More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1841 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0061  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 946 aa  1951    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.147591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1841  UvrD/REP helicase  100 
 
 		 946 aa  1951    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.716843  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6683  UvrD/REP helicase  26.8 
 
 		 966 aa  268  2e-70  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0759039  normal  0.87543 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1666  UvrD/REP helicase  25.46 
 
 		 921 aa  263  2e-68  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.921097  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1482  UvrD/REP helicase  25.48 
 
 		 911 aa  248  3e-64  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0495505  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1443  superfamily I DNA/RNA helicase  25.2 
 
 		 920 aa  248  4.9999999999999997e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  unclonable  0.000000114812  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0373  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.51 
 
 		 785 aa  241  5e-62  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1516  superfamily I DNA/RNA helicase  29.34 
 
 		 757 aa  233  1e-59  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.476962 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1236  ATP-dependent DNA helicase  28.31 
 
 		 762 aa  229  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000243154 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1202  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.38 
 
 		 690 aa  228  6e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0964  UvrD/REP helicase  29.29 
 
 		 735 aa  227  6e-58  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0930  UvrD/REP helicase  26.34 
 
 		 932 aa  227  7e-58  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0490168  normal  0.240502 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4207  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.78 
 
 		 794 aa  225  3e-57  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00114882 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0249  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 663 aa  223  9e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.000268408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2876  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.76 
 
 		 741 aa  223  9.999999999999999e-57  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.87 
 
 		 742 aa  222  1.9999999999999999e-56  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0652  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.34 
 
 		 786 aa  221  3.9999999999999997e-56  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.782155  normal  0.523807 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1142  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.87 
 
 		 759 aa  221  6e-56  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00645373  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0523  putative ATP-dependent DNA helicase  25.08 
 
 		 1044 aa  221  6e-56  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02290  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.25 
 
 		 715 aa  221  6e-56  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000712312  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0484  DNA-dependent helicase II  27.71 
 
 		 722 aa  221  6e-56  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2355  UvrD/REP helicase  28.18 
 
 		 724 aa  219  2e-55  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.0000000607129  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4079  DNA helicase II  26.82 
 
 		 724 aa  218  4e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6025  UvrD/REP helicase  27.68 
 
 		 787 aa  217  7e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3817  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.87 
 
 		 795 aa  217  9e-55  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.558809  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3411  ATP-dependent DNA helicase PcrA, putative  27.45 
 
 		 739 aa  217  9.999999999999999e-55  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3879  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.13 
 
 		 663 aa  215  2.9999999999999995e-54  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0270  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.37 
 
 		 732 aa  215  2.9999999999999995e-54  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4513  DNA-dependent helicase II  27.36 
 
 		 727 aa  215  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3385  DNA-dependent helicase II  26.85 
 
 		 726 aa  214  5.999999999999999e-54  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0080  DNA-dependent helicase II  26.1 
 
 		 724 aa  213  9e-54  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1937  UvrD/REP helicase  29.06 
 
 		 726 aa  213  1e-53  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3397  DNA-dependent helicase II  27.3 
 
 		 727 aa  213  1e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0151  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.34 
 
 		 674 aa  213  1e-53  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4498  DNA-dependent helicase II  27.52 
 
 		 721 aa  213  2e-53  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0025295  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0199  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.94 
 
 		 674 aa  213  2e-53  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4207  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.78 
 
 		 673 aa  212  2e-53  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0982  UvrD/REP helicase  28.22 
 
 		 731 aa  213  2e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.158215  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1911  UvrD/REP helicase  29.17 
 
 		 742 aa  212  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.306722  normal  0.156803 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3971  DNA-dependent helicase II  26.43 
 
 		 720 aa  212  3e-53  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0156  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.16 
 
 		 674 aa  212  3e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.156092 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5516  DNA helicase II  27.07 
 
 		 727 aa  211  4e-53  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0468  DNA-dependent helicase II  27.12 
 
 		 721 aa  211  4e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000657213  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1146  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.51 
 
 		 725 aa  211  4e-53  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0097  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.07 
 
 		 797 aa  211  6e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.07 
 
 		 837 aa  210  1e-52  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2295  UvrD/REP helicase  27.44 
 
 		 666 aa  210  1e-52  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4015  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.54 
 
 		 675 aa  210  1e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1443  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.64 
 
 		 729 aa  209  2e-52  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.520259  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0175  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.57 
 
 		 673 aa  209  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0507  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.57 
 
 		 673 aa  209  2e-52  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0177061  normal  0.0105879 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4038  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.57 
 
 		 673 aa  209  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0115  UvrD/REP helicase  28.47 
 
 		 797 aa  208  3e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2539  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.35 
 
 		 858 aa  208  3e-52  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.676904  normal  0.762866 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4430  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.02 
 
 		 765 aa  209  3e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1619  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.53 
 
 		 718 aa  209  3e-52  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4007  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.73 
 
 		 673 aa  208  3e-52  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00646067 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4326  UvrD/REP helicase  27.17 
 
 		 744 aa  208  4e-52  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0144266  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4162  DNA-dependent helicase II  26.41 
 
 		 720 aa  208  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0353617  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1994  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.5 
 
 		 730 aa  208  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1960  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.5 
 
 		 730 aa  208  5e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4332  DNA-dependent helicase II  26 
 
 		 720 aa  207  6e-52  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03689  DNA-dependent ATPase I and helicase II  26 
 
 		 720 aa  207  9e-52  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5252  DNA-dependent helicase II  26 
 
 		 720 aa  207  9e-52  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03638  hypothetical protein  26 
 
 		 720 aa  207  9e-52  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4179  DNA-dependent helicase II  26 
 
 		 720 aa  207  9e-52  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.654606  normal  0.0232596 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4166  DNA helicase II  26 
 
 		 720 aa  207  1e-51  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4038  DNA-dependent helicase II  26 
 
 		 720 aa  206  1e-51  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4273  DNA-dependent helicase II  26 
 
 		 720 aa  207  1e-51  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4194  DNA-dependent helicase II  26 
 
 		 720 aa  206  1e-51  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.452287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0467  DNA-dependent helicase II  28.15 
 
 		 721 aa  206  1e-51  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2024  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.36 
 
 		 814 aa  206  2e-51  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.260389  normal  0.212402 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1222  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.49 
 
 		 758 aa  206  2e-51  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0994  superfamily I DNA/RNA helicase  27.87 
 
 		 770 aa  206  2e-51  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0419  DNA-dependent helicase II  26.29 
 
 		 721 aa  206  2e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.590239  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5065  DNA-dependent helicase II  26.9 
 
 		 727 aa  205  3e-51  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07720  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.4 
 
 		 831 aa  205  3e-51  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0752204  normal  0.673824 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4015  DNA-dependent helicase II  26.47 
 
 		 722 aa  205  3e-51  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2863  ATP-dependent DNA helicase UvrD  26.45 
 
 		 725 aa  205  4e-51  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3818  DNA-dependent helicase II  26.47 
 
 		 722 aa  205  4e-51  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3892  DNA-dependent helicase II  26.47 
 
 		 722 aa  205  4e-51  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4124  ATP-dependent DNA helicase Rep  26.15 
 
 		 707 aa  204  4e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0441  DNA-dependent helicase II  26.47 
 
 		 722 aa  205  4e-51  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.419194  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1092  UvrD/REP helicase  28.15 
 
 		 707 aa  204  5e-51  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0037216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5644  DNA-dependent helicase II  26.75 
 
 		 727 aa  204  5e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0598838 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0104  UvrD/REP helicase  28.17 
 
 		 797 aa  204  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  26.96 
 
 		 705 aa  204  6e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0351  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.22 
 
 		 753 aa  204  7e-51  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1352  UvrD/REP helicase  27.09 
 
 		 807 aa  204  7e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4161  DNA-dependent helicase II  25.71 
 
 		 720 aa  204  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4180  DNA-dependent helicase II  25.71 
 
 		 720 aa  204  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.328302  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4231  DNA-dependent helicase II  25.71 
 
 		 720 aa  204  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4279  DNA-dependent helicase II  25.71 
 
 		 720 aa  204  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4338  DNA-dependent helicase II  25.71 
 
 		 720 aa  204  8e-51  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0146  UvrD/REP helicase  26.09 
 
 		 721 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.728084  normal  0.499392 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0682  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.71 
 
 		 756 aa  203  9.999999999999999e-51  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0445546  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1219  UvrD/REP helicase  27.56 
 
 		 706 aa  202  1.9999999999999998e-50  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.868419  normal  0.377243 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0389  UvrD/REP helicase  27.51 
 
 		 759 aa  202  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.335066 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0096  UvrD/REP helicase  26.69 
 
 		 735 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.60003  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0209  DNA-dependent helicase II  25.94 
 
 		 720 aa  202  1.9999999999999998e-50  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>