More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_1603 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_1603  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 641 aa  1311    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3192  UvrD/REP helicase  42.61 
 
 		 615 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0047  UvrD/REP helicase family protein  36.18 
 
 		 634 aa  381  1e-104  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3526  hypothetical protein  34.15 
 
 		 617 aa  343  4e-93  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.396406  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2953  UvrD/REP helicase  35.2 
 
 		 615 aa  310  4e-83  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0195  UvrD/REP helicase family protein  32.76 
 
 		 614 aa  299  9e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4279  UvrD/REP helicase  31.66 
 
 		 556 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4419  UvrD/REP helicase  31.66 
 
 		 556 aa  279  1e-73  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3681  helicase, putative  30.38 
 
 		 552 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2560  UvrD/REP helicase  31.82 
 
 		 553 aa  213  5.999999999999999e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.232934 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0507  UvrD/REP helicase family protein  33.25 
 
 		 421 aa  211  2e-53  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4275  UvrD/REP helicase  31.96 
 
 		 554 aa  199  1.0000000000000001e-49  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0143761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3174  UvrD/REP helicase  28.8 
 
 		 557 aa  197  6e-49  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1675  UvrD/REP helicase family protein  43 
 
 		 212 aa  156  1e-36  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0387557  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.99 
 
 		 662 aa  123  9.999999999999999e-27  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06202  hypothetical protein  47.5 
 
 		 163 aa  118  3.9999999999999997e-25  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.84 
 
 		 659 aa  115  2.0000000000000002e-24  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  27.33 
 
 		 706 aa  115  3e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  23.43 
 
 		 721 aa  112  2.0000000000000002e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_917  predicted protein  24.77 
 
 		 657 aa  109  1e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.770015  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  22.68 
 
 		 720 aa  105  3e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0547  UvrD/REP helicase  23.2 
 
 		 741 aa  104  4e-21  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  22.83 
 
 		 720 aa  104  5e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  23.02 
 
 		 721 aa  103  9e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  22.5 
 
 		 749 aa  103  1e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  23.23 
 
 		 723 aa  102  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0398  UvrD/REP helicase  22.83 
 
 		 768 aa  102  3e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  23.02 
 
 		 722 aa  101  3e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  23.53 
 
 		 726 aa  101  4e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  23.02 
 
 		 722 aa  101  4e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0563  UvrD/REP helicase  22.34 
 
 		 743 aa  100  6e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0641932  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 724 aa  100  8e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1007  UvrD/REP helicase  28.96 
 
 		 738 aa  100  8e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0851  UvrD/REP helicase  24.53 
 
 		 1349 aa  99.8  1e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.98 
 
 		 741 aa  100  1e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1196  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.23 
 
 		 738 aa  99.4  2e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  22.98 
 
 		 739 aa  99.4  2e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.21 
 
 		 751 aa  99.4  2e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.77 
 
 		 731 aa  99  2e-19  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  23.23 
 
 		 721 aa  99.4  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0236  DNA-dependent helicase II  22.7 
 
 		 720 aa  98.6  3e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_979  UvrD/REP helicase  29.23 
 
 		 738 aa  98.6  3e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  23.29 
 
 		 743 aa  98.6  4e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  22.78 
 
 		 720 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  22.78 
 
 		 720 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.1 
 
 		 751 aa  97.8  6e-19  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  22.78 
 
 		 720 aa  97.4  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  22.78 
 
 		 720 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  22.78 
 
 		 720 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  22.78 
 
 		 720 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  22.78 
 
 		 720 aa  97.4  7e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  22.78 
 
 		 720 aa  97.4  7e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  22.78 
 
 		 720 aa  97.1  1e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.57 
 
 		 756 aa  96.7  1e-18  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  22.94 
 
 		 720 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  22.94 
 
 		 720 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  22.94 
 
 		 720 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  22.94 
 
 		 720 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  22.94 
 
 		 720 aa  95.9  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5601  UvrD/REP helicase  21.88 
 
 		 764 aa  95.5  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  27.08 
 
 		 724 aa  94.7  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2014  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.53 
 
 		 729 aa  94.7  5e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  26.37 
 
 		 723 aa  94.4  6e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  21.89 
 
 		 717 aa  93.6  9e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  29.51 
 
 		 721 aa  93.6  9e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3979  DNA-dependent helicase II  21.82 
 
 		 720 aa  93.2  1e-17  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0053327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 722 aa  92.8  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  27.3 
 
 		 722 aa  92.8  2e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  27.3 
 
 		 722 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0530  superfamily I DNA/RNA helicase  20.54 
 
 		 712 aa  92.8  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0453  DNA helicase II  23.54 
 
 		 735 aa  92.8  2e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.723252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.67 
 
 		 739 aa  92.4  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  27.3 
 
 		 722 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  28.71 
 
 		 727 aa  92.4  2e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.56 
 
 		 640 aa  92.8  2e-17  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  27.3 
 
 		 722 aa  92.4  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  22.7 
 
 		 765 aa  91.7  3e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  26.1 
 
 		 722 aa  91.7  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  22.34 
 
 		 722 aa  92  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0356  UvrD/Rep family helicase  22.67 
 
 		 630 aa  91.7  4e-17  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.190335  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  26.85 
 
 		 722 aa  91.7  4e-17  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  23.02 
 
 		 743 aa  91.3  5e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0300  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.33 
 
 		 677 aa  91.3  6e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  22.71 
 
 		 721 aa  90.9  7e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0716  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.06 
 
 		 685 aa  90.9  7e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2961  ATP-dependent DNA helicase  27.08 
 
 		 678 aa  89.7  1e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.26035  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2219  UvrD/REP helicase  22.36 
 
 		 739 aa  90.1  1e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  24.87 
 
 		 721 aa  90.1  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  22.71 
 
 		 721 aa  89.4  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  26.61 
 
 		 825 aa  89.4  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.16 
 
 		 658 aa  89.4  2e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0187  DNA-dependent helicase II  27.48 
 
 		 720 aa  88.6  3e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.276236  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  27.18 
 
 		 666 aa  89  3e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2813  UvrD/REP helicase  28.08 
 
 		 754 aa  88.6  3e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0035  DNA-dependent helicase II  24.55 
 
 		 723 aa  88.2  4e-16  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.193678  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  21.73 
 
 		 817 aa  88.2  4e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0254  UvrD/REP helicase  25.12 
 
 		 742 aa  88.2  4e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.016007  decreased coverage  0.00234339 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  22.81 
 
 		 648 aa  87.8  5e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  24.55 
 
 		 723 aa  88.2  5e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  22.81 
 
 		 648 aa  87.8  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>