aa  94  8e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.396406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0195  UvrD/REP helicase family protein  46.94 
 
 		 614 aa  85.1  4e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  29.81 
 
 		 754 aa  49.7  0.00002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.93 
 
 		 730 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.93 
 
 		 730 aa  47  0.0001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  31.08 
 
 		 726 aa  46.6  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  32.26 
 
 		 722 aa  45.4  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7996  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.76 
 
 		 806 aa  45.4  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1445  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.43 
 
 		 757 aa  45.8  0.0003  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.715662  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4243  UvrD/REP helicase  41.07 
 
 		 1120 aa  45.4  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  30.67 
 
 		 721 aa  45.8  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.23 
 
 		 785 aa  45.4  0.0003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  31.63 
 
 		 732 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  29.73 
 
 		 722 aa  45.1  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  29.73 
 
 		 722 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  29.73 
 
 		 722 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  29.73 
 
 		 722 aa  45.1  0.0004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  29.73 
 
 		 722 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  29.73 
 
 		 722 aa  45.1  0.0004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  29.73 
 
 		 722 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  29.73 
 
 		 722 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  29.73 
 
 		 722 aa  45.1  0.0004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3593  ATP-dependent DNA helicase PcrA  33.72 
 
 		 797 aa  45.1  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.420917  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  29.33 
 
 		 721 aa  44.7  0.0005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4223  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.84 
 
 		 768 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.80047  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0670  ATP-dependent DNA helicase PcrA  39.29 
 
 		 833 aa  44.7  0.0005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.117887 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  31.82 
 
 		 720 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  31.82 
 
 		 720 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  30.67 
 
 		 727 aa  44.7  0.0006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  31.82 
 
 		 720 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  31.82 
 
 		 720 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  35.19 
 
 		 723 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1759  DNA helicase IV  30.95 
 
 		 684 aa  44.7  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0441895  hitchhiker  0.00104855 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  31.82 
 
 		 720 aa  44.3  0.0006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  31.82 
 
 		 720 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  31.82 
 
 		 720 aa  44.7  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  31.82 
 
 		 720 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  31.82 
 
 		 720 aa  44.7  0.0006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  35.85 
 
 		 720 aa  44.3  0.0007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  29.33 
 
 		 721 aa  44.3  0.0007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  35.85 
 
 		 720 aa  44.3  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.92 
 
 		 829 aa  44.3  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0621  DNA helicase  32.47 
 
 		 1715 aa  43.9  0.0009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1831  UvrD/REP helicase  33.8 
 
 		 779 aa  43.9  0.0009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0474  ATP-dependent DNA helicase UvrD  31.17 
 
 		 1469 aa  43.5  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.872336  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2793  ATP-dependent DNA helicase  28.12 
 
 		 737 aa  43.5  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000978375  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0825  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36 
 
 		 694 aa  43.5  0.001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  39.29 
 
 		 757 aa  43.5  0.001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1508  UvrD/REP helicase  32.14 
 
 		 1060 aa  43.5  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  32.84 
 
 		 721 aa  43.9  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.89 
 
 		 741 aa  43.5  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0467  UvrD/REP helicase  29.13 
 
 		 603 aa  43.9  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.82885  normal  0.469599 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  32.56 
 
 		 946 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0098  UvrD/REP helicase  30.11 
 
 		 779 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.404442 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  32.56 
 
 		 946 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0661  UvrD/REP helicase  27.66 
 
 		 708 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.612479  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04260  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.1 
 
 		 858 aa  43.5  0.001  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  32.76 
 
 		 720 aa  43.5  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  32.76 
 
 		 720 aa  43.5  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  36.21 
 
 		 729 aa  42.7  0.002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2580  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.41 
 
 		 754 aa  42.7  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_51012  protein required for proper timing of committment to meiotic recombination and the transition from Meiosis I to Meiosis II  36.07 
 
 		 908 aa  42.7  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.875639  normal  0.91244 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_29314  ATP-dependent DNA helicase HMI1, mitochondrial precursor  29.27 
 
 		 864 aa  43.1  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  32 
 
 		 744 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  34.15 
 
 		 725 aa  43.1  0.002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0365  putative ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.49 
 
 		 1023 aa  42.4  0.003  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3589  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 746 aa  42.4  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0116142  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0760  ATP-dependent DNA helicase PcrA  37.5 
 
 		 737 aa  42  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0656  DNA helicase IV  32.89 
 
 		 699 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1050  UvrD/REP helicase  31.87 
 
 		 597 aa  42.4  0.003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  33.96 
 
 		 734 aa  42  0.003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0291  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.27 
 
 		 751 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0275  ATP-dependent DNA helicase  30.59 
 
 		 753 aa  42  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0278  ATP-dependent DNA helicase  30.59 
 
 		 751 aa  42  0.004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0305  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.27 
 
 		 747 aa  41.6  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.96 
 
 		 748 aa  42  0.004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 648 aa  41.6  0.004  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0285  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.47 
 
 		 741 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  35.19 
 
 		 720 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00351  DNA-dependent helicase II  32.84 
 
 		 724 aa  42  0.004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0545  DNA-dependent helicase II  35.19 
 
 		 720 aa  42  0.004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002086  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA  32.84 
 
 		 724 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4007  DNA-dependent helicase II  35.19 
 
 		 720 aa  42  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.984144  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  33.33 
 
 		 648 aa  41.6  0.004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0377  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.59 
 
 		 751 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.59 
 
 		 753 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4969  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.59 
 
 		 753 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0336  ATP-dependent DNA helicase PcrA  30.59 
 
 		 751 aa  42  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>