More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0507 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008346  Swol_0507  UvrD/REP helicase family protein  100 
 
 		 421 aa  860    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3526  hypothetical protein  52.66 
 
 		 617 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.396406  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0195  UvrD/REP helicase family protein  48.09 
 
 		 614 aa  399  9.999999999999999e-111  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0047  UvrD/REP helicase family protein  40.1 
 
 		 634 aa  279  7e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1603  UvrD/REP helicase  33.25 
 
 		 641 aa  211  1e-53  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3192  UvrD/REP helicase  31.99 
 
 		 615 aa  194  3e-48  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2560  UvrD/REP helicase  30.36 
 
 		 553 aa  168  1e-40  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.232934 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4275  UvrD/REP helicase  29.9 
 
 		 554 aa  161  3e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0143761  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2953  UvrD/REP helicase  27.69 
 
 		 615 aa  158  2e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3174  UvrD/REP helicase  30.2 
 
 		 557 aa  157  2e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4279  UvrD/REP helicase  28.68 
 
 		 556 aa  155  9e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4419  UvrD/REP helicase  28.68 
 
 		 556 aa  154  4e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3681  helicase, putative  30.08 
 
 		 552 aa  145  1e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0348  DNA helicase  25.62 
 
 		 698 aa  80.5  0.00000000000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00900686  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  23.31 
 
 		 706 aa  79.7  0.00000000000008  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0849  UvrD/REP helicase  26.39 
 
 		 845 aa  79.7  0.0000000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.462782  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  25.12 
 
 		 722 aa  78.2  0.0000000000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl566  repair endonuclease ATP-dependent DNA helicase  24.21 
 
 		 723 aa  76.3  0.000000000001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000546872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  24.19 
 
 		 666 aa  75.5  0.000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0903  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.04 
 
 		 662 aa  74.7  0.000000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000149159  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.5 
 
 		 673 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.5 
 
 		 673 aa  74.3  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.5 
 
 		 673 aa  73.9  0.000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.06 
 
 		 748 aa  72.8  0.00000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0064  UDP-N-acetylglucosamine 1-carboxyvinyltransferase  23.85 
 
 		 689 aa  72  0.00000000002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0113  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.71 
 
 		 669 aa  70.9  0.00000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  22.33 
 
 		 655 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3788  UvrD/REP helicase  23.53 
 
 		 755 aa  70.5  0.00000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0689  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 816 aa  70.5  0.00000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.723035  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0794  UvrD/REP helicase  22.54 
 
 		 735 aa  70.1  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3773  UvrD/REP helicase  25.63 
 
 		 787 aa  69.7  0.00000000009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  28.99 
 
 		 1016 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.77 
 
 		 675 aa  68.6  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6070  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.17 
 
 		 706 aa  68.2  0.0000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0075  ATP-dependent DNA helicase RepA  24.71 
 
 		 669 aa  67.8  0.0000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.688079  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0363  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.66 
 
 		 731 aa  67.8  0.0000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0670143 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  25.29 
 
 		 705 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2822  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 826 aa  67.8  0.0000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.467404 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  23.57 
 
 		 706 aa  67.8  0.0000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69910  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.94 
 
 		 669 aa  67.4  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1682  UvrD/REP helicase  22.86 
 
 		 743 aa  67.8  0.0000000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0462  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.57 
 
 		 672 aa  67  0.0000000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.15 
 
 		 756 aa  66.6  0.0000000009  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  23.25 
 
 		 731 aa  66.2  0.0000000009  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1426  UvrD/REP helicase  27.05 
 
 		 817 aa  65.9  0.000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.854677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0080  DNA helicase II  25.4 
 
 		 721 aa  66.2  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1285  UvrD/REP helicase  23.53 
 
 		 714 aa  66.2  0.000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000916129  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_3023  UvrD/REP helicase  25.75 
 
 		 706 aa  65.1  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  23.9 
 
 		 745 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5519  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.83 
 
 		 669 aa  65.5  0.000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277049 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2563  UvrD/REP helicase  25.23 
 
 		 825 aa  65.1  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.309285  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2571  DNA-dependent helicase II  23.86 
 
 		 723 aa  65.1  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  24.84 
 
 		 725 aa  64.7  0.000000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  31.52 
 
 		 787 aa  64.7  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2235  DNA helicase II protein  25.38 
 
 		 829 aa  63.5  0.000000006  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0253  ATP-dependent DNA helicase Rep  23.92 
 
 		 669 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  29.38 
 
 		 742 aa  63.5  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.52 
 
 		 658 aa  63.2  0.000000008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1172  UvrD/REP helicase  37.37 
 
 		 1128 aa  62.4  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0506148  normal  0.313669 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2059  ATP-dependent DNA helicase Rep  32.12 
 
 		 763 aa  62.8  0.00000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.439478  normal  0.531774 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  22.06 
 
 		 648 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  22.06 
 
 		 648 aa  62  0.00000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0546  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.87 
 
 		 713 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0712  UvrD/REP helicase  36.7 
 
 		 1103 aa  62  0.00000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0437  UvrD/REP helicase  24.65 
 
 		 682 aa  62  0.00000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  29.24 
 
 		 724 aa  62  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0572  UvrD/REP helicase  23.06 
 
 		 677 aa  61.6  0.00000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_11370  DNA/RNA helicase, superfamily I  31.38 
 
 		 1094 aa  62  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.976622  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  31.06 
 
 		 804 aa  62  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2901  UvrD/REP helicase  34.09 
 
 		 1136 aa  61.2  0.00000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0570587  normal  0.095819 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0322  UvrD/REP helicase  25.11 
 
 		 795 aa  61.6  0.00000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2836  DNA helicase II  25.22 
 
 		 858 aa  61.6  0.00000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0375  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.22 
 
 		 763 aa  61.6  0.00000003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4951  UvrD/REP helicase  25.11 
 
 		 797 aa  61.2  0.00000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.120082  decreased coverage  0.0000000995546 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0218  UvrD/REP helicase  27.95 
 
 		 728 aa  61.2  0.00000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.82 
 
 		 932 aa  60.8  0.00000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1325  UvrD/REP helicase  23.46 
 
 		 678 aa  60.8  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00634324  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2179  UvrD/REP helicase  25.65 
 
 		 809 aa  60.8  0.00000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.577747  normal  0.847748 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2812  UvrD/REP helicase  24.94 
 
 		 719 aa  60.8  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4584  UvrD/REP helicase  33 
 
 		 1041 aa  60.8  0.00000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.446149  normal  0.423836 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  34.58 
 
 		 677 aa  60.5  0.00000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.59 
 
 		 659 aa  60.8  0.00000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.88 
 
 		 732 aa  60.8  0.00000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1437  UvrD/REP helicase  25.93 
 
 		 769 aa  60.5  0.00000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.618729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.79 
 
 		 658 aa  59.7  0.00000009  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7807  UvrD/REP helicase  29.3 
 
 		 1124 aa  59.7  0.00000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2348  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.5 
 
 		 730 aa  59.7  0.00000009  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0164573  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1038  ATP-dependent DNA helicase UvrD/PcrA/Rep family  24.12 
 
 		 765 aa  58.9  0.0000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000499777 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2335  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.95 
 
 		 745 aa  59.7  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000479464  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  28.57 
 
 		 727 aa  59.3  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  28.57 
 
 		 727 aa  59.7  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1808  UvrD/REP helicase  23.96 
 
 		 725 aa  58.9  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3799  UvrD/REP helicase  31.37 
 
 		 1130 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0121759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0926  UvrD/REP helicase  30.51 
 
 		 1088 aa  59.3  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  22.76 
 
 		 669 aa  58.2  0.0000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1847  DNA helicase II  31.18 
 
 		 787 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.478149  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3138  UvrD/REP helicase  29.88 
 
 		 689 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.527942  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1415  DNA helicase II  22.63 
 
 		 743 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1692  DNA helicase II  31.18 
 
 		 787 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3865  UvrD/REP helicase  29.88 
 
 		 689 aa  58.5  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.322714 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>