More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_3192 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_3192  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 615 aa  1281    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0621429 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1603  UvrD/REP helicase  42.61 
 
 		 641 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2953  UvrD/REP helicase  35.14 
 
 		 615 aa  333  6e-90  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0047  UvrD/REP helicase family protein  33.33 
 
 		 634 aa  330  5.0000000000000004e-89  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0195  UvrD/REP helicase family protein  36.12 
 
 		 614 aa  322  9.999999999999999e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3174  UvrD/REP helicase  32.28 
 
 		 557 aa  306  6e-82  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.938492  unclonable  0.0000000000000324964 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3526  hypothetical protein  32.1 
 
 		 617 aa  302  1e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.396406  normal  1 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4275  UvrD/REP helicase  33.1 
 
 		 554 aa  298  2e-79  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0143761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2560  UvrD/REP helicase  31.53 
 
 		 553 aa  296  9e-79  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.232934 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3681  helicase, putative  31.56 
 
 		 552 aa  295  2e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.791234  normal  0.0479294 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4279  UvrD/REP helicase  31.27 
 
 		 556 aa  291  3e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4419  UvrD/REP helicase  31.27 
 
 		 556 aa  289  1e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0507  UvrD/REP helicase family protein  31.99 
 
 		 421 aa  194  4e-48  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1675  UvrD/REP helicase family protein  40.59 
 
 		 212 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0387557  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06202  hypothetical protein  52.94 
 
 		 163 aa  129  1.0000000000000001e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0241  UvrD/REP helicase  24.26 
 
 		 706 aa  117  6e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.48 
 
 		 785 aa  116  1.0000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  25.04 
 
 		 731 aa  116  1.0000000000000001e-24  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0502  UvrD/REP helicase  24.92 
 
 		 620 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00483  ATP-dependent DNA helicase  25.16 
 
 		 671 aa  113  8.000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0717  ATP-dependent DNA helicase pcrA  24.65 
 
 		 722 aa  112  2.0000000000000002e-23  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0979617  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.18 
 
 		 741 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1807  DNA-dependent helicase II  23.23 
 
 		 721 aa  108  2e-22  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1554  ATP-dependent DNA helicase II  21.83 
 
 		 749 aa  108  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2246  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.04 
 
 		 751 aa  109  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.453558  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2542  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.04 
 
 		 751 aa  108  3e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1806  DNA-dependent helicase II  23.08 
 
 		 721 aa  107  5e-22  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0719  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.49 
 
 		 670 aa  107  5e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1581  UvrD/REP helicase  23.53 
 
 		 648 aa  107  9e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1532  UvrD/REP helicase  23.53 
 
 		 648 aa  107  9e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0217049  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0864  ATP-dependent DNA helicase UvrD  23.24 
 
 		 786 aa  106  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1786  UvrD/REP helicase  23.36 
 
 		 753 aa  105  2e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.150063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00200  DNA helicase II  25.63 
 
 		 723 aa  105  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.105669  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  23.14 
 
 		 735 aa  105  2e-21  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3764  DNA-dependent helicase II  22.51 
 
 		 724 aa  105  2e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03620  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.38 
 
 		 640 aa  105  2e-21  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0211  UvrD/REP helicase  24.44 
 
 		 760 aa  105  2e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0344755 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0748  UvrD/REP helicase  24.02 
 
 		 653 aa  105  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00311747  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  26.22 
 
 		 722 aa  103  6e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.96 
 
 		 732 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3101  DNA helicase II  22.58 
 
 		 709 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.546852  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2699  UvrD/REP helicase  22.58 
 
 		 709 aa  103  7e-21  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.506078  hitchhiker  0.00000113903 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0943  UvrD/REP helicase  23.27 
 
 		 684 aa  103  7e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0212  UvrD/REP helicase  30.48 
 
 		 677 aa  103  1e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2149  DNA-dependent helicase II  22.15 
 
 		 723 aa  103  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0743865  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0426  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.45 
 
 		 748 aa  103  1e-20  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  25.44 
 
 		 721 aa  103  1e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  23.49 
 
 		 706 aa  102  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.98 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.98 
 
 		 730 aa  102  2e-20  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6513  ATP-dependent DNA helicase PcrA  24.13 
 
 		 781 aa  101  3e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  22.75 
 
 		 788 aa  102  3e-20  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3373  DNA-dependent helicase II  25.14 
 
 		 722 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4444  UvrD/REP helicase  26.21 
 
 		 737 aa  101  4e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.805765  normal  0.0453578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  101  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  101  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  26.62 
 
 		 720 aa  101  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  101  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  101  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  101  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  101  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  25.68 
 
 		 727 aa  101  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  101  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0050  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.1 
 
 		 658 aa  100  6e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0153579  normal  0.502615 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2143  ATP-dependent DNA helicase Rep  25.95 
 
 		 658 aa  100  7e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  27.62 
 
 		 721 aa  100  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3642  DNA-dependent helicase II  23.53 
 
 		 726 aa  100  9e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0621  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.12 
 
 		 659 aa  100  1e-19  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.12705  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  25.71 
 
 		 722 aa  100  1e-19  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  26.74 
 
 		 726 aa  99.8  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  25.71 
 
 		 722 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0467  DNA-dependent helicase II  25.71 
 
 		 722 aa  99.4  2e-19  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  25.71 
 
 		 722 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  25.71 
 
 		 722 aa  99.4  2e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1460  UvrD/REP helicase  23.19 
 
 		 804 aa  99.4  2e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.373759  normal  0.271729 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0599  DNA-dependent helicase II  23.03 
 
 		 717 aa  99  3e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0683  UvrD/REP helicase  22.22 
 
 		 669 aa  98.6  3e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0473  DNA-dependent helicase II  25.71 
 
 		 722 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3558  DNA-dependent helicase II  26 
 
 		 722 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.231339  normal  0.569551 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2070  UvrD/REP helicase  24.58 
 
 		 789 aa  98.6  3e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.535098  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0222  DNA-dependent helicase II  25.45 
 
 		 734 aa  98.6  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.211627  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0469  DNA-dependent helicase II  25.71 
 
 		 722 aa  98.6  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.154526  normal  0.949387 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0186  DNA-dependent helicase II  25.86 
 
 		 723 aa  98.2  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0360  ATP-dependent DNA helicase Rep  24.14 
 
 		 671 aa  98.2  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.69251  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2424  UvrD/REP helicase  25.36 
 
 		 725 aa  98.2  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2706  UvrD/REP helicase  24.37 
 
 		 704 aa  97.8  5e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.341733 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4158  UvrD/REP helicase  22.9 
 
 		 668 aa  97.8  5e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140406 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0787  UvrD/REP helicase  24.17 
 
 		 800 aa  97.8  5e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.82156  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0745  UvrD/REP helicase  23.92 
 
 		 655 aa  97.8  5e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0796  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 706 aa  97.8  6e-19  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.573798  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  26.62 
 
 		 720 aa  97.4  7e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001978  ATP-dependent DNA helicase Rep  28.08 
 
 		 671 aa  97.1  8e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0682973  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3271  ATP-dependent DNA helicase UvrD  25.51 
 
 		 739 aa  97.1  8e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0184  ATP-dependent DNA helicase Rep  22.2 
 
 		 672 aa  96.7  1e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0757  ATP-dependent DNA helicase PcrA  22.17 
 
 		 773 aa  96.7  1e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.476102  hitchhiker  0.0068011 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>